More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0469 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 444 aa  892    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.18 
 
 		 441 aa  491  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18234  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0952  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4582  histidine kinase  24.55 
 
 		 455 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4824  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 		 446 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4705  sensory box sensor histidine kinase  26.07 
 
 		 472 aa  159  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.738768  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0326  response regulator receiver domain-containing protein  26.59 
 
 		 450 aa  157  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.159286  normal  0.343021 
 
 
-
 
NC_002950  PG0017  sensor histidine kinase  26.12 
 
 		 445 aa  152  8e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.428126 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2122  sensor histidine kinase  25.3 
 
 		 447 aa  147  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0305  glycine cleavage system T protein  26.3 
 
 		 448 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00724107 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.32 
 
 		 448 aa  144  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589471 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0375  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 494 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0098  histidine kinase  33.75 
 
 		 439 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0779  sensor histidine kinase  26.98 
 
 		 468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 		 426 aa  124  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 		 718 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1489  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.08 
 
 		 753 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.726921  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 		 756 aa  120  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.857607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4001  histidine kinase  24.48 
 
 		 774 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000232996 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2860  ATP-binding region, ATPase-like protein  29.44 
 
 		 437 aa  117  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0902  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 451 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.14 
 
 		 708 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000583847 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2603  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.7 
 
 		 421 aa  114  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0542  nitrogen regulation protein NtrY  23.98 
 
 		 742 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0128365  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3688  nitrogen regulation protein NtrY, putative  29.12 
 
 		 555 aa  114  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1455  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.27 
 
 		 753 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.205006  normal  0.134875 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5615  histidine kinase  27.13 
 
 		 429 aa  112  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3060  ATPase domain-containing protein  28.44 
 
 		 625 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457203  normal  0.839364 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4068  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 463 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.32 
 
 		 752 aa  111  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.43986 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1190  histidine kinase  29.39 
 
 		 484 aa  111  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.496715  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0577  sensor histidine kinase  26.08 
 
 		 433 aa  110  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.122175  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0867  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 		 555 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2839  nitrogen regulation protein, NtrY, Signal transduction histidine kinase  23.98 
 
 		 769 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0315  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 800 aa  110  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4410  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 		 800 aa  110  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3284  histidine kinase  27.96 
 
 		 625 aa  110  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3155  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 555 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3118  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 		 817 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.728829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 454 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3256  ATPase domain-containing protein  28.12 
 
 		 551 aa  108  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  20.43 
 
 		 729 aa  108  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.608847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 456 aa  108  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.53289 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4084  histidine kinase  21.23 
 
 		 705 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0727  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 457 aa  107  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1074  nitrogen regulation protein NtrY  23.51 
 
 		 774 aa  106  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000929955  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1116  nitrogen regulation protein NtrY  23.51 
 
 		 774 aa  106  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0134  nitrogen regulation protein NtrY, putative  27.82 
 
 		 787 aa  106  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.822432  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0018  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  23.8 
 
 		 710 aa  106  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.2698 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0157  sensor histidine kinase  27.82 
 
 		 802 aa  106  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278492  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0167  sensor histidine kinase  27.82 
 
 		 802 aa  106  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.211147  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2847  nitrogen regulation protein NtrY, putative  24.56 
 
 		 734 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0148  nitrogen regulation protein NtrY, putative  27.82 
 
 		 806 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155051  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0515  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.79 
 
 		 780 aa  106  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168108 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0352  sensor kinase protein  27.82 
 
 		 787 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.452742  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.6 
 
 		 562 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2359  putative nitrogen regulation protein NtrY  27.82 
 
 		 802 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252159  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2799  putative nitrogen regulation protein NtrY  27.82 
 
 		 802 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 		 784 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2281  putative nitrogen regulation protein NtrY  27.82 
 
 		 802 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0640916  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1035  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.4 
 
 		 562 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3259  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 		 622 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.6 
 
 		 562 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6472  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 		 804 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 542 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3176  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 		 804 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0746  sensor histidine kinase  26.64 
 
 		 455 aa  104  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2846  ATP-binding region, ATPase-like protein  27.31 
 
 		 452 aa  104  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3059  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 		 800 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.510583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 		 804 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.428024 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 		 804 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.537383  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 		 804 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.655307  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 628 aa  103  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 		 759 aa  103  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1023  histidine kinase  24.6 
 
 		 562 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.91 
 
 		 781 aa  103  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276593  decreased coverage  0.00464659 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 543 aa  103  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0937  histidine kinase  26.14 
 
 		 471 aa  103  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6300  histidine kinase  27.8 
 
 		 1255 aa  103  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.396058 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2136  two component sensor kinase  24.31 
 
 		 759 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132627  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 607 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0041  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 803 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.37 
 
 		 812 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  20.05 
 
 		 799 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2197  two-component sensor histidine kinase (sensor protein AtoS)  29.69 
 
 		 1234 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.993549 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3506  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 		 450 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.996611 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1002  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.54 
 
 		 562 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0547  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.63 
 
 		 731 aa  102  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.22 
 
 		 733 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.589571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0390  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.47 
 
 		 744 aa  101  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2211  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.95 
 
 		 771 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.542091  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  20.86 
 
 		 733 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0131  histidine kinase  27.52 
 
 		 630 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399979  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0704  sensor histidine kinase  25.71 
 
 		 713 aa  100  5e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.2301  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1679  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  23.59 
 
 		 760 aa  100  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.859765  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3020  histidine kinase  28.57 
 
 		 1282 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.883771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.15 
 
 		 756 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0285475 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0299  putative nitrogen regulation protein NtrY  25.36 
 
 		 714 aa  100  7e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.333561  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2346  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.51 
 
 		 426 aa  99.8  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.035298  normal  0.857551 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2239  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.29 
 
 		 756 aa  99  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.292158  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>