52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0684 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0684  hypothetical protein  100 
 
 		 673 aa  1372    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.093919  hitchhiker  0.000000000000985329 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3853  hypothetical protein  36.83 
 
 		 662 aa  362  1e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000936749  normal  0.0170599 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2202  DNA mismatch repair ATPase-like protein  36.82 
 
 		 651 aa  356  6.999999999999999e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000849326  normal  0.525867 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1182  hypothetical protein  35.94 
 
 		 671 aa  340  5e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0023926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0529  hypothetical protein  35.54 
 
 		 609 aa  196  8.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.320462  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4308  hypothetical protein  22.86 
 
 		 702 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0554257  normal  0.0504363 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1643  hypothetical protein  25 
 
 		 361 aa  82  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0961  hypothetical protein  23.59 
 
 		 587 aa  79.3  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.598783  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36080  ATP binding/ATPase (HATPase_c) domain-containing protein  32.53 
 
 		 723 aa  73.9  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.785122  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4222  hypothetical protein  30.09 
 
 		 640 aa  67.4  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0301  histidine kinase  31.53 
 
 		 994 aa  67  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00320  hypothetical protein  23.82 
 
 		 584 aa  64.3  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1589  hypothetical protein  37.4 
 
 		 698 aa  63.9  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242692  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3783  histidine kinase  32.38 
 
 		 946 aa  57.8  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377863  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0268  histidine kinase  31.19 
 
 		 738 aa  57  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3949  histidine kinase  27.78 
 
 		 679 aa  57  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0504  signal transduction protein, histidine kinase  26.52 
 
 		 997 aa  56.6  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.284164  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  31.98 
 
 		 584 aa  55.1  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3436  hypothetical protein  27.56 
 
 		 667 aa  53.9  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0079  histidine kinase  30.36 
 
 		 987 aa  53.5  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217254  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4048  histidine kinase  25.86 
 
 		 773 aa  53.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3944  hypothetical protein  28.49 
 
 		 533 aa  52.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.825946  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0371  histidine kinase  31.3 
 
 		 989 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4053  hypothetical protein  28.47 
 
 		 364 aa  53.1  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0749  histidine kinase  35.96 
 
 		 722 aa  51.6  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1158  hypothetical protein  32.74 
 
 		 971 aa  51.6  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0746072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2565  histidine kinase  25.98 
 
 		 796 aa  51.2  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1489  histidine kinase  28.95 
 
 		 774 aa  50.8  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1181  histidine kinase  25.36 
 
 		 719 aa  50.8  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.798724  normal  0.0930045 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2441  histidine kinase  29 
 
 		 674 aa  50.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.459087  unclonable  0.00000000106284 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2516  putative prophage encoded two-component system histidine kinase  26.67 
 
 		 774 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222494  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2091  hypothetical protein  27.43 
 
 		 642 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2655  histidine kinase  27.69 
 
 		 771 aa  49.3  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0835586 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4587  histidine kinase  27.67 
 
 		 784 aa  48.9  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0911  heat shock protein 90  23.66 
 
 		 627 aa  48.5  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0286  hypothetical protein  27.4 
 
 		 681 aa  48.5  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1455  hypothetical protein  27.21 
 
 		 860 aa  47.8  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.316955 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1062  hypothetical protein  25.12 
 
 		 644 aa  46.6  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.183826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1764  heat shock protein 90  25.26 
 
 		 615 aa  47  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000444601  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4673  heat shock protein 90  26.45 
 
 		 631 aa  46.6  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25549  normal  0.0194601 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1188  heat shock protein 90  21.07 
 
 		 626 aa  46.2  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1779  ATP-binding region ATPase domain protein  25.51 
 
 		 613 aa  45.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1404  heat shock protein 90  20.95 
 
 		 634 aa  46.2  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.197773  normal  0.898305 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0800  heat shock protein 90  24.77 
 
 		 633 aa  45.8  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1243  hypothetical protein  26.24 
 
 		 240 aa  45.8  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000596031  hitchhiker  0.000000000136742 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4625  histidine kinase  25.83 
 
 		 756 aa  45.8  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.402141 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09831  heat shock protein 90  22.67 
 
 		 634 aa  45.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3988  hypothetical protein  25.98 
 
 		 682 aa  45.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.544109  hitchhiker  0.00814406 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6991  heat shock protein Hsp90  21.89 
 
 		 611 aa  44.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854649 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5351  heat shock protein 90  26.32 
 
 		 630 aa  45.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.514382 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4208  ATP-binding region ATPase domain protein  24.64 
 
 		 589 aa  44.7  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136628  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1575  histidine kinase  25 
 
 		 684 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000414678  decreased coverage  0.0000074807 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>