51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1455 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1455  hypothetical protein  100 
 
 		 860 aa  1746    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.316955 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1575  histidine kinase  34.78 
 
 		 684 aa  68.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000414678  decreased coverage  0.0000074807 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36080  ATP binding/ATPase (HATPase_c) domain-containing protein  33.33 
 
 		 723 aa  66.6  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.785122  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3436  hypothetical protein  32.58 
 
 		 667 aa  63.9  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0529  hypothetical protein  38.6 
 
 		 609 aa  60.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.320462  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4208  ATP-binding region ATPase domain protein  30.67 
 
 		 589 aa  58.9  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136628  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0495  ATP-binding region ATPase domain protein  30 
 
 		 598 aa  57  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5718  Molecular chaperone HSP90 family-like protein  28.25 
 
 		 872 aa  55.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.903577 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50590  HSP90 family protein  31.36 
 
 		 636 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0617525 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4377  ATPase domain-containing protein  33.06 
 
 		 594 aa  53.9  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01954  Hsp90xo protein  31.36 
 
 		 622 aa  53.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3988  hypothetical protein  32.54 
 
 		 682 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.544109  hitchhiker  0.00814406 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4309  HSP90 family protein  31.36 
 
 		 617 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2655  histidine kinase  31.88 
 
 		 771 aa  53.1  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0835586 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0504  signal transduction protein, histidine kinase  32.54 
 
 		 997 aa  52.8  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.284164  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0268  histidine kinase  27.52 
 
 		 738 aa  52.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1779  ATP-binding region ATPase domain protein  30.83 
 
 		 613 aa  52.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1146  Hsp90xo protein  32.2 
 
 		 618 aa  52  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3949  histidine kinase  27.13 
 
 		 679 aa  52  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5466  HSP90 family protein  30.33 
 
 		 585 aa  52  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0695  HSP90 family protein  33.83 
 
 		 643 aa  52  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4308  hypothetical protein  29.71 
 
 		 702 aa  51.6  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0554257  normal  0.0504363 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2565  histidine kinase  23.35 
 
 		 796 aa  51.2  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0961  hypothetical protein  31.21 
 
 		 587 aa  51.2  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.598783  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1643  hypothetical protein  33.05 
 
 		 361 aa  50.4  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4376  HSP90 family molecular chaperone-like  30.08 
 
 		 838 aa  48.5  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1589  hypothetical protein  30.84 
 
 		 698 aa  47.8  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242692  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0286  hypothetical protein  30.65 
 
 		 681 aa  47.8  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0684  hypothetical protein  27.21 
 
 		 673 aa  47.8  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.093919  hitchhiker  0.000000000000985329 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0570  ATPase domain-containing protein  25.6 
 
 		 720 aa  47.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.208854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2516  putative prophage encoded two-component system histidine kinase  30.41 
 
 		 774 aa  47.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222494  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5302  heat shock protein 90  34.09 
 
 		 628 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1831  HSP90 family protein  27.87 
 
 		 646 aa  46.2  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4625  histidine kinase  26.17 
 
 		 756 aa  47  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.402141 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0243  heat shock protein 90  26.92 
 
 		 650 aa  47  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5377  Heat shock protein Hsp90-like protein  29.68 
 
 		 657 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4676  heat shock protein 90  25 
 
 		 657 aa  46.6  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4692  heat shock protein 90  34.09 
 
 		 628 aa  45.8  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.595162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2572  HSP90 family molecular chaperone-like protein  25.17 
 
 		 881 aa  46.2  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710884  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2441  histidine kinase  24.82 
 
 		 674 aa  46.2  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.459087  unclonable  0.00000000106284 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23829  Heat Shock Protein 90  28.03 
 
 		 711 aa  45.8  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2463  HSP90 family protein  26.98 
 
 		 621 aa  45.1  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0779682  decreased coverage  0.00689697 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0595  hypothetical protein  25.79 
 
 		 629 aa  45.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1326  heat shock protein 90  28.89 
 
 		 624 aa  45.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4402  heat shock protein 90  30.08 
 
 		 628 aa  45.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0749  histidine kinase  27.52 
 
 		 722 aa  45.1  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4279  Hsp90xo protein  26.97 
 
 		 608 aa  45.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3158  heat shock protein HtpG  30.46 
 
 		 629 aa  44.7  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.705865  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2755  heat shock protein Hsp90  30.46 
 
 		 629 aa  44.7  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613989  hitchhiker  0.00227659 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0450  heat shock protein 90  31.11 
 
 		 626 aa  44.7  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16786  predicted protein  27.41 
 
 		 716 aa  44.7  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>