More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1080 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_2963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60.89 
 
 		 597 aa  682    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0801303  normal  0.115737 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.66 
 
 		 604 aa  715    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0714  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  65.21 
 
 		 604 aa  723    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2129  sensor histidine kinase  64.85 
 
 		 587 aa  719    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178359  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2542  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  59.75 
 
 		 588 aa  660    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206032  normal  0.256758 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 585 aa  1172    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572324  normal  0.76853 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1462  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  61.93 
 
 		 600 aa  706    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0277816  normal  0.69414 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0478  histidine kinase  34.49 
 
 		 616 aa  271  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  33.57 
 
 		 594 aa  271  2.9999999999999997e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.78 
 
 		 628 aa  254  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4457  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 586 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.28 
 
 		 591 aa  251  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1731  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 621 aa  251  3e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144225  normal  0.746753 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0368  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 		 620 aa  251  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6314  putative two-component sensor  34.48 
 
 		 586 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 622 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.534155 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72740  putative two-component sensor  34.49 
 
 		 588 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.658354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  33.51 
 
 		 621 aa  243  5e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5398  sensor histidine kinase  32.61 
 
 		 602 aa  243  6e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1259  ATPase domain-containing protein  33.51 
 
 		 626 aa  242  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.27586 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  33.22 
 
 		 623 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0307  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 627 aa  239  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.876198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  32.23 
 
 		 630 aa  239  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3994  sensor histidine kinase  33.99 
 
 		 585 aa  236  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0131  histidine kinase  35.14 
 
 		 630 aa  236  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399979  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 683 aa  236  9e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0193  histidine kinase  32.18 
 
 		 670 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0541233 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3025  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 		 634 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 672 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.622547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5341  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 		 634 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1515  C4-dicarboxylate transport sensor protein  30.07 
 
 		 597 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0225348  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4927  histidine kinase  31.89 
 
 		 627 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5668  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 623 aa  232  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2668  histidine kinase  33.22 
 
 		 638 aa  232  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 585 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0519  histidine kinase  31.6 
 
 		 666 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  31.05 
 
 		 666 aa  227  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 627 aa  227  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3060  ATPase domain-containing protein  33.1 
 
 		 625 aa  225  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457203  normal  0.839364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5904  two-component sensor  32.36 
 
 		 599 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3284  histidine kinase  33.1 
 
 		 625 aa  224  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4691  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.76 
 
 		 638 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0457  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  30.74 
 
 		 677 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7577  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0477  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  30.74 
 
 		 677 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277779  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3259  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 622 aa  223  6e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1209  histidine kinase  32.22 
 
 		 621 aa  223  8e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0288  histidine kinase  32.54 
 
 		 604 aa  223  8e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 631 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.747879 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2883  histidine kinase  31.03 
 
 		 669 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 672 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68230  two-component sensor  32.18 
 
 		 612 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0604681 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6214  histidine kinase  31.26 
 
 		 669 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0431  histidine kinase  32.37 
 
 		 668 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0589  histidine kinase  32.99 
 
 		 590 aa  219  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 585 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0331  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  31.26 
 
 		 665 aa  219  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004046  signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  29.67 
 
 		 601 aa  218  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4291  sensor histidine kinase  33.81 
 
 		 585 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4771  histidine kinase  35.09 
 
 		 624 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15318  normal  0.415438 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4946  histidine kinase  31.79 
 
 		 604 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000919995 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 602 aa  217  5e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4937  sensor histidine kinase  31.34 
 
 		 604 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0289  histidine kinase  31.28 
 
 		 604 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2258  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 		 669 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 		 669 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0641  C4-dicarboxylate transport sensor protein  30.91 
 
 		 677 aa  216  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 585 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0264  sensor histidine kinase  31.45 
 
 		 604 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0204811 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 604 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0400  C4-dicarboxylate transport sensor protein  31.03 
 
 		 677 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.76 
 
 		 618 aa  213  7.999999999999999e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.798107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3170  histidine kinase  32.01 
 
 		 597 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111612  normal  0.304086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3935  histidine kinase  30.34 
 
 		 667 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4539  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 		 637 aa  211  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0810573  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3461  histidine kinase  30.54 
 
 		 600 aa  211  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46980  putative two-component sensor  30.47 
 
 		 633 aa  210  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0066179  normal  0.0520947 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2212  putative two-component sensor histidine kinase protein  28.43 
 
 		 600 aa  209  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2789  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 677 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 635 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4177  histidine kinase  31 
 
 		 620 aa  209  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661658  normal  0.571454 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 635 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4339  histidine kinase  31.41 
 
 		 600 aa  208  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3901  histidine kinase  30.4 
 
 		 615 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.896437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1549  histidine kinase  27.94 
 
 		 598 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.924403  normal  0.563022 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3479  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 		 621 aa  208  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 		 598 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1425  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 		 603 aa  208  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.524026  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 634 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 		 598 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 634 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 598 aa  207  5e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.078149 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1108  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 634 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.287066 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 606 aa  205  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.381822 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  28.16 
 
 		 659 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1815  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 583 aa  204  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1413  ATPase domain-containing protein  27.04 
 
 		 603 aa  204  4e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4049  putative two-component sensor  28.97 
 
 		 618 aa  203  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6227  two component sensor kinase for C4-dicarboxylate transport  29.77 
 
 		 600 aa  203  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.970393  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1360  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 		 603 aa  203  8e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 604 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.536405 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>