More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1612 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  100 
 
 
614 aa  1244    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  38.83 
 
 
665 aa  464  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  39.81 
 
 
589 aa  426  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  38.79 
 
 
619 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  36.39 
 
 
649 aa  422  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  37.69 
 
 
640 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  37.14 
 
 
620 aa  419  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1172  DNA mismatch repair protein  37.04 
 
 
674 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  37.2 
 
 
603 aa  415  1e-114  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1359  DNA mismatch repair protein  37.44 
 
 
674 aa  414  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  35.66 
 
 
612 aa  412  1e-114  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  37.4 
 
 
626 aa  412  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  37.4 
 
 
626 aa  412  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  34.63 
 
 
606 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  35.74 
 
 
647 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  35.42 
 
 
647 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  35.74 
 
 
647 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  35.43 
 
 
647 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  36.2 
 
 
647 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  36.67 
 
 
644 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  35.43 
 
 
647 aa  405  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  33.44 
 
 
565 aa  403  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  35.01 
 
 
602 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  36.57 
 
 
639 aa  398  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  35.31 
 
 
612 aa  398  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  33.82 
 
 
692 aa  394  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  34.05 
 
 
645 aa  389  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  34.57 
 
 
659 aa  390  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  36.54 
 
 
566 aa  392  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  34.05 
 
 
647 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  38.23 
 
 
572 aa  389  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  34.02 
 
 
628 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  35.66 
 
 
630 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  36.25 
 
 
585 aa  390  1e-107  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  33.98 
 
 
622 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  39.15 
 
 
559 aa  386  1e-106  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  35.68 
 
 
584 aa  388  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  36.22 
 
 
566 aa  382  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  33.78 
 
 
669 aa  382  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  35.68 
 
 
644 aa  382  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  33.17 
 
 
605 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  33.5 
 
 
605 aa  381  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  34.78 
 
 
647 aa  380  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  34.29 
 
 
622 aa  377  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  32.58 
 
 
608 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  35.56 
 
 
566 aa  371  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  34.2 
 
 
608 aa  367  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  34.38 
 
 
648 aa  369  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  32.77 
 
 
647 aa  365  1e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0023  DNA mismatch repair protein MutL  37.36 
 
 
621 aa  365  2e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000493473  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  34.28 
 
 
629 aa  360  4e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  33.82 
 
 
599 aa  360  5e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  33.79 
 
 
656 aa  360  5e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1041  DNA mismatch repair protein MutL  36.54 
 
 
606 aa  359  7e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  31.89 
 
 
607 aa  359  7e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  32 
 
 
607 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  33.76 
 
 
586 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  33.49 
 
 
602 aa  358  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  32.69 
 
 
608 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  32.75 
 
 
631 aa  357  3.9999999999999996e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  34.85 
 
 
560 aa  356  6.999999999999999e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  34.48 
 
 
626 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  34.44 
 
 
624 aa  352  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  34.52 
 
 
623 aa  352  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  33.28 
 
 
644 aa  351  2e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  34.71 
 
 
628 aa  352  2e-95  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  33.66 
 
 
610 aa  350  3e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  33.07 
 
 
605 aa  350  5e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  33.72 
 
 
680 aa  347  4e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  31.86 
 
 
589 aa  347  5e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0267  DNA mismatch repair protein MutL  33.6 
 
 
622 aa  346  6e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000997696 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1168  DNA mismatch repair protein  34.08 
 
 
588 aa  345  1e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.985109  normal  0.444607 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  32.64 
 
 
623 aa  344  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  32.38 
 
 
643 aa  344  2.9999999999999997e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0821  DNA mismatch repair protein MutL  32.85 
 
 
630 aa  343  5e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000117941  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  31.67 
 
 
601 aa  343  5.999999999999999e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  33.23 
 
 
615 aa  340  4e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0776  DNA mismatch repair protein MutL  43.32 
 
 
755 aa  340  5.9999999999999996e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.287224  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  30.65 
 
 
616 aa  339  7e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  30.47 
 
 
632 aa  338  1.9999999999999998e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  31.34 
 
 
603 aa  335  1e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  32.28 
 
 
617 aa  334  2e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  32.36 
 
 
641 aa  333  7.000000000000001e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0949  DNA mismatch repair protein MutL  34.57 
 
 
611 aa  332  9e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  32.24 
 
 
629 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0215  DNA mismatch repair protein MutL  32.96 
 
 
608 aa  328  2.0000000000000001e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.137951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  31.54 
 
 
632 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  32.7 
 
 
624 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  31.76 
 
 
630 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2946  DNA mismatch repair protein  32.75 
 
 
629 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  31.5 
 
 
612 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2380  DNA mismatch repair protein MutL  41.36 
 
 
695 aa  327  3e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  31.54 
 
 
633 aa  326  6e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  31.7 
 
 
632 aa  326  7e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  30.19 
 
 
628 aa  325  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  30.99 
 
 
629 aa  325  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  31.78 
 
 
632 aa  325  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  32.15 
 
 
575 aa  324  3e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  31.19 
 
 
630 aa  323  4e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  32.31 
 
 
574 aa  323  7e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>