97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1643 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1643  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  734    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3853  hypothetical protein  28.42 
 
 		 662 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000936749  normal  0.0170599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1182  hypothetical protein  27.12 
 
 		 671 aa  107  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0023926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2202  DNA mismatch repair ATPase-like protein  28.92 
 
 		 651 aa  104  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000849326  normal  0.525867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0529  hypothetical protein  27.33 
 
 		 609 aa  99.4  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.320462  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0684  hypothetical protein  25 
 
 		 673 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.093919  hitchhiker  0.000000000000985329 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1589  hypothetical protein  41.75 
 
 		 698 aa  70.5  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242692  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0961  hypothetical protein  30.98 
 
 		 587 aa  65.9  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.598783  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2565  histidine kinase  32.14 
 
 		 796 aa  60.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0268  histidine kinase  25.76 
 
 		 738 aa  60.5  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4048  histidine kinase  32.61 
 
 		 773 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3436  hypothetical protein  25.42 
 
 		 667 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4308  hypothetical protein  36.03 
 
 		 702 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0554257  normal  0.0504363 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3949  histidine kinase  26.99 
 
 		 679 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4053  hypothetical protein  33.33 
 
 		 364 aa  55.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36080  ATP binding/ATPase (HATPase_c) domain-containing protein  34.51 
 
 		 723 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.785122  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4376  HSP90 family molecular chaperone-like  30.88 
 
 		 838 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00320  hypothetical protein  31.85 
 
 		 584 aa  54.7  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4377  ATPase domain-containing protein  25 
 
 		 594 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4625  histidine kinase  28.68 
 
 		 756 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.402141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2091  hypothetical protein  30.92 
 
 		 642 aa  53.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1771  heat shock protein 90  27.15 
 
 		 633 aa  53.1  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000171528  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0416  heat shock protein 90  27.15 
 
 		 633 aa  53.1  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000647765  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0301  histidine kinase  32.11 
 
 		 994 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0570  ATPase domain-containing protein  25 
 
 		 720 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.208854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1017  heat shock protein 90  28.57 
 
 		 628 aa  50.4  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000769643  normal  0.045663 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0873  heat shock protein 90  28.57 
 
 		 628 aa  50.4  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000721641  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2516  putative prophage encoded two-component system histidine kinase  30 
 
 		 774 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222494  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1455  hypothetical protein  33.05 
 
 		 860 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.316955 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1407  Heat shock protein Hsp90-like protein  24.71 
 
 		 623 aa  50.8  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1181  histidine kinase  30.17 
 
 		 719 aa  50.8  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.798724  normal  0.0930045 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1062  hypothetical protein  26.4 
 
 		 644 aa  50.1  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.183826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2441  histidine kinase  28.07 
 
 		 674 aa  50.4  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.459087  unclonable  0.00000000106284 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0371  histidine kinase  32.08 
 
 		 989 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2299  heat shock protein 90  33.09 
 
 		 637 aa  50.1  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000323275  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3783  histidine kinase  23.64 
 
 		 946 aa  49.7  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377863  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2655  histidine kinase  34.69 
 
 		 771 aa  49.3  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0835586 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2016  heat shock protein 90  33.09 
 
 		 637 aa  48.9  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2251  heat shock protein 90  33.09 
 
 		 637 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000711928  normal  0.266626 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  33.86 
 
 		 622 aa  49.3  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13490  heat shock protein 90  27.65 
 
 		 632 aa  48.9  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1800  heat shock protein Hsp90  25.77 
 
 		 646 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3087  heat shock protein 90  30.5 
 
 		 606 aa  49.3  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2443  heat shock protein 90  33.09 
 
 		 637 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000425948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4222  hypothetical protein  26.94 
 
 		 640 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1158  hypothetical protein  32.14 
 
 		 971 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0746072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2323  heat shock protein 90  33.09 
 
 		 637 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000423215  hitchhiker  0.000689405 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2586  heat shock protein 90  31.85 
 
