More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3934 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A1085  DNA mismatch repair protein  81.5 
 
 		 684 aa  1093    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  63.97 
 
 		 636 aa  813    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  81.5 
 
 		 684 aa  1093    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  82.99 
 
 		 691 aa  1109    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  83.87 
 
 		 661 aa  1077    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  81.5 
 
 		 684 aa  1093    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  63.1 
 
 		 652 aa  816    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  84.17 
 
 		 662 aa  1066    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  80.36 
 
 		 681 aa  1094    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  84.83 
 
 		 661 aa  1093    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  80.74 
 
 		 705 aa  1088    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  63.24 
 
 		 647 aa  806    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0734  DNA mismatch repair protein  84.67 
 
 		 667 aa  1085    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3934  DNA mismatch repair protein  100 
 
 		 688 aa  1388    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000834702 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  62.32 
 
 		 635 aa  797    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  62.99 
 
 		 655 aa  786    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  84.85 
 
 		 667 aa  1086    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  81.5 
 
 		 684 aa  1093    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0750  DNA mismatch repair protein  94.63 
 
 		 687 aa  1232    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.536316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  83.71 
 
 		 661 aa  1078    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  81.53 
 
 		 681 aa  1092    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3297  DNA mismatch repair protein  81.5 
 
 		 684 aa  1093    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365803  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  84.85 
 
 		 667 aa  1086    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  51.35 
 
 		 613 aa  623  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  49.48 
 
 		 616 aa  619  1e-176  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  52.2 
 
 		 628 aa  596  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  49.49 
 
 		 660 aa  585  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  48.94 
 
 		 604 aa  568  1e-160  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  49.1 
 
 		 625 aa  559  1e-158  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  47.9 
 
 		 648 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  48.27 
 
 		 632 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  48.05 
 
 		 645 aa  551  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  48.12 
 
 		 632 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  48.57 
 
 		 633 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  47.75 
 
 		 629 aa  545  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  47.52 
 
 		 623 aa  548  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  47.83 
 
 		 635 aa  542  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  43.9 
 
 		 641 aa  533  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  45.24 
 
 		 630 aa  531  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  46.76 
 
 		 621 aa  513  1e-144  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  46.71 
 
 		 619 aa  510  1e-143  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  44.56 
 
 		 611 aa  499  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2015  DNA mismatch repair protein MutL  44.03 
 
 		 617 aa  467  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  38.29 
 
 		 630 aa  428  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  41.1 
 
 		 643 aa  425  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  40.03 
 
 		 594 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1125  DNA mismatch repair protein MutL  63.66 
 
 		 651 aa  416  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  40.96 
 
 		 643 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  40.57 
 
 		 603 aa  416  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0978  DNA mismatch repair protein MutL  57.64 
 
 		 657 aa  397  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  38.12 
 
 		 603 aa  397  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4225  DNA mismatch repair protein MutL  59.35 
 
 		 687 aa  393  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.724774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0893  DNA mismatch repair protein MutL  57.35 
 
 		 657 aa  395  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  38.22 
 
 		 617 aa  393  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  61.23 
 
 		 615 aa  392  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  59.1 
 
 		 622 aa  392  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  37.14 
 
 		 600 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  58.84 
 
 		 635 aa  392  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1300  DNA mismatch repair protein MutL  57.1 
 
 		 698 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0863563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  39.09 
 
 		 606 aa  392  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  37.52 
 
 		 600 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  38.86 
 
 		 661 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  36.86 
 
 		 628 aa  383  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  37.87 
 
 		 626 aa  385  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5131  DNA mismatch repair protein MutL  58.59 
 
 		 674 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  36.93 
 
 		 620 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  37.95 
 
 		 623 aa  381  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  37.95 
 
 		 623 aa  381  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1011  DNA mismatch repair protein MutL  37.28 
 
 		 637 aa  381  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.266056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  39.56 
 
 		 621 aa  379  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  38.59 
 
 		 605 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4780  DNA mismatch repair protein MutL  39.85 
 
 		 671 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.131576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  38.43 
 
 		 687 aa  376  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0884  DNA mismatch repair protein  33.58 
 
 		 673 aa  373  1e-102  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.277202  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  37.97 
 
 		 601 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3308  DNA mismatch repair protein MutL  52.63 
 
 		 664 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  55.39 
 
 		 644 aa  372  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  37.13 
 
 		 648 aa  366  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  33.94 
 
 		 626 aa  363  4e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  57.59 
 
 		 598 aa  359  9e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  37.37 
 
 		 607 aa  356  6.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  34.59 
 
 		 626 aa  355  1e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0533  DNA mismatch repair protein  39.47 
 
 		 629 aa  355  2e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000857622  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  56.71 
 
 		 633 aa  352  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  56.27 
 
 		 641 aa  349  9e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  31.93 
 
 		 623 aa  349  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5569  DNA mismatch repair protein MutL  33.53 
 
 		 685 aa  345  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.590077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2779  DNA mismatch repair protein  34.93 
 
 		 652 aa  345  2e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  32.64 
 
 		 644 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0490  DNA mismatch repair protein  37.58 
 
 		 649 aa  343  4e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00424491  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  54.49 
 
 		 633 aa  343  4e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  54.13 
 
 		 633 aa  342  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  55.18 
 
 		 611 aa  340  7e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3723  DNA mismatch repair protein  37.01 
 
 		 669 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0150049  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  31.63 
 
 		 628 aa  337  5.999999999999999e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3921  DNA mismatch repair protein  36 
 
 		 661 aa  333  5e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0286731  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  53.07 
 
 		 626 aa  333  5e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  30.96 
 
 		 610 aa  332  1e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  31.16 
 
 		 624 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1083  DNA mismatch repair protein  49.7 
 
 		 615 aa  326  1e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>