More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0776 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0776  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 755 aa  1526    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.287224  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  61.41 
 
 		 665 aa  486  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2732  DNA mismatch repair protein MutL  36.34 
 
 		 730 aa  435  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0867295  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2380  DNA mismatch repair protein MutL  45.58 
 
 		 695 aa  377  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  41.1 
 
 		 620 aa  343  8e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  42.75 
 
 		 680 aa  331  3e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  46.49 
 
 		 639 aa  328  3e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  49.23 
 
 		 644 aa  324  3e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1359  DNA mismatch repair protein  47.85 
 
 		 674 aa  324  3e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  46.57 
 
 		 640 aa  323  6e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  47.29 
 
 		 614 aa  323  9.999999999999999e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1172  DNA mismatch repair protein  47.55 
 
 		 674 aa  322  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  49.69 
 
 		 656 aa  319  1e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  45.09 
 
 		 565 aa  318  3e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  41.96 
 
 		 649 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  40.93 
 
 		 644 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  40.51 
 
 		 647 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  44.75 
 
 		 647 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  45.87 
 
 		 619 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  44.2 
 
 		 647 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  44.48 
 
 		 647 aa  314  3.9999999999999997e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  47.29 
 
 		 630 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  43.94 
 
 		 626 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  43.94 
 
 		 626 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  43.94 
 
 		 647 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  43.94 
 
 		 647 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  44.48 
 
 		 647 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  47.16 
 
 		 631 aa  310  5.9999999999999995e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  46.32 
 
 		 647 aa  307  4.0000000000000004e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  45.92 
 
 		 589 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  45.28 
 
 		 668 aa  300  7e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1919  DNA mismatch repair protein MutL  44.8 
 
 		 670 aa  300  8e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.770906  hitchhiker  0.00107591 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  39.31 
 
 		 669 aa  299  1e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0376  DNA mismatch repair protein MutL  44.86 
 
 		 709 aa  300  1e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.13305  normal  0.32452 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  43.09 
 
 		 659 aa  299  2e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  44.35 
 
 		 560 aa  298  3e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  45.37 
 
 		 692 aa  294  4e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  42 
 
 		 612 aa  291  4e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  45.85 
 
 		 605 aa  290  6e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  43.33 
 
 		 603 aa  288  2e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1083  DNA mismatch repair protein  41.09 
 
 		 615 aa  288  2.9999999999999996e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0413  DNA mismatch repair protein  46.69 
 
 		 630 aa  288  2.9999999999999996e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1838  DNA mismatch repair protein MutL  43.73 
 
 		 692 aa  286  8e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0019765  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  38.79 
 
 		 622 aa  283  6.000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  42.64 
 
 		 608 aa  283  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  38.64 
 
 		 645 aa  281  2e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  43.83 
 
 		 608 aa  281  3e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  40.48 
 
 		 605 aa  280  6e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  42.04 
 
 		 607 aa  280  9e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  41.76 
 
 		 628 aa  279  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  38.02 
 
 		 602 aa  280  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  43.34 
 
 		 610 aa  279  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  42.04 
 
 		 607 aa  279  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  42.46 
 
 		 648 aa  278  3e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  42.9 
 
 		 647 aa  278  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4225  DNA mismatch repair protein MutL  43.12 
 
 		 687 aa  276  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.724774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  44.55 
 
 		 585 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1289  DNA mismatch repair protein MutL  43.45 
 
 		 765 aa  275  3e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  41.99 
 
 		 589 aa  275  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  42.72 
 
 		 632 aa  275  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2756  DNA mismatch repair protein  44.74 
 
 		 653 aa  274  4.0000000000000004e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  41.1 
 
 		 601 aa  274  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  42.28 
 
 		 650 aa  274  5.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  41.64 
 
 		 584 aa  274  5.000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  42.9 
 
 		 629 aa  273  6e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  41.74 
 
 		 566 aa  273  8.000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  40.11 
 
 		 647 aa  273  8.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  42.55 
 
 		 605 aa  273  8.000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  42.43 
 
 		 566 aa  273  1e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  42.47 
 
 		 606 aa  273  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00096  DNA mismatch repair protein  38.61 
 
 		 681 aa  273  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  42.42 
 
 		 623 aa  273  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  40.36 
 
 		 644 aa  272  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002257  DNA mismatch repair protein MutL  41.9 
 
 		 670 aa  271  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.558957  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0629  DNA mismatch repair protein MutL  43.53 
 
 		 767 aa  272  2e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1478  DNA mismatch repair protein MutL  45.26 
 
 		 557 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.064699  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  45.15 
 
 		 629 aa  271  4e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0267  DNA mismatch repair protein MutL  43.16 
 
 		 610 aa  270  5e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2779  DNA mismatch repair protein  45.26 
 
 		 652 aa  270  5e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  41.41 
 
 		 626 aa  269  1e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  42.51 
 
 		 613 aa  269  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  41.07 
 
 		 566 aa  269  1e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3217  DNA mismatch repair protein MutL  40.25 
 
 		 762 aa  269  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0687703 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  42.68 
 
 		 626 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  45.34 
 
 		 603 aa  268  4e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  40.25 
 
 		 623 aa  267  5e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  37.19 
 
 		 617 aa  267  5.999999999999999e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  37.31 
 
 		 628 aa  266  7e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  42.38 
 
 		 633 aa  266  7e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  42.36 
 
 		 612 aa  266  8.999999999999999e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  44.17 
 
 		 572 aa  266  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  41.46 
 
 		 632 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  41.77 
 
 		 632 aa  266  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  41.46 
 
 		 633 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  41.77 
 
 		 633 aa  265  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  41.82 
 
 		 611 aa  264  4e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  42.17 
 
 		 559 aa  263  6e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0007  DNA mismatch repair protein MutL  40.85 
 
 		 709 aa  263  6e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.953905  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  41.16 
 
 		 633 aa  263  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5569  DNA mismatch repair protein MutL  40.25 
 
 		 685 aa  263  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.590077  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>