 		 637 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000082742  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1313  heat shock protein 90  33.33 
 
 		 637 aa  47.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.133282 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2548  heat shock protein 90  31.85 
 
 		 637 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00763476  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2663  heat shock protein 90  31.85 
 
 		 637 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0275177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  32.2 
 
 		 629 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1086  heat shock protein 90  27.61 
 
 		 623 aa  47.8  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1798  heat shock protein 90  31.85 
 
 		 637 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145006 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0911  hypothetical protein  31.53 
 
 		 561 aa  47.4  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00412972  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1497  ATPase domain-containing protein  27.63 
 
 		 945 aa  47.4  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0028368  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0960  heat shock protein 90  26.83 
 
 		 626 aa  47  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.515332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  27.07 
 
 		 608 aa  46.6  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1428  heat shock protein 90  31.06 
 
 		 637 aa  46.6  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000680402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1243  hypothetical protein  29.66 
 
 		 240 aa  46.2  0.0009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000596031  hitchhiker  0.000000000136742 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1155  heat shock protein 90  27.85 
 
 		 626 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_55215  heat shock protein Hsp90  28.67 
 
 		 780 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1489  histidine kinase  29.91 
 
 		 774 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5467  heat shock protein 90  28.67 
 
 		 610 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.306325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1028  heat shock protein 90  27.85 
 
 		 626 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162426  normal  0.169491 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4208  ATP-binding region ATPase domain protein  30.47 
 
 		 589 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136628  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1538  heat shock protein 90  31.58 
 
 		 637 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0309955  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1188  heat shock protein 90  28.85 
 
 		 626 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0749  histidine kinase  29.01 
 
 		 722 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3988  hypothetical protein  30.28 
 
 		 682 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.544109  hitchhiker  0.00814406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1575  histidine kinase  30.71 
 
 		 684 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000414678  decreased coverage  0.0000074807 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2852  heat shock protein 90  27.78 
 
 		 669 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0504  signal transduction protein, histidine kinase  31.43 
 
 		 997 aa  44.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.284164  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  36.17 
 
 		 572 aa  44.3  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0286  hypothetical protein  30.39 
 
 		 681 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3901  heat shock protein 90  28.89 
 
 		 653 aa  44.3  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.795746  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0079  histidine kinase  28.57 
 
 		 987 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217254  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0401  heat shock protein 90  27.71 
 
 		 617 aa  43.9  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1998  heat shock protein 90  25.29 
 
 		 666 aa  43.9  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.154063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0044  heat shock protein 90  26.45 
 
 		 611 aa  43.5  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2009  heat shock protein 90  27.33 
 
 		 613 aa  43.5  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4127  heat shock protein 90  29.58 
 
 		 669 aa  43.5  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1054  heat shock protein 90  27.17 
 
 		 630 aa  43.5  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374422  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1323  heat shock protein 90  28.79 
 
 		 623 aa  43.5  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1320  heat shock protein 90  28.79 
 
 		 623 aa  43.5  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23829  Heat Shock Protein 90  27.75 
 
 		 711 aa  43.1  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5569  DNA mismatch repair protein MutL  27.89 
 
 		 685 aa  43.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.590077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2007  heat shock protein 90  26.7 
 
 		 652 aa  43.1  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0450  heat shock protein 90  26.49 
 
 		 626 aa  43.1  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00313  heat shock protein 90  28.79 
 
 		 634 aa  43.1  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4168  heat shock protein 90  28.16 
 
 		 629 aa  43.1  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.160009  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0814  heat shock protein 90  26.32 
 
 		 632 aa  43.1  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3489  heat shock protein 90  29.13 
 
 		 665 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.179421 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2390  heat shock protein 90  27.11 
 
 		 650 aa  42.7  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2614  heat shock protein 90  29.13 
 
 		 665 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2263  heat shock protein 90  26.87 
 
 		 632 aa  42.7  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1264  heat shock protein 90  27.43 
 
 		 630 aa  42.7  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0853768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>