More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_978 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  94.52 
 
 		 566 aa  1094    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  100 
 
 		 566 aa  1150    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  85.87 
 
 		 566 aa  994    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  44.37 
 
 		 605 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  44.21 
 
 		 605 aa  464  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  38.86 
 
 		 631 aa  443  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  41.73 
 
 		 612 aa  438  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  38.7 
 
 		 586 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  39.4 
 
 		 565 aa  381  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  36.87 
 
 		 614 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  38.59 
 
 		 620 aa  375  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  36.46 
 
 		 648 aa  375  1e-102  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  39.86 
 
 		 560 aa  371  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  36.57 
 
 		 619 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  35.04 
 
 		 626 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  35.04 
 
 		 626 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  36.71 
 
 		 559 aa  367  1e-100  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  36.24 
 
 		 647 aa  369  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1478  DNA mismatch repair protein MutL  37.46 
 
 		 557 aa  362  1e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.064699  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  34.06 
 
 		 644 aa  359  6e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  35.8 
 
 		 612 aa  359  6e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  34.83 
 
 		 603 aa  359  7e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  34.66 
 
 		 589 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  34.06 
 
 		 647 aa  357  5e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  34.37 
 
 		 647 aa  356  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  34.05 
 
 		 647 aa  355  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  37.23 
 
 		 585 aa  355  2e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  37.1 
 
 		 594 aa  350  6e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  34.47 
 
 		 605 aa  349  8e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  34.72 
 
 		 599 aa  342  2e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  35.88 
 
 		 572 aa  339  8e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  34.78 
 
 		 619 aa  338  9.999999999999999e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  34.79 
 
 		 622 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  37.21 
 
 		 602 aa  337  3.9999999999999995e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  35.02 
 
 		 606 aa  334  3e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  34.99 
 
 		 621 aa  333  4e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  35.19 
 
 		 584 aa  331  2e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1331  DNA mismatch repair protein MutL  36.52 
 
 		 579 aa  331  2e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  35.83 
 
 		 607 aa  331  3e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  35.1 
 
 		 622 aa  331  3e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  35.24 
 
 		 607 aa  330  6e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  36.11 
 
 		 608 aa  329  7e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  33.92 
 
 		 628 aa  329  9e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  35.18 
 
 		 608 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  34.91 
 
 		 589 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1087  DNA mismatch repair protein MutL  35.76 
 
 		 582 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0917186  normal  0.0241297 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1041  DNA mismatch repair protein MutL  33.77 
 
 		 606 aa  326  6e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  33.23 
 
 		 632 aa  326  9e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  33.65 
 
 		 625 aa  325  1e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  34.6 
 
 		 603 aa  324  3e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  34.38 
 
 		 608 aa  323  4e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  36.52 
 
 		 582 aa  322  8e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  35.53 
 
 		 603 aa  322  8e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  33.28 
 
 		 602 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  35.14 
 
 		 628 aa  322  9.999999999999999e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  35.04 
 
 		 600 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  35.21 
 
 		 600 aa  320  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  32.62 
 
 		 647 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  36.9 
 
 		 612 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  35.24 
 
 		 599 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  35.97 
 
 		 611 aa  317  3e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  35.82 
 
 		 601 aa  316  9e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  30.7 
 
 		 645 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  36.33 
 
 		 632 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1626  DNA mismatch repair protein  35.84 
 
 		 603 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  35.51 
 
 		 626 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  36.36 
 
 		 616 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  31.46 
 
 		 623 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  34.65 
 
 		 574 aa  312  7.999999999999999e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  34.41 
 
 		 575 aa  312  1e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  34.99 
 
 		 606 aa  311  2.9999999999999997e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  35.42 
 
 		 597 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  35.12 
 
 		 615 aa  310  5e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  33.12 
 
 		 630 aa  310  5e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  31.6 
 
 		 647 aa  310  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  31.43 
 
 		 649 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  33.66 
 
 		 605 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0034  DNA mismatch repair protein MutL  35.55 
 
 		 590 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  35.16 
 
 		 611 aa  307  3e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  33.88 
 
 		 622 aa  307  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  34.39 
 
 		 643 aa  306  4.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1168  DNA mismatch repair protein  35.46 
 
 		 588 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.985109  normal  0.444607 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  35.33 
 
 		 603 aa  306  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  32.75 
 
 		 617 aa  305  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  34.52 
 
 		 603 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  33.54 
 
 		 626 aa  303  6.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  35.04 
 
 		 595 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  34.33 
 
 		 641 aa  303  6.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  32.9 
 
 		 624 aa  303  6.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  33.76 
 
 		 623 aa  302  9e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0267  DNA mismatch repair protein MutL  34.8 
 
 		 610 aa  302  1e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  33.01 
 
 		 613 aa  302  1e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  34.6 
 
 		 629 aa  302  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  35.09 
 
 		 597 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  34.19 
 
 		 644 aa  301  2e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  34.98 
 
 		 620 aa  301  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  33.28 
 
 		 623 aa  300  5e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  33.28 
 
 		 623 aa  300  5e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  34.32 
 
 		 610 aa  300  7e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  31.07 
 
 		 626 aa  298  2e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>