More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0079 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0301  histidine kinase  39.98 
 
 		 994 aa  707    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0079  histidine kinase  100 
 
 		 987 aa  2048    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217254  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1158  hypothetical protein  31.99 
 
 		 971 aa  229  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0746072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0504  signal transduction protein, histidine kinase  26.53 
 
 		 997 aa  194  8e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.284164  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0371  histidine kinase  26 
 
 		 989 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0749  histidine kinase  24.61 
 
 		 722 aa  99  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0570  ATPase domain-containing protein  25.32 
 
 		 720 aa  90.9  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.208854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2441  histidine kinase  36.2 
 
 		 674 aa  89.7  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.459087  unclonable  0.00000000106284 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0268  histidine kinase  36.67 
 
 		 738 aa  83.6  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3949  histidine kinase  38.71 
 
 		 679 aa  75.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2565  histidine kinase  29.88 
 
 		 796 aa  71.6  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36080  ATP binding/ATPase (HATPase_c) domain-containing protein  31.25 
 
 		 723 aa  71.2  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.785122  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4625  histidine kinase  36.59 
 
 		 756 aa  68.6  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.402141 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2516  putative prophage encoded two-component system histidine kinase  29.19 
 
 		 774 aa  68.2  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222494  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4587  histidine kinase  25 
 
 		 784 aa  64.7  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2655  histidine kinase  29.58 
 
 		 771 aa  64.3  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0835586 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2360  histidine kinase  40 
 
 		 367 aa  63.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1489  histidine kinase  28.47 
 
 		 774 aa  62.8  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5323  histidine kinase  26.87 
 
 		 783 aa  60.1  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.15205 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1575  histidine kinase  33.88 
 
 		 684 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000414678  decreased coverage  0.0000074807 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1207  histidine kinase  24.6 
 
 		 577 aa  58.9  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1181  histidine kinase  31.75 
 
 		 719 aa  58.9  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.798724  normal  0.0930045 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 		 581 aa  58.5  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671901  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3342  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 581 aa  58.5  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4048  histidine kinase  34.03 
 
 		 773 aa  57.8  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 		 641 aa  57.4  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 364 aa  57  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0385  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.94 
 
 		 280 aa  56.6  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5718  Molecular chaperone HSP90 family-like protein  27.46 
 
 		 872 aa  56.6  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.903577 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5498  histidine kinase  25 
 
 		 676 aa  56.2  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 676 aa  56.2  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2495  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.75 
 
 		 363 aa  56.2  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2325  sensor histidine kinase  37.93 
 
 		 372 aa  55.5  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.288819  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2137  sensor histidine kinase  37.93 
 
 		 377 aa  55.5  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2075  sensor histidine kinase (sporulation kinase A)  37.93 
 
 		 377 aa  55.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114358  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2071  sensor histidine kinase  37.93 
 
 		 377 aa  55.5  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.939444  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2400  sensor histidine kinase  37.93 
 
 		 372 aa  55.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2291  sensor histidine kinase  37.93 
 
 		 377 aa  55.5  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1680  histidine kinase  28.22 
 
 		 381 aa  55.5  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0132697  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 695 aa  55.5  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2316  sensor histidine kinase  37.93 
 
 		 377 aa  55.5  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3487  histidine kinase  25.29 
 
 		 581 aa  55.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0451928  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1274  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.79 
 
 		 416 aa  55.1  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.465456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1084  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 495 aa  54.7  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0448  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.96 
 
 		 519 aa  53.9  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0576  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 		 507 aa  53.5  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1628  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 		 929 aa  53.5  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0684  hypothetical protein  30.36 
 
 		 673 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.093919  hitchhiker  0.000000000000985329 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2273  sensor histidine kinase  34.48 
 
 		 377 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0849  putative two component sensor kinase  23.11 
 
 		 667 aa  53.5  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  25.78 
 
 		 346 aa  53.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  23.17 
 
 		 452 aa  53.5  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 		 829 aa  53.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1291  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.28 
 
 		 690 aa  53.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1828  sensor histidine kinase  25 
 
 		 674 aa  52.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.719935  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  26.04 
 
 		 659 aa  52.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1040  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  24.39 
 
 		 696 aa  52.8  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1776  histidine kinase  22.59 
 
 		 519 aa  52.8  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4771  histidine kinase  32.18 
 
 		 624 aa  52.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15318  normal  0.415438 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0044  sensory histidine kinase DcuS  34.52 
 
 		 542 aa  52.4  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.15 
 
 		 378 aa  52.4  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3853  hypothetical protein  26.77 
 
 		 662 aa  52.4  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000936749  normal  0.0170599 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1464  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.43 
 
 		 745 aa  52.4  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2091  hypothetical protein  31.68 
 
 		 642 aa  52.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1987  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 		 577 aa  52  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2013  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.86 
 
 		 455 aa  52  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 584 aa  52  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1523  histidine kinase  30.95 
 
 		 280 aa  52  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.929017  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 		 372 aa  52  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 		 444 aa  51.6  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3783  histidine kinase  34.43 
 
 		 946 aa  51.6  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377863  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.53 
 
 		 483 aa  51.2  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1486  histidine kinase  33.33 
 
 		 575 aa  51.2  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0382  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 		 577 aa  51.2  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000224875  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1882  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 652 aa  50.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0696304  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2012  C4-dicarboxylate transport sensor protein  25.94 
 
 		 611 aa  50.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 633 aa  51.2  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.20984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0038  sensory histidine kinase DcuS  41.38 
 
 		 542 aa  50.4  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4258  histidine kinase  24.23 
 
 		 506 aa  51.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0142  histidine kinase  24.43 
 
 		 614 aa  50.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1136  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 541 aa  50.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 587 aa  50.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3194  histidine kinase  25.38 
 
 		 663 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02911  two-component sensor histidine kinase  24.33 
 
 		 378 aa  51.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.144075  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2492  sensory box histidine kinase  24.9 
 
 		 830 aa  50.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1567  histidine kinase  26.48 
 
 		 567 aa  50.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0961  hypothetical protein  34.45 
 
 		 587 aa  50.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.598783  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.64 
 
 		 652 aa  50.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 875 aa  50.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2074  sensor histidine kinase  24.88 
 
 		 816 aa  50.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02921  two-component sensor histidine kinase  28.97 
 
 		 378 aa  50.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4308  hypothetical protein  31.03 
 
 		 702 aa  50.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0554257  normal  0.0504363 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1513  sensor histidine kinase  34.95 
 
 		 423 aa  50.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0642  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 		 492 aa  50.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.11 
 
 		 504 aa  50.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001013  signal transduction histidine kinase  24.55 
 
 		 624 aa  50.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1182  hypothetical protein  24.24 
 
 		 671 aa  50.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0023926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0315  putative sensor histidine kinase  30.66 
 
 		 204 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1619  sensor histidine kinase  33.98 
 
 		 423 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2110  histidine kinase  33.33 
 
 		 372 aa  49.7  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>