More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3464 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3464  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 692 aa  1399    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2458  DNA mismatch repair protein MutL  55.01 
 
 		 711 aa  680    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.593809 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1729  DNA mismatch repair protein MutL  54.53 
 
 		 763 aa  697    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2319  DNA mismatch repair protein MutL  47.27 
 
 		 739 aa  568  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1087  DNA mismatch repair protein MutL  39.26 
 
 		 582 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0917186  normal  0.0241297 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0267  DNA mismatch repair protein MutL  52.2 
 
 		 610 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  38.92 
 
 		 705 aa  336  7.999999999999999e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  32.25 
 
 		 668 aa  318  3e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3934  DNA mismatch repair protein  36.91 
 
 		 688 aa  316  7e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000834702 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  33.72 
 
 		 628 aa  316  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  35.55 
 
 		 652 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  33.1 
 
 		 630 aa  315  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  33.71 
 
 		 647 aa  314  3.9999999999999997e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1359  DNA mismatch repair protein  30.39 
 
 		 674 aa  313  9e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  36.03 
 
 		 661 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  30.82 
 
 		 648 aa  311  2e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  35.03 
 
 		 636 aa  311  2.9999999999999997e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1838  DNA mismatch repair protein MutL  31.6 
 
 		 692 aa  309  1.0000000000000001e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0019765  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  36.09 
 
 		 628 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  36.21 
 
 		 623 aa  308  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  35.46 
 
 		 636 aa  306  7e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1703  DNA mismatch repair protein  35.29 
 
 		 618 aa  306  8.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346146  normal  0.342232 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  29.29 
 
 		 659 aa  306  9.000000000000001e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  32.78 
 
 		 641 aa  304  4.0000000000000003e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  34.24 
 
 		 613 aa  299  1e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4780  DNA mismatch repair protein MutL  34.71 
 
 		 671 aa  298  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.131576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  32.47 
 
 		 611 aa  295  2e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  35.32 
 
 		 661 aa  295  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  33.05 
 
 		 644 aa  295  2e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0267  DNA mismatch repair protein MutL  31.29 
 
 		 622 aa  294  5e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997696 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  33.38 
 
 		 631 aa  293  6e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  35.97 
 
 		 626 aa  292  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  35.6 
 
 		 687 aa  292  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  33.19 
 
 		 626 aa  291  4e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  34.67 
 
 		 597 aa  290  6e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  33.57 
 
 		 617 aa  290  8e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  32.42 
 
 		 608 aa  288  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  32.85 
 
 		 600 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1919  DNA mismatch repair protein MutL  34.19 
 
 		 670 aa  288  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.770906  hitchhiker  0.00107591 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  28.53 
 
 		 623 aa  287  5e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  27.89 
 
 		 645 aa  285  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  30.45 
 
 		 639 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  31.24 
 
 		 629 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  31.54 
 
 		 640 aa  283  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  33.71 
 
 		 632 aa  282  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1011  DNA mismatch repair protein MutL  33.67 
 
 		 637 aa  281  4e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.266056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5569  DNA mismatch repair protein MutL  29.93 
 
 		 685 aa  280  5e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.590077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  28.51 
 
 		 629 aa  279  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  34.78 
 
 		 598 aa  276  7e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  30.12 
 
 		 619 aa  272  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  47.14 
 
 		 611 aa  268  2e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  47.53 
 
 		 681 aa  269  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  45.56 
 
 		 632 aa  266  5.999999999999999e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  45.53 
 
 		 691 aa  266  7e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0734  DNA mismatch repair protein  47.24 
 
 		 667 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  47.24 
 
 		 667 aa  266  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  47.24 
 
 		 667 aa  266  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  46.96 
 
 		 662 aa  265  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  33.7 
 
 		 648 aa  265  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0795  DNA mismatch repair protein  44.39 
 
 		 624 aa  265  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.741444  hitchhiker  0.00456525 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2779  DNA mismatch repair protein  44.69 
 
 		 652 aa  265  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  46.96 
 
 		 661 aa  264  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2756  DNA mismatch repair protein  41.79 
 
 		 653 aa  264  4e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00096  DNA mismatch repair protein  32.55 
 
 		 681 aa  264  4e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  45.09 
 
 		 661 aa  264  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  44.92 
 
 		 625 aa  263  8.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  47.32 
 
 		 660 aa  261  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0750  DNA mismatch repair protein  45.23 
 
 		 687 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.536316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  44.9 
 
 		 619 aa  261  3e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3921  DNA mismatch repair protein  44.25 
 
 		 661 aa  261  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0286731  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  27.13 
 
 		 680 aa  261  4e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2754  DNA mismatch repair protein  45.8 
 
 		 634 aa  260  5.0000000000000005e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  44.44 
 
 		 615 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  45 
 
 		 621 aa  260  6e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4172  DNA mismatch repair protein  44.93 
 
 		 614 aa  260  6e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  47.2 
 
 		 601 aa  260  8e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  31.75 
 
 		 643 aa  259  9e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3207  DNA mismatch repair protein  45.27 
 
 		 665 aa  259  1e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000351816  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  44.68 
 
 		 647 aa  259  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1083  DNA mismatch repair protein  38.68 
 
 		 615 aa  259  2e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  45.13 
 
 		 622 aa  258  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  43.97 
 
 		 622 aa  258  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  45.51 
 
 		 611 aa  257  4e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  44.68 
 
 		 635 aa  257  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  44.13 
 
 		 620 aa  258  4e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  48.18 
 
 		 632 aa  257  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  33.57 
 
 		 628 aa  257  5e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  47.21 
 
 		 629 aa  257  6e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04037  DNA mismatch repair protein  41.73 
 
 		 615 aa  256  8e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0484513  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3823  DNA mismatch repair protein MutL  41.73 
 
 		 615 aa  256  8e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000414583  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0533  DNA mismatch repair protein  45.61 
 
 		 629 aa  256  9e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000857622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4701  DNA mismatch repair protein  41.73 
 
 		 615 aa  256  9e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915673  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3723  DNA mismatch repair protein  43.66 
 
 		 669 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0150049  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0978  DNA mismatch repair protein MutL  46.44 
 
 		 657 aa  256  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4728  DNA mismatch repair protein  41.73 
 
 		 615 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0929403  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4412  DNA mismatch repair protein  41.73 
 
 		 615 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0194282  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  43.26 
 
 		 606 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0893  DNA mismatch repair protein MutL  46.15 
 
 		 657 aa  255  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  46.47 
 
 		 604 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1125  DNA mismatch repair protein MutL  46.94 
 
 		 651 aa  255  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>