More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3712 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3027  DNA mismatch repair protein  59.69 
 
 		 650 aa  750    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0173835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3282  DNA mismatch repair protein  79.53 
 
 		 641 aa  1032    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.645074  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0601  DNA mismatch repair protein  78.65 
 
 		 631 aa  1012    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3712  DNA mismatch repair protein  100 
 
 		 637 aa  1305    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3895  DNA mismatch repair protein  98.9 
 
 		 638 aa  1289    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.329435  normal  0.756046 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4172  DNA mismatch repair protein  63.92 
 
 		 614 aa  762    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0795  DNA mismatch repair protein  62.15 
 
 		 624 aa  752    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.741444  hitchhiker  0.00456525 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3207  DNA mismatch repair protein  59.67 
 
 		 665 aa  747    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000351816  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0564  DNA mismatch repair protein  61.65 
 
 		 631 aa  766    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.273606 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3542  DNA mismatch repair protein  59.02 
 
 		 628 aa  741    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3769  DNA mismatch repair protein  95.45 
 
 		 630 aa  1237    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00256823  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0556  DNA mismatch repair protein  98.74 
 
 		 638 aa  1289    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000137773  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0596  DNA mismatch repair protein  78.27 
 
 		 644 aa  1014    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0279132  decreased coverage  0.0000000183924 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3434  DNA mismatch repair protein  78.33 
 
 		 644 aa  1009    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0482547  normal  0.130022 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3313  DNA mismatch repair protein  62.11 
 
 		 619 aa  764    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0595  DNA mismatch repair protein  76.89 
 
 		 648 aa  1009    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000232497 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0429  DNA mismatch repair protein  47.09 
 
 		 624 aa  504  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000237281  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3655  DNA mismatch repair protein  46 
 
 		 635 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0128216  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4777  DNA mismatch repair protein  48.76 
 
 		 618 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00171491  normal  0.0289843 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0701  DNA mismatch repair protein  47.52 
 
 		 635 aa  501  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.138509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3801  DNA mismatch repair protein  47.04 
 
 		 635 aa  500  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4627  DNA mismatch repair protein  48.43 
 
 		 618 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4637  DNA mismatch repair protein  47.96 
 
 		 618 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000512951  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3921  DNA mismatch repair protein  46.98 
 
 		 661 aa  496  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0286731  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4720  DNA mismatch repair protein  47.5 
 
 		 618 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4756  DNA mismatch repair protein  47.5 
 
 		 618 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04037  DNA mismatch repair protein  47.47 
 
 		 615 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0484513  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3823  DNA mismatch repair protein MutL  47.47 
 
 		 615 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000414583  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4412  DNA mismatch repair protein  47.47 
 
 		 615 aa  495  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0194282  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3723  DNA mismatch repair protein  44.61 
 
 		 669 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0150049  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4728  DNA mismatch repair protein  47.47 
 
 		 615 aa  495  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0929403  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0353  DNA mismatch repair protein  45.47 
 
 		 613 aa  495  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.114284  hitchhiker  0.00160708 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2779  DNA mismatch repair protein  45.85 
 
 		 652 aa  494  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3843  DNA mismatch repair protein  46.82 
 
 		 615 aa  491  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000795964  hitchhiker  0.000000387336 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4641  DNA mismatch repair protein  46.66 
 
 		 615 aa  489  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.231193  normal  0.0766044 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4701  DNA mismatch repair protein  46.82 
 
 		 615 aa  490  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915673  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5686  DNA mismatch repair protein  46.59 
 
 		 615 aa  487  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000161678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002257  DNA mismatch repair protein MutL  43.66 
 
 		 670 aa  486  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.558957  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2756  DNA mismatch repair protein  48.55 
 
 		 653 aa  488  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00096  DNA mismatch repair protein  45.1 
 
 		 681 aa  483  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0490  DNA mismatch repair protein  46 
 
 		 649 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00424491  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0533  DNA mismatch repair protein  45.69 
 
 		 629 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000857622  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3240  DNA mismatch repair protein MutL  44.33 
 
 		 628 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3976  DNA mismatch repair protein MutL  43.43 
 
 		 639 aa  442  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1083  DNA mismatch repair protein  61.09 
 
 		 615 aa  442  9.999999999999999e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0323  DNA mismatch repair protein MutL  62.35 
 
 		 652 aa  430  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  43.15 
 
 		 633 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  43.15 
 
 		 633 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  41.46 
 
 		 633 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  43.15 
 
 		 623 aa  409  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  40.78 
 
 		 632 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  41.29 
 
 		 632 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  42.32 
 
 		 633 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00647  DNA mismatch repair protein  45.42 
 
 		 608 aa  402  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.893353  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  43.08 
 
 		 629 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  41.92 
 
 		 648 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  41.94 
 
 		 635 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  41.77 
 
 		 645 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  41.99 
 
 		 641 aa  395  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  41.55 
 
 		 630 aa  388  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0584  DNA mismatch repair protein MutL  53.29 
 
 		 602 aa  388  1e-106  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.969564  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  56.88 
 
 		 641 aa  383  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  56.62 
 
 		 611 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  40.82 
 
 		 611 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  39.9 
 
 		 625 aa  363  7.0000000000000005e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  53.52 
 
 		 636 aa  357  5e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  54.88 
 
 		 644 aa  355  1e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2754  DNA mismatch repair protein  53.52 
 
 		 634 aa  346  8e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  51.06 
 
 		 630 aa  343  5e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  48.28 
 
 		 619 aa  335  1e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  51.96 
 
 		 621 aa  335  1e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  51.22 
 
 		 620 aa  330  5.0000000000000004e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  50.46 
 
 		 626 aa  323  6e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  39.01 
 
 		 652 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  36.96 
 
 		 616 aa  319  7.999999999999999e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0336  DNA mismatch repair protein  49.54 
 
 		 583 aa  318  2e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00211885  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  51.83 
 
 		 667 aa  316  7e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  51.83 
 
 		 667 aa  316  7e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  52.13 
 
 		 661 aa  316  9e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0734  DNA mismatch repair protein  51.83 
 
 		 667 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2015  DNA mismatch repair protein MutL  46.71 
 
 		 617 aa  315  9.999999999999999e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  51.83 
 
 		 661 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  51.35 
 
 		 655 aa  313  4.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  51.22 
 
 		 661 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  51.05 
 
 		 636 aa  310  5.9999999999999995e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  50.91 
 
 		 662 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  48.85 
 
 		 635 aa  307  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  50.45 
 
 		 647 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  48.96 
 
 		 574 aa  306  5.0000000000000004e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3934  DNA mismatch repair protein  51.52 
 
 		 688 aa  306  7e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000834702 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  48.66 
 
 		 575 aa  306  8.000000000000001e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  37.01 
 
 		 691 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  37.88 
 
 		 705 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  48.32 
 
 		 613 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0750  DNA mismatch repair protein  50.91 
 
 		 687 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.536316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  35.31 
 
 		 628 aa  304  4.0000000000000003e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  37.29 
 
 		 684 aa  303  9e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  37.29 
 
 		 684 aa  303  9e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3297  DNA mismatch repair protein  37.29 
 
 		 684 aa  303  9e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365803  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  37.29 
 
 		 684 aa  303  9e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>