46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A4053 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A4053  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  751    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2091  hypothetical protein  40.11 
 
 		 642 aa  280  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1062  hypothetical protein  33.24 
 
 		 644 aa  159  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.183826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4222  hypothetical protein  30.18 
 
 		 640 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0961  hypothetical protein  27.08 
 
 		 587 aa  67  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.598783  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00320  hypothetical protein  22.8 
 
 		 584 aa  60.8  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1643  hypothetical protein  33.33 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2202  DNA mismatch repair ATPase-like protein  37.62 
 
 		 651 aa  55.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000849326  normal  0.525867 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3853  hypothetical protein  37.62 
 
 		 662 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000936749  normal  0.0170599 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0684  hypothetical protein  28.47 
 
 		 673 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.093919  hitchhiker  0.000000000000985329 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0529  hypothetical protein  28.7 
 
 		 609 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.320462  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1243  hypothetical protein  25 
 
 		 240 aa  48.5  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000596031  hitchhiker  0.000000000136742 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1289  DNA mismatch repair protein MutL  35.8 
 
 		 765 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2655  histidine kinase  41.82 
 
 		 771 aa  48.1  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0835586 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0268  histidine kinase  33.73 
 
 		 738 aa  47.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2869  DNA mismatch repair protein MutL  44.23 
 
 		 605 aa  47.4  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110636 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2516  putative prophage encoded two-component system histidine kinase  38.18 
 
 		 774 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222494  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  36.62 
 
 		 606 aa  47  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1182  hypothetical protein  31.96 
 
 		 671 aa  46.6  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0023926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0371  histidine kinase  39.39 
 
 		 989 aa  46.2  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0504  signal transduction protein, histidine kinase  34.29 
 
 		 997 aa  45.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.284164  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4048  histidine kinase  31.2 
 
 		 773 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1181  histidine kinase  36.78 
 
 		 719 aa  45.4  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.798724  normal  0.0930045 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89086  predicted protein  33.33 
 
 		 736 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0034  DNA mismatch repair protein MutL  40.3 
 
 		 590 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  44 
 
 		 622 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4625  histidine kinase  29.21 
 
 		 756 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.402141 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1489  histidine kinase  36.51 
 
 		 774 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  48.15 
 
 		 602 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2754  DNA mismatch repair protein  40.98 
 
 		 634 aa  44.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2946  DNA mismatch repair protein  48.15 
 
 		 629 aa  44.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0749  histidine kinase  50 
 
 		 722 aa  44.3  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1408  DNA mismatch repair protein MutL  48.15 
 
 		 639 aa  43.9  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1087  DNA mismatch repair protein MutL  33.33 
 
 		 582 aa  43.9  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0917186  normal  0.0241297 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1703  DNA mismatch repair protein  52 
 
 		 618 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346146  normal  0.342232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1158  hypothetical protein  33.02 
 
 		 971 aa  43.9  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0746072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  52 
 
 		 599 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2441  histidine kinase  32.05 
 
 		 674 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.459087  unclonable  0.00000000106284 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  46.15 
 
 		 612 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  44.23 
 
 		 594 aa  43.5  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  34.29 
 
 		 621 aa  43.1  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  42.31 
 
 		 644 aa  43.1  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1455  hypothetical protein  31.93 
 
 		 860 aa  43.1  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.316955 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  34.29 
 
 		 619 aa  43.1  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  44.23 
 
 		 616 aa  42.7  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  39.62 
 
 		 605 aa  42.7  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>