More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0919 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0919  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 583 aa  1201    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1495  ATP-binding region, ATPase-like  81.1 
 
 		 580 aa  959    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0819  ATPase domain-containing protein  54.08 
 
 		 650 aa  378  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  38.21 
 
 		 611 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  36.77 
 
 		 574 aa  231  3e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  37.81 
 
 		 575 aa  231  3e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  32.93 
 
 		 632 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  32.93 
 
 		 632 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  32.93 
 
 		 633 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3769  DNA mismatch repair protein  37.5 
 
 		 630 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00256823  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  36.75 
 
 		 625 aa  225  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3895  DNA mismatch repair protein  37.5 
 
 		 638 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.329435  normal  0.756046 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0596  DNA mismatch repair protein  37.5 
 
 		 644 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0279132  decreased coverage  0.0000000183924 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3434  DNA mismatch repair protein  37.5 
 
 		 644 aa  224  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0482547  normal  0.130022 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3712  DNA mismatch repair protein  37.23 
 
 		 637 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0556  DNA mismatch repair protein  37.67 
 
 		 638 aa  223  6e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000137773  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3282  DNA mismatch repair protein  35.88 
 
 		 641 aa  223  6e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.645074  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  37.5 
 
 		 644 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0595  DNA mismatch repair protein  37.95 
 
 		 648 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000232497 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  37.32 
 
 		 611 aa  220  5e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3542  DNA mismatch repair protein  37.94 
 
 		 628 aa  220  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  36.71 
 
 		 633 aa  220  6e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  36.15 
 
 		 633 aa  220  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0601  DNA mismatch repair protein  36.68 
 
 		 631 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0795  DNA mismatch repair protein  37.04 
 
 		 624 aa  219  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.741444  hitchhiker  0.00456525 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  35.86 
 
 		 633 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  35.76 
 
 		 623 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3313  DNA mismatch repair protein  37.71 
 
 		 619 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  33.41 
 
 		 635 aa  217  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  36.15 
 
 		 648 aa  216  8e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4172  DNA mismatch repair protein  37.13 
 
 		 614 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5686  DNA mismatch repair protein  37.57 
 
 		 615 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000161678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3843  DNA mismatch repair protein  37.57 
 
 		 615 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000795964  hitchhiker  0.000000387336 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4641  DNA mismatch repair protein  37.57 
 
 		 615 aa  213  7e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.231193  normal  0.0766044 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3207  DNA mismatch repair protein  37.47 
 
 		 665 aa  213  7e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000351816  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04037  DNA mismatch repair protein  37.75 
 
 		 615 aa  213  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0484513  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3823  DNA mismatch repair protein MutL  37.75 
 
 		 615 aa  213  7.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000414583  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2754  DNA mismatch repair protein  37.21 
 
 		 634 aa  213  7.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4728  DNA mismatch repair protein  37.75 
 
 		 615 aa  213  9e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0929403  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0564  DNA mismatch repair protein  33.9 
 
 		 631 aa  213  9e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.273606 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4412  DNA mismatch repair protein  37.75 
 
 		 615 aa  213  9e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0194282  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4701  DNA mismatch repair protein  37.75 
 
 		 615 aa  213  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915673  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  31.77 
 
 		 629 aa  212  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  35.57 
 
 		 641 aa  212  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  35.76 
 
 		 645 aa  210  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4777  DNA mismatch repair protein  36.71 
 
 		 618 aa  210  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00171491  normal  0.0289843 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4627  DNA mismatch repair protein  36.71 
 
 		 618 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4637  DNA mismatch repair protein  36.71 
 
 		 618 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000512951  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0429  DNA mismatch repair protein  37.72 
 
 		 624 aa  209  8e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000237281  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4756  DNA mismatch repair protein  36.71 
 
 		 618 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  36.34 
 
 		 641 aa  209  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4720  DNA mismatch repair protein  36.42 
 
 		 618 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  35.79 
 
 		 626 aa  208  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  35.96 
 
 		 630 aa  208  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3723  DNA mismatch repair protein  38.26 
 
 		 669 aa  207  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0150049  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0353  DNA mismatch repair protein  36.73 
 
 		 613 aa  207  4e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.114284  hitchhiker  0.00160708 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  37.54 
 
 		 598 aa  207  5e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0533  DNA mismatch repair protein  38.84 
 
 		 629 aa  207  6e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000857622  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  34.15 
 
 		 630 aa  207  6e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2779  DNA mismatch repair protein  37.71 
 
 		 652 aa  206  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3921  DNA mismatch repair protein  37.97 
 
 		 661 aa  205  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0286731  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0584  DNA mismatch repair protein MutL  36.39 
 
 		 602 aa  205  2e-51  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.969564  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1083  DNA mismatch repair protein  36.73 
 
 		 615 aa  205  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0490  DNA mismatch repair protein  38.26 
 
 		 649 aa  204  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00424491  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0701  DNA mismatch repair protein  36.14 
 
 		 635 aa  203  7e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.138509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3655  DNA mismatch repair protein  36.14 
 
 		 635 aa  203  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0128216  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3801  DNA mismatch repair protein  36.14 
 
 		 635 aa  203  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  35.67 
 
 		 620 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  34.37 
 
 		 613 aa  200  5e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3240  DNA mismatch repair protein MutL  36.05 
 
 		 628 aa  200  6e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  35.73 
 
 		 661 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0734  DNA mismatch repair protein  36.01 
 
 		 667 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002257  DNA mismatch repair protein MutL  35.51 
 
 		 670 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.558957  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2756  DNA mismatch repair protein  36 
 
 		 653 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3027  DNA mismatch repair protein  37.35 
 
 		 650 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0173835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  36.01 
 
 		 667 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  36.01 
 
 		 667 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  36.89 
 
 		 621 aa  197  5.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00096  DNA mismatch repair protein  34.94 
 
 		 681 aa  196  7e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0336  DNA mismatch repair protein  35.86 
 
 		 583 aa  196  8.000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00211885  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  36.89 
 
 		 619 aa  196  1e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  35.26 
 
 		 595 aa  196  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  35.26 
 
 		 595 aa  196  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  35.07 
 
 		 607 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  35.07 
 
 		 607 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  35.07 
 
 		 608 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  36.22 
 
 		 661 aa  194  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  35.42 
 
 		 661 aa  194  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  34.12 
 
 		 628 aa  194  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  35.42 
 
 		 601 aa  193  6e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  34.9 
 
 		 662 aa  193  8e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0323  DNA mismatch repair protein MutL  35.61 
 
 		 652 aa  192  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  34.41 
 
 		 684 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2752  DNA mismatch repair protein MutL  36.26 
 
 		 576 aa  192  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1085  DNA mismatch repair protein  34.41 
 
 		 684 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  34.41 
 
 		 684 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  34.41 
 
 		 681 aa  192  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3976  DNA mismatch repair protein MutL  35.09 
 
 		 639 aa  192  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  34.41 
 
 		 684 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0750  DNA mismatch repair protein  35 
 
 		 687 aa  192  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.536316  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>