35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4307 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_4307  putative DNA mismatch repair protein  100 
 
 
618 aa  1267    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237873  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2739  putative DNA mismatch repair protein  42.11 
 
 
660 aa  522  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.281456  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0109  hypothetical protein  29.28 
 
 
672 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1565  hypothetical protein  26.85 
 
 
403 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0286  hypothetical protein  24.38 
 
 
681 aa  122  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1317  hypothetical protein  26.96 
 
 
625 aa  60.1  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2277  hypothetical protein  26.96 
 
 
672 aa  59.7  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00219668  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1701  hypothetical protein  26.96 
 
 
672 aa  59.7  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000152593  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1062  hypothetical protein  21.01 
 
 
644 aa  48.5  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.183826  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02500  ATPase, putative  31.06 
 
 
939 aa  48.1  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.791376  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1489  histidine kinase  31.9 
 
 
774 aa  47.4  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  32.43 
 
 
625 aa  46.6  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2756  DNA mismatch repair protein  37.84 
 
 
653 aa  45.8  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  37.31 
 
 
669 aa  46.2  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2516  putative prophage encoded two-component system histidine kinase  26.42 
 
 
774 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222494  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  35.82 
 
 
647 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  35.82 
 
 
647 aa  44.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  35.82 
 
 
647 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  35.82 
 
 
647 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  35.82 
 
 
647 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54331  mutl-like protein 1  28.39 
 
 
695 aa  45.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719113  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  35.82 
 
 
647 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  32.69 
 
 
648 aa  45.1  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  35.82 
 
 
626 aa  44.7  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  35.82 
 
 
644 aa  44.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3542  DNA mismatch repair protein  37.68 
 
 
628 aa  44.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  35.82 
 
 
647 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  35.82 
 
 
649 aa  44.7  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  35.82 
 
 
626 aa  44.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2754  DNA mismatch repair protein  27.4 
 
 
634 aa  44.7  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3783  histidine kinase  28.57 
 
 
946 aa  43.9  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377863  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002257  DNA mismatch repair protein MutL  37.84 
 
 
670 aa  43.9  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.558957  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2779  DNA mismatch repair protein  39.13 
 
 
652 aa  43.9  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2946  DNA mismatch repair protein  37.31 
 
 
629 aa  43.9  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  35.82 
 
 
645 aa  43.5  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>