More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0819 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0819  ATPase domain-containing protein  100 
 
 		 650 aa  1336    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1495  ATP-binding region, ATPase-like  50.11 
 
 		 580 aa  393  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0919  DNA mismatch repair protein MutL  54.08 
 
 		 583 aa  378  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  37.4 
 
 		 611 aa  229  8e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  38.3 
 
 		 574 aa  229  1e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  39.66 
 
 		 575 aa  228  2e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  38.16 
 
 		 633 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  37.88 
 
 		 633 aa  218  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  38.59 
 
 		 611 aa  217  7e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0601  DNA mismatch repair protein  33.49 
 
 		 631 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  37.33 
 
 		 623 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  32.48 
 
 		 632 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3542  DNA mismatch repair protein  33.33 
 
 		 628 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  32.05 
 
 		 633 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  36.62 
 
 		 648 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  36.7 
 
 		 615 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  32.05 
 
 		 632 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  37.33 
 
 		 625 aa  214  3.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  37.37 
 
 		 630 aa  214  5.999999999999999e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  37.16 
 
 		 641 aa  213  7e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  36.56 
 
 		 633 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0564  DNA mismatch repair protein  35.77 
 
 		 631 aa  211  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.273606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0596  DNA mismatch repair protein  35.47 
 
 		 644 aa  210  6e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0279132  decreased coverage  0.0000000183924 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3434  DNA mismatch repair protein  35.47 
 
 		 644 aa  210  7e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0482547  normal  0.130022 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  36.89 
 
 		 645 aa  209  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  35.12 
 
 		 635 aa  209  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2754  DNA mismatch repair protein  36.74 
 
 		 634 aa  209  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1083  DNA mismatch repair protein  35.32 
 
 		 615 aa  208  2e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  37.22 
 
 		 620 aa  208  3e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0795  DNA mismatch repair protein  34.93 
 
 		 624 aa  208  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.741444  hitchhiker  0.00456525 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3712  DNA mismatch repair protein  35.47 
 
 		 637 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3027  DNA mismatch repair protein  36.31 
 
 		 650 aa  206  8e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0173835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3976  DNA mismatch repair protein MutL  36.39 
 
 		 639 aa  206  9e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0750  DNA mismatch repair protein  34.55 
 
 		 687 aa  206  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.536316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3282  DNA mismatch repair protein  34.55 
 
 		 641 aa  205  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.645074  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  35.69 
 
 		 641 aa  205  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0556  DNA mismatch repair protein  35.2 
 
 		 638 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000137773  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3207  DNA mismatch repair protein  35.39 
 
 		 665 aa  205  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000351816  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0595  DNA mismatch repair protein  35.47 
 
 		 648 aa  205  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000232497 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  36.91 
 
 		 644 aa  204  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4720  DNA mismatch repair protein  34.38 
 
 		 618 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3769  DNA mismatch repair protein  35.47 
 
 		 630 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00256823  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0336  DNA mismatch repair protein  35.65 
 
 		 583 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00211885  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  34.03 
 
 		 661 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4756  DNA mismatch repair protein  34.12 
 
 		 618 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4777  DNA mismatch repair protein  34.12 
 
 		 618 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00171491  normal  0.0289843 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3843  DNA mismatch repair protein  34.3 
 
 		 615 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000795964  hitchhiker  0.000000387336 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4627  DNA mismatch repair protein  34.12 
 
 		 618 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0734  DNA mismatch repair protein  34.03 
 
 		 667 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  37.12 
 
 		 616 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4637  DNA mismatch repair protein  34.12 
 
 		 618 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000512951  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2015  DNA mismatch repair protein MutL  35.47 
 
 		 617 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1300  DNA mismatch repair protein MutL  35.2 
 
 		 698 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0863563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3895  DNA mismatch repair protein  34.93 
 
 		 638 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.329435  normal  0.756046 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  34.03 
 
 		 667 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  34.03 
 
 		 667 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  34.72 
 
 		 626 aa  200  5e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  34.45 
 
 		 607 aa  201  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4641  DNA mismatch repair protein  34.06 
 
 		 615 aa  200  6e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.231193  normal  0.0766044 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  34.92 
 
 		 608 aa  200  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  34.88 
 
 		 630 aa  200  7e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  33.42 
 
 		 661 aa  200  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04037  DNA mismatch repair protein  33.49 
 
 		 615 aa  200  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0484513  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3823  DNA mismatch repair protein MutL  33.49 
 
 		 615 aa  200  7.999999999999999e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000414583  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4701  DNA mismatch repair protein  33.49 
 
 		 615 aa  200  7.999999999999999e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915673  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2756  DNA mismatch repair protein  36.26 
 
 		 653 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4728  DNA mismatch repair protein  33.49 
 
 		 615 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0929403  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5686  DNA mismatch repair protein  34.65 
 
 		 615 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000161678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4412  DNA mismatch repair protein  33.49 
 
 		 615 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0194282  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  35.29 
 
 		 652 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  36.01 
 
 		 607 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  34.31 
 
 		 602 aa  198  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3934  DNA mismatch repair protein  33.77 
 
 		 688 aa  198  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000834702 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  33.16 
 
 		 661 aa  198  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  36.57 
 
 		 629 aa  197  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3655  DNA mismatch repair protein  31.7 
 
 		 635 aa  197  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0128216  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  34.46 
 
 		 705 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3801  DNA mismatch repair protein  31.7 
 
 		 635 aa  197  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  33.51 
 
 		 691 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0533  DNA mismatch repair protein  35.11 
 
 		 629 aa  197  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000857622  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  35.13 
 
 		 635 aa  197  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  33.42 
 
 		 662 aa  197  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  34.2 
 
 		 681 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  34.2 
 
 		 684 aa  196  9e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  34.2 
 
 		 681 aa  196  9e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1085  DNA mismatch repair protein  34.2 
 
 		 684 aa  196  9e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  34.2 
 
 		 684 aa  196  9e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3297  DNA mismatch repair protein  34.2 
 
 		 684 aa  196  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365803  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  34.2 
 
 		 684 aa  196  9e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2779  DNA mismatch repair protein  36.29 
 
 		 652 aa  196  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4172  DNA mismatch repair protein  34.17 
 
 		 614 aa  196  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  35.13 
 
 		 647 aa  196  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  35.1 
 
 		 598 aa  195  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  35.71 
 
 		 621 aa  195  2e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0490  DNA mismatch repair protein  50.49 
 
 		 649 aa  195  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00424491  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0353  DNA mismatch repair protein  33.86 
 
 		 613 aa  196  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.114284  hitchhiker  0.00160708 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4225  DNA mismatch repair protein MutL  36.34 
 
 		 687 aa  194  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.724774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0701  DNA mismatch repair protein  29.94 
 
 		 635 aa  194  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.138509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  37.67 
 
 		 628 aa  194  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  35.16 
 
 		 619 aa  194  5e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>