More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0734 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  90.85 
 
 
662 aa  1152    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  63.92 
 
 
647 aa  816    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  64.62 
 
 
636 aa  819    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  63.77 
 
 
635 aa  814    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  83.33 
 
 
684 aa  1115    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  64.83 
 
 
652 aa  825    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  84.13 
 
 
691 aa  1092    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  83.26 
 
 
681 aa  1113    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  95.05 
 
 
661 aa  1224    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  82.63 
 
 
705 aa  1106    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  93.25 
 
 
661 aa  1186    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  51.21 
 
 
613 aa  637    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3934  DNA mismatch repair protein  82.68 
 
 
688 aa  1107    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000834702 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3297  DNA mismatch repair protein  83.33 
 
 
684 aa  1115    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365803  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  63.73 
 
 
655 aa  802    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0750  DNA mismatch repair protein  82.41 
 
 
687 aa  1085    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.536316  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  99.1 
 
 
667 aa  1338    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  83.33 
 
 
684 aa  1115    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  83.33 
 
 
684 aa  1115    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  93.1 
 
 
661 aa  1188    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1085  DNA mismatch repair protein  83.33 
 
 
684 aa  1115    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  99.1 
 
 
667 aa  1338    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  83.55 
 
 
681 aa  1116    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0734  DNA mismatch repair protein  100 
 
 
667 aa  1349    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1125  DNA mismatch repair protein MutL  53.02 
 
 
651 aa  629  1e-179  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  50.08 
 
 
616 aa  619  1e-176  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  52.29 
 
 
628 aa  599  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  50 
 
 
622 aa  595  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  50.69 
 
 
598 aa  592  1e-168  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  49.85 
 
 
660 aa  589  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  48.1 
 
 
644 aa  590  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4225  DNA mismatch repair protein MutL  50.57 
 
 
687 aa  585  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.724774  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  49.24 
 
 
645 aa  579  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  48.53 
 
 
648 aa  580  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  49.17 
 
 
633 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  48.72 
 
 
632 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  48.87 
 
 
632 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  49.69 
 
 
604 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  48.5 
 
 
623 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  48.81 
 
 
633 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  49.24 
 
 
633 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  48.05 
 
 
635 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  48.62 
 
 
633 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  49.24 
 
 
625 aa  560  1e-158  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  45.81 
 
 
629 aa  551  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  45.22 
 
 
641 aa  550  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  47.77 
 
 
611 aa  541  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  45.66 
 
 
630 aa  528  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  46.52 
 
 
636 aa  530  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  46.56 
 
 
621 aa  521  1e-146  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  46.46 
 
 
619 aa  514  1e-144  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  46.76 
 
 
626 aa  509  1e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  45.7 
 
 
644 aa  511  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  44.18 
 
 
611 aa  492  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  40.42 
 
 
630 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2015  DNA mismatch repair protein MutL  45.45 
 
 
617 aa  468  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  42.48 
 
 
643 aa  437  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  40.12 
 
 
632 aa  430  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  39.97 
 
 
595 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  39.97 
 
 
595 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  39.35 
 
 
594 aa  421  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  40.34 
 
 
603 aa  416  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  41.36 
 
 
643 aa  418  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1626  DNA mismatch repair protein  39.94 
 
 
603 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0616  DNA mismatch repair protein  40.97 
 
 
633 aa  405  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0800065 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  39.02 
 
 
597 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  39.85 
 
 
599 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  39.39 
 
 
597 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  39.17 
 
 
603 aa  398  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  38.24 
 
 
626 aa  396  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  59.76 
 
 
635 aa  397  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  36.42 
 
 
611 aa  393  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  38.86 
 
 
617 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  39.14 
 
 
605 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  37.03 
 
 
628 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  38.25 
 
 
595 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  38.59 
 
 
603 aa  392  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  38 
 
 
600 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  37.98 
 
 
620 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  38.31 
 
 
600 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  37.48 
 
 
623 aa  389  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  37.48 
 
 
623 aa  389  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  40.21 
 
 
661 aa  385  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  38.64 
 
 
687 aa  383  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5131  DNA mismatch repair protein MutL  57.83 
 
 
674 aa  385  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1011  DNA mismatch repair protein MutL  39.34 
 
 
637 aa  383  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.266056  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4780  DNA mismatch repair protein MutL  40.09 
 
 
671 aa  382  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.131576  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  38.54 
 
 
621 aa  378  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  38.91 
 
 
601 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6625  DNA mismatch repair protein MutL  39.59 
 
 
641 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406254  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  37.33 
 
 
602 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  39.82 
 
 
648 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  34.59 
 
 
647 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  36.92 
 
 
606 aa  365  1e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  37.33 
 
 
607 aa  365  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  34.46 
 
 
626 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  32.77 
 
 
626 aa  360  7e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  33.28 
 
 
644 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0533  DNA mismatch repair protein  39.35 
 
 
629 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000857622  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1838  DNA mismatch repair protein MutL  33.62 
 
 
692 aa  357  5.999999999999999e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0019765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>