More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1478 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1478  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 
557 aa  1114    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.064699  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  40.7 
 
 
603 aa  379  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  39.3 
 
 
559 aa  375  1e-103  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  37.78 
 
 
566 aa  375  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  37.54 
 
 
566 aa  372  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  37.24 
 
 
566 aa  362  9e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  36 
 
 
647 aa  359  6e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  37.88 
 
 
586 aa  359  8e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  37.07 
 
 
606 aa  356  7.999999999999999e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  37.42 
 
 
620 aa  352  1e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  36.95 
 
 
605 aa  350  4e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  37.61 
 
 
622 aa  349  7e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  36.79 
 
 
612 aa  349  9e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  37.27 
 
 
605 aa  346  6e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  36.93 
 
 
572 aa  346  8e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  34.61 
 
 
626 aa  343  4e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  36.44 
 
 
602 aa  343  4e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  34.61 
 
 
626 aa  343  4e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  36.68 
 
 
608 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  35.05 
 
 
619 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  35.36 
 
 
628 aa  330  4e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  35.48 
 
 
584 aa  329  8e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  37.17 
 
 
565 aa  329  9e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  35.65 
 
 
622 aa  328  2.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  36.72 
 
 
612 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  35.97 
 
 
605 aa  327  3e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  33.33 
 
 
647 aa  325  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  36.96 
 
 
599 aa  325  1e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  36.94 
 
 
606 aa  323  4e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1168  DNA mismatch repair protein  36.95 
 
 
588 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.985109  normal  0.444607 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  35.82 
 
 
585 aa  320  6e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  36.12 
 
 
611 aa  318  2e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  35.07 
 
 
607 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  36.03 
 
 
630 aa  318  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  34.86 
 
 
607 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  36.69 
 
 
616 aa  316  9e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  37.17 
 
 
632 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  34.8 
 
 
608 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  35.95 
 
 
612 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  34.39 
 
 
632 aa  313  4.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  36.82 
 
 
602 aa  312  9e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  35.53 
 
 
619 aa  312  1e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  34.11 
 
 
608 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  34.78 
 
 
644 aa  310  4e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  32.01 
 
 
649 aa  309  8e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  34.67 
 
 
603 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  35.75 
 
 
589 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  37.23 
 
 
621 aa  303  8.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  38.02 
 
 
610 aa  302  9e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1041  DNA mismatch repair protein MutL  31.76 
 
 
606 aa  301  2e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  34.08 
 
 
629 aa  301  3e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  35.02 
 
 
560 aa  299  7e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  33.88 
 
 
601 aa  300  7e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  35.02 
 
 
575 aa  299  8e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  35.04 
 
 
574 aa  298  2e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  33.11 
 
 
589 aa  296  8e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  34.66 
 
 
623 aa  296  9e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  31.43 
 
 
647 aa  293  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  33.71 
 
 
615 aa  292  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  34.31 
 
 
622 aa  290  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  36.03 
 
 
600 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  34.78 
 
 
620 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1306  DNA mismatch repair protein  33.99 
 
 
608 aa  286  5e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.66007  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  35.55 
 
 
600 aa  286  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  34.85 
 
 
611 aa  286  8e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  33.28 
 
 
623 aa  286  9e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  33.28 
 
 
623 aa  286  9e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  37.09 
 
 
582 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  35.66 
 
 
603 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1331  DNA mismatch repair protein MutL  35.2 
 
 
579 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  34.6 
 
 
605 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  35.66 
 
 
603 aa  284  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  32.7 
 
 
635 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0215  DNA mismatch repair protein MutL  33.5 
 
 
608 aa  282  1e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.137951 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  34.74 
 
 
648 aa  282  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1087  DNA mismatch repair protein MutL  35.56 
 
 
582 aa  281  3e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0917186  normal  0.0241297 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0293  DNA mismatch repair protein MutL  35.43 
 
 
532 aa  280  6e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  34.13 
 
 
635 aa  280  7e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  33.55 
 
 
616 aa  279  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  32.75 
 
 
626 aa  277  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  34.68 
 
 
617 aa  275  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  34.33 
 
 
595 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  34.33 
 
 
595 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  42.77 
 
 
639 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0776  DNA mismatch repair protein MutL  45.02 
 
 
755 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.287224  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  32.33 
 
 
633 aa  273  7e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1703  DNA mismatch repair protein  32.65 
 
 
618 aa  272  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346146  normal  0.342232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  34.87 
 
 
595 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  45.15 
 
 
692 aa  271  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  34.26 
 
 
597 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  33.44 
 
 
603 aa  270  4e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  31.17 
 
 
630 aa  270  7e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0509  DNA mismatch repair protein  31.97 
 
 
598 aa  268  2e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.587743  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6625  DNA mismatch repair protein MutL  33.7 
 
 
641 aa  268  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406254  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3308  DNA mismatch repair protein MutL  32.21 
 
 
664 aa  268  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0034  DNA mismatch repair protein MutL  35.08 
 
 
590 aa  268  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0086  DNA mismatch repair protein MutL  31.2 
 
 
633 aa  267  2.9999999999999995e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.243153  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  33.94 
 
 
598 aa  267  4e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  34.21 
 
 
597 aa  267  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  33 
 
 
594 aa  266  5.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>