More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1575 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1575  histidine kinase  100 
 
 
684 aa  1395    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000414678  decreased coverage  0.0000074807 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4625  histidine kinase  26.2 
 
 
756 aa  196  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.402141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0570  ATPase domain-containing protein  24.86 
 
 
720 aa  181  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.208854  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0268  histidine kinase  25.24 
 
 
738 aa  177  7e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3949  histidine kinase  26.41 
 
 
679 aa  177  7e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3783  histidine kinase  25.17 
 
 
946 aa  150  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377863  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36080  ATP binding/ATPase (HATPase_c) domain-containing protein  27.15 
 
 
723 aa  149  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.785122  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0749  histidine kinase  26.04 
 
 
722 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1181  histidine kinase  22.53 
 
 
719 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.798724  normal  0.0930045 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2441  histidine kinase  22.54 
 
 
674 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.459087  unclonable  0.00000000106284 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2565  histidine kinase  22.89 
 
 
796 aa  127  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5323  histidine kinase  24.84 
 
 
783 aa  98.2  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.15205 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0922  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
727 aa  94.7  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4048  histidine kinase  24.6 
 
 
773 aa  89.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  26.55 
 
 
594 aa  89.7  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2269  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 
736 aa  89.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00414095 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2516  putative prophage encoded two-component system histidine kinase  25 
 
 
774 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222494  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 
588 aa  85.1  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3994  sensor histidine kinase  27.92 
 
 
585 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004046  signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  29.01 
 
 
601 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  29.15 
 
 
1379 aa  82  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2655  histidine kinase  26.99 
 
 
771 aa  82  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0835586 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2911  ATPase domain-containing protein  24.65 
 
 
613 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1499  flagellar regulatory protein B  28.98 
 
 
431 aa  81.6  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440819  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0969  histidine kinase  26.1 
 
 
801 aa  82  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000115814  hitchhiker  0.0000040144 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 
652 aa  80.5  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7458  putative sensor histidine kinase with ATP-binding region  29.74 
 
 
406 aa  79.7  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0082  C4-dicarboxylate transport sensor kinase  26.3 
 
 
643 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0023  nitrogen regulation protein NtrY, putative  28.83 
 
 
710 aa  78.6  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0101  sensor histidine kinase  26.3 
 
 
643 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000798435  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0024  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 
736 aa  79  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.10248 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1572  C4-dicarboxylate transport sensor protein  26.3 
 
 
643 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000397989  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.81 
 
 
607 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.43 
 
 
603 aa  77.8  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3522  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 
509 aa  77.8  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.077767 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
708 aa  77.8  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000583847 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1510  C4-dicarboxylate transport sensor protein dctB  26.3 
 
 
322 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.220294  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4084  histidine kinase  28.99 
 
 
705 aa  76.6  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1436  histidine kinase  28.11 
 
 
617 aa  76.6  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0914  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 
771 aa  76.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5352  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 
517 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121582  normal  0.862322 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5143  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
408 aa  75.1  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1230  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  26.25 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0439907  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09680  putative two-component sensor  27.73 
 
 
758 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0280017  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2643  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 
552 aa  74.7  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.2 
 
 
801 aa  74.7  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 
845 aa  74.7  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.99 
 
 
734 aa  74.3  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0331  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  28.63 
 
 
665 aa  74.3  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4457  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.21 
 
 
586 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1831  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 
793 aa  74.3  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.836817  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0878  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.32 
 
 
760 aa  73.9  0.000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.210313  normal  0.808443 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 
718 aa  73.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 
672 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.622547  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6314  putative two-component sensor  29.28 
 
 
586 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  27.42 
 
 
1258 aa  73.2  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2718  histidine kinase  26.51 
 
 
623 aa  73.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.41 
 
 
598 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.078149 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2012  C4-dicarboxylate transport sensor protein  23.92 
 
 
611 aa  72  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 
498 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1549  histidine kinase  24.45 
 
 
598 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.924403  normal  0.563022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.45 
 
 
598 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  25.53 
 
 
666 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.45 
 
 
598 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 
602 aa  71.6  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1489  histidine kinase  23.47 
 
 
774 aa  72  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1084  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.28 
 
 
495 aa  71.6  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  25.48 
 
 
1833 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.46 
 
 
1845 aa  71.6  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2094  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.8 
 
 
503 aa  71.2  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1349  histidine kinase  25.58 
 
 
554 aa  71.2  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.134136  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2542  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 
588 aa  71.2  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206032  normal  0.256758 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 
592 aa  71.2  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.29 
 
 
739 aa  71.2  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500892  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72740  putative two-component sensor  28.52 
 
 
588 aa  71.2  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.658354  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3020  histidine kinase  26.07 
 
 
1282 aa  70.9  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.883771  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0714  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
604 aa  70.9  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362965  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3935  histidine kinase  27.85 
 
 
667 aa  70.9  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707276  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 
733 aa  70.9  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.589571  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.23 
 
 
838 aa  70.9  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0594373  normal  0.673452 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3018  Signal transduction histidine kinase, NtrY  25.99 
 
 
712 aa  70.9  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3904  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 
490 aa  70.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 
881 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 
585 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2040  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 
810 aa  70.5  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193503  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3616  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 
515 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.766527  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 
585 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0952  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.28 
 
 
445 aa  70.1  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2979  histidine kinase  25.34 
 
 
622 aa  70.1  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0797138 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0193  histidine kinase  26.52 
 
 
670 aa  70.1  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0541233 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  27.89 
 
 
592 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0229  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 
668 aa  70.1  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.930854  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1775  histidine kinase  28.63 
 
 
615 aa  70.5  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520686  normal  0.0542298 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1953  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 
458 aa  70.5  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1360  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.08 
 
 
603 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5165  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 
593 aa  70.1  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
729 aa  70.5  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.608847  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2231  sensory box histidine kinase  22.83 
 
 
885 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.83 
 
 
838 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.991509  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4093  histidine kinase  29.25 
 
 
471 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>