More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2101 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_2101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 483 aa  971    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0021  histidine kinase  50.42 
 
 		 485 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1376  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.33 
 
 		 499 aa  344  2e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.20257  normal  0.926367 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 		 511 aa  333  4e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00545163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 491 aa  290  4e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2127  histidine kinase  25.2 
 
 		 483 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 630 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4258  histidine kinase  36.15 
 
 		 506 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 654 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.3 
 
 		 541 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0960  histidine kinase  31.76 
 
 		 531 aa  134  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 496 aa  133  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.739503  normal  0.406153 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  27.07 
 
 		 516 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2824  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 645 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  32.8 
 
 		 912 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  28.57 
 
 		 608 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.57 
 
 		 608 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  28.57 
 
 		 608 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  28.57 
 
 		 608 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  28.57 
 
 		 608 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 378 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  28.57 
 
 		 608 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2683  histidine kinase  30.51 
 
 		 490 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000711589 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2491  histidine kinase  33.23 
 
 		 626 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653758 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 662 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 488 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  31.93 
 
 		 1062 aa  129  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.35 
 
 		 473 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 592 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 		 671 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.55 
 
 		 598 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 492 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2428  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.36 
 
 		 656 aa  128  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00399652  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2960  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 557 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 504 aa  127  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113715  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  28.38 
 
 		 673 aa  127  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  30.92 
 
 		 592 aa  127  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0201  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 408 aa  127  6e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 491 aa  127  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303105  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2603  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 570 aa  127  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  24.95 
 
 		 517 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 490 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0625173  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0301  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 562 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3785  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.61 
 
 		 611 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.862005  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  32.37 
 
 		 1061 aa  125  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2038  histidine kinase  34.29 
 
 		 552 aa  125  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  27.92 
 
 		 661 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2085  ATP-binding region ATPase domain protein  31.78 
 
 		 510 aa  125  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.158999  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4825  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 582 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1327  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 375 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0073  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 505 aa  124  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2532  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 375 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3869  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.23 
 
 		 611 aa  124  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.793663  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2628  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 375 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.7332  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4807  two-component sensor kinase CbrA  35.97 
 
 		 982 aa  123  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111257 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2146  two component signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 559 aa  123  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3588  two-component sensor kinase CbrA  35.97 
 
 		 984 aa  123  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.883039 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.78 
 
 		 642 aa  123  7e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683271 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  35.02 
 
 		 458 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 862 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2069  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 653 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  25.41 
 
 		 581 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.42 
 
 		 749 aa  122  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116264 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1403  signal transduction protein, histidine kinase  27.01 
 
 		 675 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  35.02 
 
 		 458 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1567  histidine kinase  27.96 
 
 		 567 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5455  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 571 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0104043  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0941  sensor histidine kinase, putative  34.21 
 
 		 248 aa  121  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0323  histidine kinase  35.07 
 
 		 490 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.449634  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  34.6 
 
 		 458 aa  121  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 661 aa  121  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 812 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3371  histidine kinase  33.77 
 
 		 887 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.564838 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.1 
 
 		 695 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0246  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 573 aa  120  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2752  histidine kinase  25.11 
 
 		 460 aa  120  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3250  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 		 488 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1311  sensory histidine kinase AtoS  33.62 
 
 		 614 aa  120  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 		 663 aa  120  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4694  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 991 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000630671 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0617  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 557 aa  120  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0111  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 497 aa  120  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717737  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1934  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.03 
 
 		 720 aa  120  7e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1737  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.03 
 
 		 720 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166788  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  34.6 
 
 		 458 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3573  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 402 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0107  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 497 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  34.18 
 
 		 458 aa  119  9e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2440  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 375 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.467167  normal  0.627522 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  28.49 
 
 		 674 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.34 
 
 		 491 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1952  histidine kinase  32.81 
 
 		 560 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1723  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 		 664 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0114  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 498 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  34.18 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.16 
 
 		 801 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 		 368 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.834527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1167  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 551 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  34.18 
 
 		 465 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0125  histidine kinase  35.32 
 
 		 498 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>