More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0023 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1041  DNA mismatch repair protein MutL  58.88 
 
 		 606 aa  698    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0023  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 621 aa  1246    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000493473  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  35.57 
 
 		 665 aa  378  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  33.8 
 
 		 603 aa  367  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  31.13 
 
 		 612 aa  349  7e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  30.56 
 
 		 605 aa  348  2e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  30.21 
 
 		 647 aa  347  3e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  35.79 
 
 		 644 aa  347  3e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  36.28 
 
 		 614 aa  347  4e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  34.15 
 
 		 659 aa  347  5e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  33.44 
 
 		 656 aa  347  5e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  30.54 
 
 		 631 aa  345  2e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  33.89 
 
 		 641 aa  345  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  34.26 
 
 		 647 aa  343  4e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1172  DNA mismatch repair protein  34.22 
 
 		 674 aa  343  8e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  30.66 
 
 		 606 aa  342  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  35.42 
 
 		 669 aa  342  2e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  34.91 
 
 		 572 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  29.94 
 
 		 605 aa  340  4e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  30.09 
 
 		 622 aa  340  4e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1359  DNA mismatch repair protein  34.66 
 
 		 674 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  31.82 
 
 		 628 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  33.94 
 
 		 645 aa  337  5e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  31.61 
 
 		 623 aa  337  5e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  32.56 
 
 		 680 aa  334  3e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  31.02 
 
 		 602 aa  334  3e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  29.92 
 
 		 605 aa  333  4e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  29.56 
 
 		 608 aa  333  8e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  33.28 
 
 		 589 aa  330  6e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  29.24 
 
 		 607 aa  329  7e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  29.24 
 
 		 608 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  28.62 
 
 		 607 aa  326  6e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  34.62 
 
 		 619 aa  325  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  31.69 
 
 		 640 aa  324  3e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  32.73 
 
 		 644 aa  323  5e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  33.18 
 
 		 626 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  33.18 
 
 		 626 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  30.82 
 
 		 622 aa  322  9.999999999999999e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  32.88 
 
 		 647 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2380  DNA mismatch repair protein MutL  31.99 
 
 		 695 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  32.31 
 
 		 630 aa  320  3e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  30.93 
 
 		 575 aa  321  3e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  31.16 
 
 		 641 aa  319  7.999999999999999e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  29.7 
 
 		 623 aa  319  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  29.7 
 
 		 623 aa  319  1e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  31.83 
 
 		 633 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  29.98 
 
 		 611 aa  318  2e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  30.76 
 
 		 574 aa  318  2e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  30.85 
 
 		 629 aa  317  3e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1838  DNA mismatch repair protein MutL  29.7 
 
 		 692 aa  317  3e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0019765  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  31.31 
 
 		 668 aa  317  4e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  31.67 
 
 		 633 aa  317  4e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  32.88 
 
 		 626 aa  317  4e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  32.27 
 
 		 647 aa  317  5e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  33.44 
 
 		 624 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  29.37 
 
 		 626 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  32.19 
 
 		 620 aa  314  3.9999999999999997e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  31.9 
 
 		 584 aa  313  5.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  31.78 
 
 		 608 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  31.6 
 
 		 626 aa  313  7.999999999999999e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  30.4 
 
 		 645 aa  312  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  27.94 
 
 		 632 aa  312  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  32.27 
 
 		 644 aa  311  2e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  29.53 
 
 		 620 aa  311  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  29.32 
 
 		 601 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0267  DNA mismatch repair protein MutL  32.71 
 
 		 622 aa  311  2.9999999999999997e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997696 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  30.5 
 
 		 625 aa  311  2.9999999999999997e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  32.41 
 
 		 630 aa  309  9e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  29.78 
 
 		 600 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  29.65 
 
 		 648 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  30.72 
 
 		 632 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  30.84 
 
 		 635 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  30.19 
 
 		 611 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  28.34 
 
 		 629 aa  308  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  30.7 
 
 		 632 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  31.96 
 
 		 629 aa  307  3e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  31.4 
 
 		 586 aa  307  5.0000000000000004e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  29.5 
 
 		 600 aa  306  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  30.7 
 
 		 633 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  28.01 
 
 		 606 aa  305  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  30.45 
 
 		 648 aa  305  2.0000000000000002e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  32.04 
 
 		 616 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  32.04 
 
 		 624 aa  303  7.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  29.48 
 
 		 628 aa  302  9e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1711  DNA mismatch repair protein MutL  32.23 
 
 		 588 aa  302  2e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.619498  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  30.44 
 
 		 615 aa  301  3e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  29.29 
 
 		 647 aa  300  7e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  31.71 
 
 		 639 aa  299  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  27.4 
 
 		 602 aa  298  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0215  DNA mismatch repair protein MutL  31.2 
 
 		 608 aa  298  2e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.137951 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  32.07 
 
 		 649 aa  298  3e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  31.25 
 
 		 612 aa  297  5e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  30.82 
 
 		 647 aa  296  6e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  28.01 
 
 		 617 aa  296  8e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  28.75 
 
 		 636 aa  295  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  31.62 
 
 		 647 aa  295  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1168  DNA mismatch repair protein  30.26 
 
 		 588 aa  294  4e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.985109  normal  0.444607 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  29.39 
 
 		 630 aa  293  5e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1306  DNA mismatch repair protein  31.63 
 
 		 608 aa  292  1e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.66007  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  28.75 
 
 		 616 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>