More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0034 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0034  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 590 aa  1152    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  39.61 
 
 		 605 aa  353  5.9999999999999994e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  37.22 
 
 		 608 aa  352  8.999999999999999e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  36.59 
 
 		 631 aa  352  8.999999999999999e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  36.05 
 
 		 559 aa  352  2e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  37.83 
 
 		 605 aa  351  3e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  34.06 
 
 		 586 aa  350  5e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  39.67 
 
 		 607 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  39.67 
 
 		 607 aa  346  6e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  39.97 
 
 		 608 aa  346  6e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  36.57 
 
 		 647 aa  344  2.9999999999999997e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  35.79 
 
 		 603 aa  343  5e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  40.26 
 
 		 605 aa  341  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  35.43 
 
 		 619 aa  340  5e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  36.65 
 
 		 628 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  40.1 
 
 		 622 aa  338  1.9999999999999998e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  39.11 
 
 		 625 aa  336  5.999999999999999e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  38.98 
 
 		 619 aa  335  1e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  33.76 
 
 		 626 aa  334  3e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  33.76 
 
 		 626 aa  334  3e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  36.8 
 
 		 647 aa  333  4e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  35.69 
 
 		 566 aa  333  7.000000000000001e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  32.97 
 
 		 647 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  38.19 
 
 		 602 aa  333  7.000000000000001e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  32.97 
 
 		 647 aa  332  8e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  38.61 
 
 		 621 aa  332  9e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  32.98 
 
 		 649 aa  332  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  33.49 
 
 		 647 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  32.97 
 
 		 647 aa  332  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  33.18 
 
 		 647 aa  332  1e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  33.13 
 
 		 647 aa  331  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  38.74 
 
 		 611 aa  331  2e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  37.62 
 
 		 606 aa  331  3e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  37.44 
 
 		 620 aa  330  3e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  32.87 
 
 		 647 aa  331  3e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  33.13 
 
 		 644 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  36.39 
 
 		 623 aa  330  6e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  37.09 
 
 		 589 aa  329  7e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2946  DNA mismatch repair protein  38.55 
 
 		 629 aa  329  7e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  39.01 
 
 		 560 aa  329  9e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  37.7 
 
 		 612 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  32.72 
 
 		 572 aa  327  3e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  37.67 
 
 		 565 aa  327  4.0000000000000003e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  35.66 
 
 		 566 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  36.35 
 
 		 566 aa  327  5e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  37.28 
 
 		 630 aa  325  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  39.74 
 
 		 626 aa  325  2e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  38.06 
 
 		 620 aa  323  5e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  34.6 
 
 		 641 aa  323  6e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  38.83 
 
 		 601 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  35.29 
 
 		 650 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  37.99 
 
 		 608 aa  321  3e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  36.26 
 
 		 645 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  38.01 
 
 		 622 aa  321  3e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  38.6 
 
 		 620 aa  321  3e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  33.98 
 
 		 626 aa  320  6e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  30.69 
 
 		 665 aa  319  7e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  34.29 
 
 		 632 aa  319  9e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  33.06 
 
 		 614 aa  319  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  36.03 
 
 		 648 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  33.28 
 
 		 624 aa  319  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  34.47 
 
 		 639 aa  318  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  35.56 
 
 		 632 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  34.29 
 
 		 633 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  34.5 
 
 		 630 aa  317  3e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  35.97 
 
 		 635 aa  317  5e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  35.33 
 
 		 632 aa  316  7e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  34.45 
 
 		 626 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  36.01 
 
 		 641 aa  315  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  34.66 
 
 		 612 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  38.04 
 
 		 603 aa  314  3.9999999999999997e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  36.58 
 
 		 633 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  37.25 
 
 		 629 aa  313  4.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  36.42 
 
 		 633 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  34.23 
 
 		 575 aa  312  9e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  32.16 
 
 		 629 aa  312  1e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  37.05 
 
 		 611 aa  311  2e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  33.9 
 
 		 574 aa  311  2e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  37.03 
 
 		 585 aa  310  5e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  32.39 
 
 		 644 aa  309  8e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  30.81 
 
 		 659 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  36.54 
 
 		 617 aa  309  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  35.38 
 
 		 652 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  33.44 
 
 		 633 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  35.8 
 
 		 605 aa  307  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  35.61 
 
 		 644 aa  308  3e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0267  DNA mismatch repair protein MutL  33.6 
 
 		 622 aa  307  4.0000000000000004e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997696 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  31.19 
 
 		 656 aa  307  4.0000000000000004e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  37.15 
 
 		 602 aa  306  5.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  32.85 
 
 		 624 aa  306  6e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7371  DNA mismatch repair protein MutL  37.44 
 
 		 621 aa  306  8.000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  36.32 
 
 		 600 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  33.5 
 
 		 584 aa  305  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  36.18 
 
 		 612 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  30.94 
 
 		 647 aa  303  8.000000000000001e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1168  DNA mismatch repair protein  35.29 
 
 		 588 aa  302  1e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.985109  normal  0.444607 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  36.61 
 
 		 594 aa  302  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  33.83 
 
 		 603 aa  301  2e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  36.72 
 
 		 600 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  37.82 
 
 		 628 aa  300  3e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>