More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0629 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1289  DNA mismatch repair protein MutL  53.35 
 
 		 765 aa  689    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0007  DNA mismatch repair protein MutL  51.31 
 
 		 709 aa  669    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.953905  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0629  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 767 aa  1503    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0376  DNA mismatch repair protein MutL  62.69 
 
 		 709 aa  467  9.999999999999999e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.13305  normal  0.32452 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3218  DNA mismatch repair protein MutL  58.02 
 
 		 738 aa  448  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  28.31 
 
 		 669 aa  353  5.9999999999999994e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  48.07 
 
 		 605 aa  286  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0776  DNA mismatch repair protein MutL  43.53 
 
 		 755 aa  283  1e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.287224  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  43.11 
 
 		 559 aa  281  2e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  43.57 
 
 		 612 aa  280  9e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2458  DNA mismatch repair protein MutL  33.5 
 
 		 711 aa  280  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.593809 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  46.29 
 
 		 605 aa  278  4e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1729  DNA mismatch repair protein MutL  34.32 
 
 		 763 aa  277  6e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  42.81 
 
 		 640 aa  277  6e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  42.68 
 
 		 665 aa  276  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  43.53 
 
 		 631 aa  270  5.9999999999999995e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  46.55 
 
 		 620 aa  269  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1838  DNA mismatch repair protein MutL  43.26 
 
 		 692 aa  269  1e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0019765  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  43.07 
 
 		 586 aa  269  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  40.83 
 
 		 644 aa  268  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  42.18 
 
 		 647 aa  267  5e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  42.43 
 
 		 668 aa  266  1e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  35.33 
 
 		 656 aa  266  1e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  38.44 
 
 		 680 aa  265  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  44 
 
 		 602 aa  264  4e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  45.21 
 
 		 566 aa  264  4.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  45.21 
 
 		 566 aa  263  8e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  41 
 
 		 639 aa  263  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  41.88 
 
 		 647 aa  261  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  44.14 
 
 		 566 aa  261  4e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  41.55 
 
 		 650 aa  261  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  45.66 
 
 		 606 aa  261  5.0000000000000005e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  37.3 
 
 		 659 aa  259  1e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  40.95 
 
 		 692 aa  259  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  43.3 
 
 		 622 aa  259  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2732  DNA mismatch repair protein MutL  41.32 
 
 		 730 aa  258  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0867295  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  34.43 
 
 		 645 aa  256  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  47.29 
 
 		 565 aa  256  1.0000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1083  DNA mismatch repair protein  40.9 
 
 		 615 aa  256  1.0000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  46.25 
 
 		 560 aa  254  3e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  43.37 
 
 		 608 aa  254  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  41.42 
 
 		 647 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  42.23 
 
 		 599 aa  254  6e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0413  DNA mismatch repair protein  40.39 
 
 		 630 aa  254  6e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  41.12 
 
 		 626 aa  252  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  41.12 
 
 		 647 aa  252  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  41.12 
 
 		 626 aa  252  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  41.12 
 
 		 647 aa  253  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  41.12 
 
 		 647 aa  252  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  41.12 
 
 		 647 aa  252  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  41.12 
 
 		 647 aa  252  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  40.53 
 
 		 644 aa  252  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  39.78 
 
 		 648 aa  251  3e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  40.83 
 
 		 647 aa  251  4e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2779  DNA mismatch repair protein  41.49 
 
 		 652 aa  251  5e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2380  DNA mismatch repair protein MutL  40.89 
 
 		 695 aa  249  9e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0323  DNA mismatch repair protein MutL  40.9 
 
 		 652 aa  249  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  48.6 
 
 		 633 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  40.53 
 
 		 649 aa  249  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  48.29 
 
 		 633 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  40.65 
 
 		 614 aa  248  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  45.24 
 
 		 635 aa  248  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1041  DNA mismatch repair protein MutL  37.47 
 
 		 606 aa  248  3e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  41.87 
 
 		 603 aa  248  3e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  47.81 
 
 		 641 aa  248  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  45.86 
 
 		 623 aa  248  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  42.49 
 
 		 589 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1172  DNA mismatch repair protein  37.5 
 
 		 674 aa  247  6e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  38.93 
 
 		 628 aa  246  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  40.11 
 
 		 619 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1359  DNA mismatch repair protein  37.5 
 
 		 674 aa  246  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002257  DNA mismatch repair protein MutL  40.76 
 
 		 670 aa  245  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.558957  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  44.64 
 
 		 636 aa  245  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  43.94 
 
 		 648 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  42.68 
 
 		 628 aa  244  3e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  43.13 
 
 		 608 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00096  DNA mismatch repair protein  40.35 
 
 		 681 aa  244  3.9999999999999997e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  44.94 
 
 		 647 aa  244  5e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  40 
 
 		 612 aa  243  7e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  39.72 
 
 		 647 aa  243  7.999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04037  DNA mismatch repair protein  42.56 
 
 		 615 aa  243  9e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0484513  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3823  DNA mismatch repair protein MutL  42.56 
 
 		 615 aa  243  9e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000414583  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  43.4 
 
 		 645 aa  243  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4701  DNA mismatch repair protein  42.56 
 
 		 615 aa  243  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915673  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3240  DNA mismatch repair protein MutL  35.49 
 
 		 628 aa  243  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4412  DNA mismatch repair protein  42.56 
 
 		 615 aa  243  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0194282  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4728  DNA mismatch repair protein  42.56 
 
 		 615 aa  243  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0929403  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0353  DNA mismatch repair protein  41.96 
 
 		 613 aa  242  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.114284  hitchhiker  0.00160708 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3843  DNA mismatch repair protein  42.56 
 
 		 615 aa  242  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000795964  hitchhiker  0.000000387336 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  42.32 
 
 		 585 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0429  DNA mismatch repair protein  42.69 
 
 		 624 aa  241  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000237281  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4641  DNA mismatch repair protein  42.56 
 
 		 615 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.231193  normal  0.0766044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5686  DNA mismatch repair protein  42.56 
 
 		 615 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000161678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  40.13 
 
 		 584 aa  241  2.9999999999999997e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3723  DNA mismatch repair protein  42.39 
 
 		 669 aa  241  5e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0150049  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0023  DNA mismatch repair protein MutL  38.11 
 
 		 621 aa  241  5e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000493473  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4777  DNA mismatch repair protein  42.26 
 
 		 618 aa  241  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00171491  normal  0.0289843 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4627  DNA mismatch repair protein  42.26 
 
 		 618 aa  240  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4637  DNA mismatch repair protein  42.26 
 
 		 618 aa  240  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000512951  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4756  DNA mismatch repair protein  42.26 
 
 		 618 aa  240  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>