More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1172 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1359  DNA mismatch repair protein  96.59 
 
 		 674 aa  1315    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1172  DNA mismatch repair protein  100 
 
 		 674 aa  1356    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2380  DNA mismatch repair protein MutL  36.71 
 
 		 695 aa  443  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  37.3 
 
 		 665 aa  425  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  35.65 
 
 		 647 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  35.3 
 
 		 647 aa  404  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  35.45 
 
 		 647 aa  402  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  35.3 
 
 		 647 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  35.16 
 
 		 647 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  36.28 
 
 		 649 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  35.55 
 
 		 647 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  36.26 
 
 		 619 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  35.94 
 
 		 644 aa  397  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  35.45 
 
 		 656 aa  397  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  35.04 
 
 		 647 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  35.3 
 
 		 626 aa  395  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  35.3 
 
 		 626 aa  395  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  34.18 
 
 		 648 aa  393  1e-108  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  33.92 
 
 		 645 aa  387  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  34.1 
 
 		 669 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  34.79 
 
 		 640 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  36.47 
 
 		 659 aa  382  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  36.89 
 
 		 639 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  33.23 
 
 		 622 aa  381  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  34.62 
 
 		 630 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  33.04 
 
 		 668 aa  374  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  36.29 
 
 		 644 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  33.81 
 
 		 692 aa  370  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  33.43 
 
 		 680 aa  369  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  32.29 
 
 		 620 aa  363  7.0000000000000005e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  33.43 
 
 		 612 aa  362  1e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  33.98 
 
 		 647 aa  356  8.999999999999999e-97  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  30.13 
 
 		 647 aa  353  5e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  31.35 
 
 		 602 aa  347  4e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  30.94 
 
 		 630 aa  343  5.999999999999999e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0023  DNA mismatch repair protein MutL  34.22 
 
 		 621 aa  343  9e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000493473  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  29.43 
 
 		 626 aa  337  5.999999999999999e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  33.14 
 
 		 629 aa  331  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  30.36 
 
 		 691 aa  331  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  28.53 
 
 		 623 aa  330  4e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  28.53 
 
 		 623 aa  330  4e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  29.78 
 
 		 632 aa  328  3e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1919  DNA mismatch repair protein MutL  31.71 
 
 		 670 aa  326  8.000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.770906  hitchhiker  0.00107591 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  30.27 
 
 		 620 aa  325  1e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  29.67 
 
 		 605 aa  324  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  29.02 
 
 		 655 aa  323  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  30.47 
 
 		 629 aa  323  5e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  32.29 
 
 		 610 aa  323  9.000000000000001e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0776  DNA mismatch repair protein MutL  47.55 
 
 		 755 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.287224  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  29.79 
 
 		 681 aa  321  3e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  29.84 
 
 		 652 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  29.97 
 
 		 626 aa  319  9e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  29.55 
 
 		 705 aa  319  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  29.79 
 
 		 681 aa  317  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  27.79 
 
 		 617 aa  312  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  29.69 
 
 		 641 aa  311  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1011  DNA mismatch repair protein MutL  29.51 
 
 		 637 aa  311  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.266056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  30.24 
 
 		 611 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1125  DNA mismatch repair protein MutL  28.8 
 
 		 651 aa  308  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0413  DNA mismatch repair protein  31.75 
 
 		 630 aa  308  2.0000000000000002e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  30.51 
 
 		 617 aa  306  7e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  30.07 
 
 		 603 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  28.06 
 
 		 613 aa  303  7.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  28.78 
 
 		 687 aa  303  9e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0821  DNA mismatch repair protein MutL  30.12 
 
 		 630 aa  302  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000117941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  28.78 
 
 		 661 aa  300  8e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  27.86 
 
 		 643 aa  298  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  40.75 
 
 		 565 aa  294  3e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2732  DNA mismatch repair protein MutL  29.47 
 
 		 730 aa  294  5e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0867295  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  27.33 
 
 		 648 aa  293  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0884  DNA mismatch repair protein  31.13 
 
 		 673 aa  291  3e-77  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.277202  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  28.14 
 
 		 622 aa  291  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  42.64 
 
 		 628 aa  291  4e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  28.86 
 
 		 660 aa  287  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0216  DNA mismatch repair protein  30.14 
 
 		 682 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0851058  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  40.91 
 
 		 560 aa  284  5.000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  38.76 
 
 		 605 aa  283  7.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5569  DNA mismatch repair protein MutL  44.68 
 
 		 685 aa  283  8.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.590077  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1838  DNA mismatch repair protein MutL  40.68 
 
 		 692 aa  283  8.000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0019765  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  42.07 
 
 		 612 aa  282  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0599  DNA mismatch repair protein MutL  31.29 
 
 		 621 aa  283  1e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0798741  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  41.64 
 
 		 605 aa  283  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0509  DNA mismatch repair protein  31.86 
 
 		 598 aa  281  2e-74  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.587743  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  42.68 
 
 		 631 aa  281  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  44.38 
 
 		 608 aa  282  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  40.98 
 
 		 589 aa  278  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  37.53 
 
 		 606 aa  276  8e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  44.17 
 
 		 572 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  35.14 
 
 		 608 aa  273  6e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  36.45 
 
 		 622 aa  272  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0949  DNA mismatch repair protein MutL  31.37 
 
 		 611 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  41.14 
 
 		 566 aa  268  2e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0086  DNA mismatch repair protein MutL  28.3 
 
 		 633 aa  267  5e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.243153  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  40.27 
 
 		 566 aa  266  1e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  41.1 
 
 		 605 aa  265  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  38.12 
 
 		 586 aa  264  4e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  39.14 
 
 		 608 aa  264  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  38.84 
 
 		 607 aa  264  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  38.84 
 
 		 607 aa  263  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  39.4 
 
 		 650 aa  262  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>