288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6991 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0045  heat shock protein 90  56.11 
 
 
684 aa  676    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1459  ATP-binding region ATPase domain protein  61.65 
 
 
610 aa  763    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115769  normal  0.894104 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6991  heat shock protein Hsp90  100 
 
 
611 aa  1259    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00854649 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0051  heat shock protein 90  55.48 
 
 
629 aa  700    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.544882  normal  0.404377 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0260  heat shock protein 90  54.76 
 
 
627 aa  647    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.694865  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07530  chaperone protein HtpG  54.02 
 
 
633 aa  656    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.583875  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5199  heat shock protein 90  56.34 
 
 
610 aa  707    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661804  normal  0.486638 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0477  heat shock protein 90  56.31 
 
 
604 aa  679    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.333443  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0943  heat shock protein 90  52.4 
 
 
603 aa  651    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0019  heat shock protein 90  53.34 
 
 
631 aa  632  1e-180  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2005  heat shock protein 90  41.5 
 
 
656 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1764  heat shock protein 90  44.01 
 
 
615 aa  521  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000444601  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1199  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  43.06 
 
 
652 aa  518  1e-146  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0141  heat shock protein 90  42.64 
 
 
658 aa  509  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0358231  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1813  heat shock protein 90  41.57 
 
 
638 aa  506  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.138988  normal  0.331097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2852  heat shock protein 90  40.93 
 
 
669 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4127  heat shock protein 90  40.12 
 
 
669 aa  498  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745159  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1404  heat shock protein 90  40.79 
 
 
634 aa  492  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.197773  normal  0.898305 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09791  heat shock protein 90  42.19 
 
 
634 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.275736 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0306  heat shock protein 90  42.15 
 
 
634 aa  492  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0856617  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2614  heat shock protein 90  39.91 
 
 
665 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3489  heat shock protein 90  39.91 
 
 
665 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.179421 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08591  heat shock protein 90  42.61 
 
 
632 aa  488  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.559201  hitchhiker  0.00238922 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15251  heat shock protein 90  40.9 
 
 
636 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.339946 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0492  heat shock protein 90  40.38 
 
 
634 aa  479  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138197  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0550  heat shock protein 90  41.81 
 
 
634 aa  475  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.114569  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09831  heat shock protein 90  41.06 
 
 
634 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09581  heat shock protein 90  41.19 
 
 
634 aa  467  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3369  heat shock protein 90  39.91 
 
 
677 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000119649  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1082  heat shock protein 90  40.54 
 
 
634 aa  466  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09601  heat shock protein 90  40.56 
 
 
634 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.237308  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0899  heat shock protein 90  39.94 
 
 
634 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.460903  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2002  heat shock protein 90  31.13 
 
 
613 aa  282  1e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.240397 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2009  heat shock protein 90  30.69 
 
 
613 aa  271  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3230  heat shock protein 90  33.26 
 
 
614 aa  268  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000011209  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2489  heat shock protein 90  29.72 
 
 
628 aa  266  5.999999999999999e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.356578 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4168  heat shock protein 90  27.63 
 
 
629 aa  262  1e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.160009  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0607  heat shock protein 90  33.4 
 
 
637 aa  258  3e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1264  heat shock protein 90  36.93 
 
 
630 aa  253  1e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0853768  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4301  heat shock protein 90  26.45 
 
 
627 aa  249  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00424  heat shock protein 90  29.43 
 
 
624 aa  246  6e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.318011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3137  heat shock protein Hsp90  29.43 
 
 
624 aa  246  6e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145833  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00429  hypothetical protein  29.43 
 
 
624 aa  246  6e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0564  heat shock protein 90  29.43 
 
 
624 aa  246  6e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0215188  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0516  heat shock protein 90  29.43 
 
 
624 aa  246  6e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117874  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0550  heat shock protein 90  29.43 
 
 
624 aa  246  6e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0208648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3143  heat shock protein 90  29.43 
 
 
624 aa  246  6e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00327164  normal  0.0320085 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0511  heat shock protein 90  29.43 
 
 
624 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00679401  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0072  heat shock protein 90  33.77 
 
 
626 aa  246  8e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1609  heat shock protein 90  32.57 
 
