14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0109 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0109  hypothetical protein  100 
 
 		 672 aa  1379    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2739  putative DNA mismatch repair protein  27.33 
 
 		 660 aa  239  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.281456  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4307  putative DNA mismatch repair protein  29.28 
 
 		 618 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237873  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1565  hypothetical protein  33.5 
 
 		 403 aa  211  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0286  hypothetical protein  24.02 
 
 		 681 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1701  hypothetical protein  28 
 
 		 672 aa  71.2  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000152593  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2277  hypothetical protein  28 
 
 		 672 aa  71.2  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00219668  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1317  hypothetical protein  28.41 
 
 		 625 aa  70.9  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0529  hypothetical protein  28.65 
 
 		 609 aa  50.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.320462  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0268  histidine kinase  27.84 
 
 		 738 aa  46.6  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1243  hypothetical protein  33.68 
 
 		 240 aa  46.6  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000596031  hitchhiker  0.000000000136742 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2390  histidine kinase  30.56 
 
 		 757 aa  46.6  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.534498  normal  0.927047 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3783  histidine kinase  29.47 
 
 		 946 aa  44.3  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377863  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2066  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 762 aa  43.9  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111352  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>