More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2565 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2565  histidine kinase  100 
 
 		 796 aa  1619    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36080  ATP binding/ATPase (HATPase_c) domain-containing protein  29.5 
 
 		 723 aa  265  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.785122  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0749  histidine kinase  28.89 
 
 		 722 aa  248  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3949  histidine kinase  26.98 
 
 		 679 aa  236  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1181  histidine kinase  25.97 
 
 		 719 aa  187  4e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.798724  normal  0.0930045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4625  histidine kinase  24.22 
 
 		 756 aa  153  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.402141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0570  ATPase domain-containing protein  24.74 
 
 		 720 aa  153  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.208854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0268  histidine kinase  25.07 
 
 		 738 aa  148  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3783  histidine kinase  25.4 
 
 		 946 aa  145  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377863  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4587  histidine kinase  24.15 
 
 		 784 aa  130  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4048  histidine kinase  25.17 
 
 		 773 aa  124  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1575  histidine kinase  22.89 
 
 		 684 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000414678  decreased coverage  0.0000074807 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5323  histidine kinase  27.94 
 
 		 783 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.15205 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2516  putative prophage encoded two-component system histidine kinase  23.95 
 
 		 774 aa  105  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222494  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2441  histidine kinase  32.66 
 
 		 674 aa  96.3  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.459087  unclonable  0.00000000106284 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2655  histidine kinase  23.44 
 
 		 771 aa  94.7  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0835586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1489  histidine kinase  22.77 
 
 		 774 aa  84  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0301  histidine kinase  35.83 
 
 		 994 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0079  histidine kinase  29.88 
 
 		 987 aa  71.6  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217254  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0739  histidine kinase  22.76 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1158  hypothetical protein  33.33 
 
 		 971 aa  69.3  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0746072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0504  signal transduction protein, histidine kinase  33.88 
 
 		 997 aa  67  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.284164  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.13 
 
 		 585 aa  67.4  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572324  normal  0.76853 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1464  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 		 745 aa  67  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1148  sensor histidine kinase  28.63 
 
 		 604 aa  66.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0371  histidine kinase  28.57 
 
 		 989 aa  65.5  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1462  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 600 aa  64.7  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0277816  normal  0.69414 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3840  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 		 759 aa  63.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385478  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0961  hypothetical protein  37.5 
 
 		 587 aa  63.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.598783  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2370  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 		 672 aa  62.4  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 		 604 aa  62  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0026  sensory histidine kinase CreC  26.43 
 
 		 480 aa  62  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2388  sensory box histidine kinase  28.57 
 
 		 733 aa  61.6  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1841  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.48 
 
 		 832 aa  62  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193006  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2895  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.81 
 
 		 705 aa  61.2  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2492  sensory box histidine kinase  25.51 
 
 		 830 aa  61.2  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  24.11 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0714  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 		 604 aa  60.8  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0131  histidine kinase  21.99 
 
 		 630 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399979  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2662  hypothetical protein  26.41 
 
 		 595 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2129  sensor histidine kinase  26.86 
 
 		 587 aa  60.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178359  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1643  hypothetical protein  32.14 
 
 		 361 aa  60.5  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4276  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 		 779 aa  60.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 428 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0932  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.8 
 
 		 632 aa  60.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.58 
 
 		 439 aa  60.1  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125558  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3436  hypothetical protein  27.78 
 
 		 667 aa  59.7  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1880  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.54 
 
 		 612 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.139426  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0184  sensory histidine kinase CreC  25.69 
 
 		 481 aa  59.7  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2653  sensor histidine kinase  25.44 
 
 		 595 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000377576 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5904  two-component sensor  25.65 
 
 		 599 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  28.51 
 
 		 591 aa  60.1  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4100  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 		 484 aa  60.1  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24 
 
 		 851 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0759  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.3 
 
 		 430 aa  60.1  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.269455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68230  two-component sensor  26.02 
 
 		 612 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0604681 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2419  sensor histidine kinase  25.44 
 
 		 595 aa  58.9  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.131968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2380  sensor histidine kinase  25.44 
 
 		 595 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.343005  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2094  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.41 
 
 		 503 aa  59.3  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2659  hypothetical protein  24.12 
 
 		 595 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  24 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.02 
 
 		 1822 aa  59.3  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2201  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 		 480 aa  59.3  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2665  sensor histidine kinase  24.12 
 
 		 590 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414185  normal  0.194942 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2274  histidine kinase  24.15 
 
 		 440 aa  58.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0463006  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2088  histidine kinase  28.45 
 
 		 282 aa  58.9  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.409720000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3688  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.33 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4427  histidine kinase  23.72 
 
 		 458 aa  58.2  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4339  histidine kinase  26.58 
 
 		 600 aa  57.8  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  27.27 
 
 		 1258 aa  57.8  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  25.23 
 
 		 1215 aa  57.4  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1274  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.84 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.465456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.22 
 
 		 666 aa  57.8  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0650  histidine kinase  23.95 
 
 		 329 aa  57  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1172  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 450 aa  57.4  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2456  sensor histidine kinase  25 
 
 		 509 aa  57  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.237642  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  26.38 
 
 		 435 aa  57  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0704  sensor histidine kinase  34.21 
 
 		 713 aa  57  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.2301  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5703  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 		 435 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123247  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4582  histidine kinase  28.29 
 
 		 455 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0011  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.63 
 
 		 483 aa  57  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0404114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.41 
 
 		 499 aa  57  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2636  sensor histidine kinase  25 
 
 		 499 aa  57  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0375  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 		 494 aa  57.4  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2288  sensor histidine kinase  25.89 
 
 		 520 aa  56.6  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0079  histidine kinase  23.77 
 
 		 710 aa  56.2  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480201  normal  0.629381 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2542  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 		 588 aa  56.2  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206032  normal  0.256758 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0958  histidine kinase  24.4 
 
 		 632 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5550  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 803 aa  56.2  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0835247 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2505  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.56 
 
 		 595 aa  56.6  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0288015  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2703  hypothetical protein  25 
 
 		 595 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.894836  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 		 941 aa  56.6  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.109629  normal  0.20707 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.4 
 
 		 632 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0448  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.18 
 
 		 519 aa  56.2  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1518  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.43 
 
 		 391 aa  56.2  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0435216 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.96 
 
 		 441 aa  55.8  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2564  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 559 aa  55.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.382353  hitchhiker  0.0000221302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>