34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0291 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0291  hypothetical protein  100 
 
 		 538 aa  1114    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4751  hypothetical protein  51.53 
 
 		 537 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177586  normal  0.857198 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0567  hypothetical protein  36.86 
 
 		 438 aa  210  6e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.602713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0757  hypothetical protein  31.5 
 
 		 436 aa  192  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0113754  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2368  hypothetical protein  33.61 
 
 		 486 aa  182  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.475897  normal  0.189398 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2743  hypothetical protein  31.78 
 
 		 494 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128363  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0755  ATPase  33.62 
 
 		 520 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0277  hypothetical protein  29.31 
 
 		 483 aa  161  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4266  hypothetical protein  33.72 
 
 		 529 aa  160  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0006  hypothetical protein  31.07 
 
 		 497 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4618  hypothetical protein  28.12 
 
 		 509 aa  153  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0329503  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0934  ATPase  29.46 
 
 		 486 aa  150  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  hitchhiker  0.0000000256881 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3071  hypothetical protein  30.67 
 
 		 502 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2087  hypothetical protein  32.36 
 
 		 500 aa  129  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.777544  normal  0.0799361 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0572  hypothetical protein  27.19 
 
 		 504 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2478  hypothetical protein  23.76 
 
 		 566 aa  107  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000510929  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0743  hypothetical protein  24.78 
 
 		 575 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00289763  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0595  hypothetical protein  30.08 
 
 		 629 aa  70.5  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0306  hypothetical protein  26.59 
 
 		 608 aa  68.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0018054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8689  hypothetical protein  22.62 
 
 		 663 aa  53.9  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  31.39 
 
 		 610 aa  48.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  33.67 
 
 		 615 aa  47.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2235  histidine kinase  29.81 
 
 		 188 aa  45.4  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  34.44 
 
 		 632 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17648  predicted protein  24.03 
 
 		 904 aa  44.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.571817  normal  0.0825581 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0919  DNA mismatch repair protein MutL  36.05 
 
 		 583 aa  44.7  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0819  ATPase domain-containing protein  33.72 
 
 		 650 aa  44.3  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  33.67 
 
 		 647 aa  43.9  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  34.38 
 
 		 606 aa  43.9  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  32.98 
 
 		 616 aa  43.9  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  32.99 
 
 		 687 aa  43.9  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  32.99 
 
 		 661 aa  43.9  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0564  DNA mismatch repair protein  29.29 
 
 		 631 aa  43.5  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.273606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1413  hypothetical protein  28.17 
 
 		 780 aa  43.5  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal  0.0265607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>