22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0286 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0286  hypothetical protein  100 
 
 		 681 aa  1395    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0109  hypothetical protein  24.02 
 
 		 672 aa  182  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2739  putative DNA mismatch repair protein  23.94 
 
 		 660 aa  156  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.281456  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4307  putative DNA mismatch repair protein  24.38 
 
 		 618 aa  122  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237873  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2277  hypothetical protein  21.41 
 
 		 672 aa  90.1  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00219668  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1701  hypothetical protein  21.41 
 
 		 672 aa  90.1  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000152593  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1317  hypothetical protein  21.8 
 
 		 625 aa  80.1  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1565  hypothetical protein  23.53 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0961  hypothetical protein  23.73 
 
 		 587 aa  56.2  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.598783  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3988  hypothetical protein  35.58 
 
 		 682 aa  52  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.544109  hitchhiker  0.00814406 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0529  hypothetical protein  28.99 
 
 		 609 aa  52  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.320462  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3436  hypothetical protein  30.71 
 
 		 667 aa  50.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0268  histidine kinase  35.63 
 
 		 738 aa  50.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0684  hypothetical protein  27.4 
 
 		 673 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.093919  hitchhiker  0.000000000000985329 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1455  hypothetical protein  30.65 
 
 		 860 aa  47.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.316955 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2441  histidine kinase  36.71 
 
 		 674 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.459087  unclonable  0.00000000106284 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00320  hypothetical protein  27.07 
 
 		 584 aa  46.2  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0570  ATPase domain-containing protein  28.92 
 
 		 720 aa  45.8  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.208854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  36.75 
 
 		 636 aa  45.1  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1643  hypothetical protein  30.39 
 
 		 361 aa  44.7  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54331  mutl-like protein 1  34.09 
 
 		 695 aa  43.9  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719113  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  39.68 
 
 		 608 aa  43.9  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>