More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2732 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2732  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 
730 aa  1486    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0867295  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0776  DNA mismatch repair protein MutL  35.07 
 
 
755 aa  432  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.287224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  37.36 
 
 
692 aa  422  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  35.25 
 
 
680 aa  415  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  33.29 
 
 
665 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  47.8 
 
 
639 aa  335  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  49.7 
 
 
620 aa  323  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  46.24 
 
 
619 aa  310  9e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  49.21 
 
 
640 aa  306  6e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  46.87 
 
 
630 aa  302  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  47.62 
 
 
647 aa  301  3e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  43.94 
 
 
649 aa  301  4e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  42.86 
 
 
626 aa  300  9e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  42.86 
 
 
626 aa  300  9e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  42.86 
 
 
647 aa  299  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  42.86 
 
 
647 aa  299  1e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  42.86 
 
 
647 aa  298  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  42.86 
 
 
647 aa  298  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  42.86 
 
 
647 aa  298  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  42.2 
 
 
644 aa  298  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  42.86 
 
 
647 aa  298  4e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  42.59 
 
 
647 aa  297  5e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5569  DNA mismatch repair protein MutL  31.11 
 
 
685 aa  296  8e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.590077  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  43.69 
 
 
668 aa  296  1e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1172  DNA mismatch repair protein  29.47 
 
 
674 aa  294  5e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  42.78 
 
 
659 aa  293  9e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  46.15 
 
 
565 aa  290  6e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  45.64 
 
 
628 aa  287  5.999999999999999e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2380  DNA mismatch repair protein MutL  46.15 
 
 
695 aa  286  7e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  46.11 
 
 
612 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  40.15 
 
 
603 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  44.72 
 
 
656 aa  283  7.000000000000001e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  45.06 
 
 
560 aa  283  1e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  46.15 
 
 
644 aa  281  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  46.22 
 
 
605 aa  279  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  41.16 
 
 
647 aa  278  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1838  DNA mismatch repair protein MutL  45.09 
 
 
692 aa  277  4e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0019765  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  44 
 
 
645 aa  276  7e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3723  DNA mismatch repair protein  40.88 
 
 
669 aa  276  9e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0150049  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1919  DNA mismatch repair protein MutL  44.41 
 
 
670 aa  276  9e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.770906  hitchhiker  0.00107591 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  41.27 
 
 
607 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3217  DNA mismatch repair protein MutL  42.11 
 
 
762 aa  275  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0687703 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  43.38 
 
 
669 aa  275  3e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  41.39 
 
 
608 aa  274  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  43.2 
 
 
644 aa  274  4.0000000000000004e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  43.52 
 
 
648 aa  273  7e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  44.71 
 
 
605 aa  273  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  44.65 
 
 
584 aa  272  1e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  43.41 
 
 
607 aa  272  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  41.01 
 
 
605 aa  271  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  46.95 
 
 
585 aa  271  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3976  DNA mismatch repair protein MutL  43.67 
 
 
639 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1083  DNA mismatch repair protein  35.39 
 
 
615 aa  271  4e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3921  DNA mismatch repair protein  39.8 
 
 
661 aa  269  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0286731  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  44.38 
 
 
559 aa  269  1e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  44.25 
 
 
608 aa  269  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0533  DNA mismatch repair protein  44.55 
 
 
629 aa  269  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000857622  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0429  DNA mismatch repair protein  41.22 
 
 
624 aa  268  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000237281  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  45.07 
 
 
603 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00096  DNA mismatch repair protein  40.16 
 
 
681 aa  268  4e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0216  DNA mismatch repair protein  28.36 
 
 
682 aa  267  5e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0851058  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  44.95 
 
 
621 aa  266  1e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0490  DNA mismatch repair protein  44.55 
 
 
649 aa  266  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00424491  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002257  DNA mismatch repair protein MutL  40.98 
 
 
670 aa  266  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.558957  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0413  DNA mismatch repair protein  42.2 
 
 
630 aa  266  1e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  44.95 
 
 
619 aa  265  2e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  43.12 
 
 
610 aa  265  2e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3655  DNA mismatch repair protein  42.48 
 
 
635 aa  264  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0128216  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3801  DNA mismatch repair protein  42.48 
 
 
635 aa  264  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0701  DNA mismatch repair protein  42.48 
 
 
635 aa  264  4e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.138509  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2752  DNA mismatch repair protein MutL  43.33 
 
 
576 aa  263  6e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  42.51 
 
 
623 aa  263  6e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  43.6 
 
 
631 aa  263  8e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  43.71 
 
 
622 aa  263  1e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0353  DNA mismatch repair protein  40.56 
 
 
613 aa  262  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.114284  hitchhiker  0.00160708 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2625  DNA mismatch repair protein MutL  43.33 
 
 
576 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  42.26 
 
 
641 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  43.07 
 
 
611 aa  262  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2779  DNA mismatch repair protein  41.67 
 
 
652 aa  262  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0034  DNA mismatch repair protein MutL  45.25 
 
 
590 aa  261  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2756  DNA mismatch repair protein  42.31 
 
 
653 aa  261  3e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  39.14 
 
 
647 aa  261  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  44.31 
 
 
572 aa  261  4e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4720  DNA mismatch repair protein  44.24 
 
 
618 aa  261  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04037  DNA mismatch repair protein  44.55 
 
 
615 aa  261  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0484513  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3823  DNA mismatch repair protein MutL  44.55 
 
 
615 aa  261  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000414583  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  42.57 
 
 
606 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4412  DNA mismatch repair protein  44.55 
 
 
615 aa  260  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0194282  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  42.64 
 
 
633 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4728  DNA mismatch repair protein  44.55 
 
 
615 aa  260  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0929403  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  43.03 
 
 
626 aa  260  6e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  42.09 
 
 
633 aa  260  6e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3843  DNA mismatch repair protein  44.55 
 
 
615 aa  260  7e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000795964  hitchhiker  0.000000387336 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4701  DNA mismatch repair protein  44.55 
 
 
615 aa  260  7e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915673  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5686  DNA mismatch repair protein  44.55 
 
 
615 aa  260  8e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000161678  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4641  DNA mismatch repair protein  44.55 
 
 
615 aa  260  8e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.231193  normal  0.0766044 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00647  DNA mismatch repair protein  43.87 
 
 
608 aa  259  9e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.893353  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3542  DNA mismatch repair protein  41.05 
 
 
628 aa  258  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4756  DNA mismatch repair protein  43.94 
 
 
618 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  44.51 
 
 
625 aa  259  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>