24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0595 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0595  hypothetical protein  100 
 
 		 629 aa  1299    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0306  hypothetical protein  41.45 
 
 		 608 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0018054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8689  hypothetical protein  33.28 
 
 		 663 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0006  hypothetical protein  32.24 
 
 		 497 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0277  hypothetical protein  34.52 
 
 		 483 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2368  hypothetical protein  29.71 
 
 		 486 aa  77  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.475897  normal  0.189398 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3071  hypothetical protein  35.03 
 
 		 502 aa  72  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0291  hypothetical protein  30.08 
 
 		 538 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4266  hypothetical protein  30.93 
 
 		 529 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0743  hypothetical protein  26.7 
 
 		 575 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00289763  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4751  hypothetical protein  28.81 
 
 		 537 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177586  normal  0.857198 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0934  ATPase  26.72 
 
 		 486 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  hitchhiker  0.0000000256881 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2743  hypothetical protein  28.63 
 
 		 494 aa  64.7  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128363  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0567  hypothetical protein  29.49 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.602713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0757  hypothetical protein  31.02 
 
 		 436 aa  62.4  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0113754  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4618  hypothetical protein  27.5 
 
 		 509 aa  61.6  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0329503  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0755  ATPase  30.18 
 
 		 520 aa  56.6  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2478  hypothetical protein  25.97 
 
 		 566 aa  56.2  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000510929  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0572  hypothetical protein  30.34 
 
 		 504 aa  55.1  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0215  DNA mismatch repair protein MutL  32.65 
 
 		 600 aa  48.1  0.0005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0118368  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3113  histidine kinase  31.71 
 
 		 654 aa  46.2  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000907022 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2087  hypothetical protein  32.14 
 
 		 500 aa  46.2  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.777544  normal  0.0799361 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0526  histidine kinase internal region  30.69 
 
 		 594 aa  45.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1455  hypothetical protein  25.79 
 
 		 860 aa  45.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.316955 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>