More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0086 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0086  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 633 aa  1285    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.243153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  37.31 
 
 		 628 aa  358  9.999999999999999e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  35.66 
 
 		 628 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  35.49 
 
 		 602 aa  324  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  34.78 
 
 		 647 aa  317  5e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  35.07 
 
 		 622 aa  317  6e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  34.22 
 
 		 608 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  31.6 
 
 		 603 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  34.7 
 
 		 647 aa  310  8e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  34.37 
 
 		 605 aa  309  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  34.51 
 
 		 639 aa  307  3e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  33.03 
 
 		 650 aa  306  8.000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  33.07 
 
 		 605 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  35.05 
 
 		 607 aa  301  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  35.78 
 
 		 601 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  34.17 
 
 		 615 aa  299  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  35.45 
 
 		 600 aa  298  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  34.57 
 
 		 608 aa  296  5e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  31.64 
 
 		 640 aa  296  6e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  34.61 
 
 		 605 aa  296  8e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  33.54 
 
 		 608 aa  295  1e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0821  DNA mismatch repair protein MutL  30.41 
 
 		 630 aa  294  4e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000117941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  31.62 
 
 		 623 aa  293  4e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  29.46 
 
 		 644 aa  292  1e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  33.84 
 
 		 600 aa  292  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  34.21 
 
 		 607 aa  292  1e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  34.62 
 
 		 629 aa  291  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  29.69 
 
 		 624 aa  289  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  33.85 
 
 		 643 aa  289  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  32.33 
 
 		 631 aa  289  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  29.69 
 
 		 626 aa  288  2e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  32.7 
 
 		 622 aa  287  4e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  33.23 
 
 		 617 aa  287  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  30.66 
 
 		 647 aa  287  4e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  30.77 
 
 		 610 aa  286  9e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  31.07 
 
 		 624 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  30.8 
 
 		 626 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  34.47 
 
 		 632 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  30.84 
 
 		 665 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  31.89 
 
 		 632 aa  283  5.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  33.96 
 
 		 619 aa  283  8.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  32.88 
 
 		 623 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  29.86 
 
 		 659 aa  282  1e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  34.27 
 
 		 633 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  34.41 
 
 		 628 aa  283  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  35.08 
 
 		 611 aa  282  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  31.11 
 
 		 617 aa  282  1e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  33.64 
 
 		 632 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  33.54 
 
 		 635 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1172  DNA mismatch repair protein  28.59 
 
 		 674 aa  281  3e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  31.5 
 
 		 656 aa  281  4e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  32.97 
 
 		 612 aa  280  5e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  33.12 
 
 		 611 aa  280  6e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  31.05 
 
 		 668 aa  278  2e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  32.02 
 
 		 623 aa  278  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  32.02 
 
 		 623 aa  278  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  31.71 
 
 		 566 aa  278  2e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  33.75 
 
 		 633 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1359  DNA mismatch repair protein  28.99 
 
 		 674 aa  276  7e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  33.18 
 
 		 603 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  34 
 
 		 598 aa  275  3e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  34.59 
 
 		 636 aa  274  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  33.13 
 
 		 613 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  33.9 
 
 		 625 aa  273  5.000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  32.92 
 
 		 620 aa  273  5.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  28.97 
 
 		 680 aa  273  5.000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  33.63 
 
 		 648 aa  273  6e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  32.4 
 
 		 626 aa  271  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  31.15 
 
 		 575 aa  271  2.9999999999999997e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  30.99 
 
 		 641 aa  271  4e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  31.55 
 
 		 612 aa  270  4e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  29.88 
 
 		 644 aa  270  5.9999999999999995e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  32.04 
 
 		 603 aa  270  5.9999999999999995e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  31.15 
 
 		 629 aa  270  7e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  37.48 
 
 		 626 aa  270  7e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  45.29 
 
 		 606 aa  269  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  29.94 
 
 		 629 aa  269  1e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  31.99 
 
 		 606 aa  268  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0949  DNA mismatch repair protein MutL  28.66 
 
 		 611 aa  268  2e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  31.9 
 
 		 645 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  31.64 
 
 		 630 aa  268  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  31.06 
 
 		 574 aa  268  2e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  32.24 
 
 		 597 aa  267  5e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  29.85 
 
 		 611 aa  266  5.999999999999999e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  31.47 
 
 		 602 aa  266  5.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0215  DNA mismatch repair protein MutL  30.58 
 
 		 608 aa  266  5.999999999999999e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.137951 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  33.28 
 
 		 652 aa  266  7e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  33.44 
 
 		 641 aa  266  7e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  36.56 
 
 		 620 aa  266  8.999999999999999e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  31.87 
 
 		 597 aa  266  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0616  DNA mismatch repair protein  32.05 
 
 		 633 aa  265  1e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0800065 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  45.48 
 
 		 589 aa  265  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1011  DNA mismatch repair protein MutL  32.62 
 
 		 637 aa  265  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.266056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6625  DNA mismatch repair protein MutL  33.44 
 
 		 641 aa  263  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406254  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  32.13 
 
 		 661 aa  262  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  33.96 
 
 		 635 aa  261  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2732  DNA mismatch repair protein MutL  40.1 
 
 		 730 aa  261  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0867295  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  34.28 
 
 		 647 aa  261  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3542  DNA mismatch repair protein  38.97 
 
 		 628 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  31.35 
 
 		 687 aa  258  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221737 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>