 
630 aa  246  9e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0405  heat shock protein 90  29.43 
 
 
624 aa  245  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.103102  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0856  heat shock protein 90  29.48 
 
 
627 aa  246  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.585619 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0322  heat shock protein 90  28.57 
 
 
624 aa  246  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2390  heat shock protein 90  33 
 
 
650 aa  244  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1472  heat shock protein 90  32.2 
 
 
615 aa  244  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3055  heat shock protein 90  28.89 
 
 
622 aa  244  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2893  heat shock protein 90  28.89 
 
 
624 aa  244  3.9999999999999997e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.661781  normal  0.181179 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3195  heat shock protein 90  28.89 
 
 
624 aa  244  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228822  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2338  ATP-binding region ATPase domain protein  28.19 
 
 
638 aa  243  9e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.268084  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1592  heat shock protein 90  30.06 
 
 
633 aa  243  9e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26010  TRAP1, Heat Shock Protein 90  28.27 
 
 
700 aa  243  1e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0886232  normal  0.373209 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1800  heat shock protein Hsp90  30.39 
 
 
646 aa  242  1e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2208  heat shock protein HtpG  27.66 
 
 
635 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2498  heat shock protein 90  34.1 
 
 
650 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000559019  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1147  heat shock protein 90  30.9 
 
 
636 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30595  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2414  heat shock protein 90  32.08 
 
 
644 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0506  heat shock protein 90  28.95 
 
 
635 aa  241  2.9999999999999997e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0911  heat shock protein 90  29.08 
 
 
627 aa  241  4e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2007  heat shock protein 90  28.19 
 
 
652 aa  241  4e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43850  heat shock protein 90  28.21 
 
 
634 aa  241  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1117  heat shock protein 90  29.01 
 
 
668 aa  241  4e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.775392 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2017  heat shock protein 90  27.99 
 
 
637 aa  240  5e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2491  heat shock protein 90  28.71 
 
 
634 aa  240  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1428  heat shock protein 90  28.94 
 
 
637 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000680402  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0860  heat shock protein Hsp90  35.99 
 
 
628 aa  239  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0873  heat shock protein 90  31.87 
 
 
628 aa  239  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000721641  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1017  heat shock protein 90  31.87 
 
 
628 aa  239  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000769643  normal  0.045663 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1796  heat shock protein 90  27.31 
 
 
638 aa  238  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000064656  unclonable  0.0000000164624 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1127  heat shock protein 90  29.66 
 
 
636 aa  238  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618251  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2232  heat shock protein 90  28.37 
 
 
639 aa  238  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000100055  hitchhiker  0.000273756 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1375  heat shock protein 90  31.94 
 
 
645 aa  238  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000122327  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18793  predicted protein  28.23 
 
 
750 aa  237  4e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3678  heat shock protein 90  27.9 
 
 
634 aa  237  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4179  heat shock protein 90  26.72 
 
 
634 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.745481  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01327  heat shock protein 90  33.16 
 
 
634 aa  237  6e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0592  heat shock protein 90  30.84 
 
 
624 aa  236  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0538  heat shock protein 90  30.84 
 
 
624 aa  236  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.132733  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3232  heat shock protein 90  28.23 
 
 
629 aa  236  8e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0881904  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0548  heat shock protein 90  30.84 
 
 
624 aa  236  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0532  heat shock protein 90  30.84 
 
 
624 aa  236  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0532  heat shock protein 90  30.84 
 
 
624 aa  236  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1079  heat shock protein 90  28.55 
 
 
629 aa  236  9e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0217188  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1526  heat shock protein 90  28.04 
 
 
638 aa  236  9e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00178213  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1689  heat shock protein 90  26.56 
 
 
634 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.05546  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2849  heat shock protein 90  27.93 
 
 
638 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000520054  decreased coverage  0.00000000518986 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2099  heat shock protein 90  27.59 
 
 
635 aa  236  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130933  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004137  chaperone protein HtpG  30.19 
 
 
634 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2299  heat shock protein 90  31.12 
 
 
637 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000323275  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2663  heat shock protein 90  31.33 
 
 
637 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0275177  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2586  heat shock protein 90  31.33 
 
 
637 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000082742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>