23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1062 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1062  hypothetical protein  100 
 
 		 644 aa  1317    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.183826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4222  hypothetical protein  42.46 
 
 		 640 aa  493  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2091  hypothetical protein  30.59 
 
 		 642 aa  286  8e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4053  hypothetical protein  33.24 
 
 		 364 aa  159  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0961  hypothetical protein  23.81 
 
 		 587 aa  97.1  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.598783  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00320  hypothetical protein  20.84 
 
 		 584 aa  76.3  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4465  hypothetical protein  32.2 
 
 		 120 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.331457  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1643  hypothetical protein  26.4 
 
 		 361 aa  50.1  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0749  histidine kinase  30.65 
 
 		 722 aa  50.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3853  hypothetical protein  23.67 
 
 		 662 aa  50.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000936749  normal  0.0170599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1182  hypothetical protein  25.25 
 
 		 671 aa  49.3  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0023926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1181  histidine kinase  28.44 
 
 		 719 aa  48.9  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.798724  normal  0.0930045 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4307  putative DNA mismatch repair protein  21.01 
 
 		 618 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237873  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0301  histidine kinase  35.9 
 
 		 994 aa  48.1  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0504  signal transduction protein, histidine kinase  31.67 
 
 		 997 aa  47.8  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.284164  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0684  hypothetical protein  25.12 
 
 		 673 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.093919  hitchhiker  0.000000000000985329 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3783  histidine kinase  38.14 
 
 		 946 aa  47  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377863  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2655  histidine kinase  31.36 
 
 		 771 aa  45.8  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0835586 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3988  hypothetical protein  28.18 
 
 		 682 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.544109  hitchhiker  0.00814406 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2202  DNA mismatch repair ATPase-like protein  22.71 
 
 		 651 aa  45.4  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000849326  normal  0.525867 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0079  histidine kinase  33.61 
 
 		 987 aa  45.4  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217254  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0529  hypothetical protein  25 
 
 		 609 aa  45.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.320462  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36080  ATP binding/ATPase (HATPase_c) domain-containing protein  23.73 
 
 		 723 aa  43.9  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.785122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>