71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0961 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0961  hypothetical protein  100 
 
 
587 aa  1194    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.598783  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00320  hypothetical protein  41.84 
 
 
584 aa  441  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2091  hypothetical protein  24.26 
 
 
642 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1062  hypothetical protein  23.81 
 
 
644 aa  97.1  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.183826  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3853  hypothetical protein  26.74 
 
 
662 aa  83.2  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000936749  normal  0.0170599 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4222  hypothetical protein  19.82 
 
 
640 aa  81.3  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0684  hypothetical protein  23.59 
 
 
673 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.093919  hitchhiker  0.000000000000985329 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36080  ATP binding/ATPase (HATPase_c) domain-containing protein  33.91 
 
 
723 aa  75.1  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.785122  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2441  histidine kinase  29.11 
 
 
674 aa  72  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.459087  unclonable  0.00000000106284 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0268  histidine kinase  24.4 
 
 
738 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2202  DNA mismatch repair ATPase-like protein  25 
 
 
651 aa  67.8  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000849326  normal  0.525867 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4053  hypothetical protein  27.08 
 
 
364 aa  67  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0749  histidine kinase  33.49 
 
 
722 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1643  hypothetical protein  30.98 
 
 
361 aa  65.9  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0529  hypothetical protein  44.19 
 
 
609 aa  63.9  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.320462  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2565  histidine kinase  37.5 
 
 
796 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4625  histidine kinase  24.34 
 
 
756 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.402141 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1589  hypothetical protein  32.97 
 
 
698 aa  61.6  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242692  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2655  histidine kinase  24.29 
 
 
771 aa  60.8  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0835586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1489  histidine kinase  25.5 
 
 
774 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1182  hypothetical protein  28.42 
 
 
671 aa  59.3  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0023926  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1243  hypothetical protein  30.3 
 
 
240 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000596031  hitchhiker  0.000000000136742 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0570  ATPase domain-containing protein  27.64 
 
 
720 aa  58.2  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.208854  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4048  histidine kinase  31.35 
 
 
773 aa  57.4  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1575  histidine kinase  28.14 
 
 
684 aa  57  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000414678  decreased coverage  0.0000074807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4308  hypothetical protein  32.76 
 
 
702 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0554257  normal  0.0504363 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3949  histidine kinase  33.9 
 
 
679 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3436  hypothetical protein  38.14 
 
 
667 aa  55.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0286  hypothetical protein  23.73 
 
 
681 aa  56.2  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3783  histidine kinase  29.82 
 
 
946 aa  53.9  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377863  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1181  histidine kinase  28.48 
 
 
719 aa  53.5  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.798724  normal  0.0930045 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1455  hypothetical protein  31.21 
 
 
860 aa  51.2  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.316955 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0911  heat shock protein 90  25.85 
 
 
627 aa  50.8  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0079  histidine kinase  34.45 
 
 
987 aa  50.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217254  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0495  ATP-binding region ATPase domain protein  30.06 
 
 
598 aa  49.3  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0800  heat shock protein 90  25.78 
 
 
633 aa  48.9  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0504  signal transduction protein, histidine kinase  25.55 
 
 
997 aa  48.1  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.284164  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5686  heat shock protein 90  25.95 
 
 
632 aa  47.4  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2005  heat shock protein 90  23.62 
 
 
656 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2390  heat shock protein 90  25.3 
 
 
650 aa  47  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004137  chaperone protein HtpG  24.62 
 
 
634 aa  46.6  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1005  heat shock protein 90  25.94 
 
 
632 aa  46.2  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.406773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1158  heat shock protein 90  25.94 
 
 
632 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.789148  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1549  heat shock protein 90  26.5 
 
 
630 aa  45.8  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.678256  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1167  heat shock protein 90  25.94 
 
 
632 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1318  heat shock protein 90  25.94 
 
 
632 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.443077  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0289  heat shock protein 90  25.94 
 
 
632 aa  46.2  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0932  heat shock protein 90  27.08 
 
 
632 aa  46.2  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294237  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0859  heat shock protein 90  25.94 
 
 
632 aa  46.2  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1195  heat shock protein 90  23.08 
 
 
628 aa  46.2  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0484  heat shock protein 90  27.08 
 
 
662 aa  45.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1947  heat shock protein 90  25.94 
 
 
632 aa  46.2  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.76829  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2342  heat shock protein 90  23.89 
 
 
633 aa  45.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0956  heat shock protein 90  29.44 
 
 
634 aa  45.1  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.538924  normal  0.713469 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0301  histidine kinase  30 
 
 
994 aa  45.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2263  heat shock protein 90  28.47 
 
 
632 aa  45.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0371  histidine kinase  26.24 
 
 
989 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4127  heat shock protein 90  24.46 
 
 
669 aa  44.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745159  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2368  heat shock protein 90  26.39 
 
 
632 aa  44.3  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231362  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1735  heat shock protein 90  26.39 
 
 
632 aa  44.3  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4377  ATPase domain-containing protein  28.91 
 
 
594 aa  44.3  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2347  heat shock protein 90  26.39 
 
 
632 aa  44.3  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.75134  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2489  heat shock protein 90  26.43 
 
 
628 aa  43.9  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.356578 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2516  putative prophage encoded two-component system histidine kinase  23.23 
 
 
774 aa  44.3  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222494  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2383  heat shock protein 90  26.39 
 
 
632 aa  43.9  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4208  ATP-binding region ATPase domain protein  31.34 
 
 
589 aa  43.9  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136628  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0466  heat shock protein 90  27.78 
 
 
650 aa  43.9  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2498  heat shock protein 90  24.51 
 
 
650 aa  43.9  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000559019  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4289  heat shock protein 90  27.08 
 
 
668 aa  43.9  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0475  heat shock protein 90  27.78 
 
 
650 aa  43.9  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0953677 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0506  heat shock protein 90  24.87 
 
 
635 aa  43.9  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>