60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0572 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0572  hypothetical protein  100 
 
 		 504 aa  1015    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0757  hypothetical protein  33.85 
 
 		 436 aa  139  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0113754  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0934  ATPase  30.62 
 
 		 486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  hitchhiker  0.0000000256881 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0006  hypothetical protein  32.07 
 
 		 497 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4266  hypothetical protein  30.75 
 
 		 529 aa  128  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0277  hypothetical protein  30.48 
 
 		 483 aa  125  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0567  hypothetical protein  33.24 
 
 		 438 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.602713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2368  hypothetical protein  31.68 
 
 		 486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.475897  normal  0.189398 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4751  hypothetical protein  27.59 
 
 		 537 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177586  normal  0.857198 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3071  hypothetical protein  29.02 
 
 		 502 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0291  hypothetical protein  27.19 
 
 		 538 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0755  ATPase  32.94 
 
 		 520 aa  104  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2743  hypothetical protein  30.86 
 
 		 494 aa  102  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128363  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2087  hypothetical protein  31.37 
 
 		 500 aa  96.3  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.777544  normal  0.0799361 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2478  hypothetical protein  25 
 
 		 566 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000510929  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0743  hypothetical protein  25.54 
 
 		 575 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00289763  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4618  hypothetical protein  30.45 
 
 		 509 aa  67.4  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0329503  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8689  hypothetical protein  26.82 
 
 		 663 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0595  hypothetical protein  30.34 
 
 		 629 aa  54.7  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  40 
 
 		 454 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  38.54 
 
 		 616 aa  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2869  DNA mismatch repair protein MutL  33.33 
 
 		 605 aa  52  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110636 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06316  ATP-binding protein (Eurofung)  32.71 
 
 		 1228 aa  51.6  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  34.41 
 
 		 644 aa  48.5  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0795  DNA mismatch repair protein  33.68 
 
 		 624 aa  48.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.741444  hitchhiker  0.00456525 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 		 453 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1300  DNA mismatch repair protein MutL  33.33 
 
 		 698 aa  46.6  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0863563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  37.23 
 
 		 622 aa  46.6  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0893  DNA mismatch repair protein MutL  34.41 
 
 		 657 aa  45.8  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54331  mutl-like protein 1  34.78 
 
 		 695 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719113  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002257  DNA mismatch repair protein MutL  33.93 
 
 		 670 aa  45.8  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.558957  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0978  DNA mismatch repair protein MutL  34.41 
 
 		 657 aa  45.4  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3282  DNA mismatch repair protein  36.56 
 
 		 641 aa  45.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.645074  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  33.96 
 
 		 660 aa  45.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1413  hypothetical protein  23.96 
 
 		 780 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal  0.0265607 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  34.57 
 
 		 648 aa  45.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  28.36 
 
 		 630 aa  45.1  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0564  DNA mismatch repair protein  34.07 
 
 		 631 aa  44.7  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.273606 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4172  DNA mismatch repair protein  33.33 
 
 		 614 aa  44.7  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  34.88 
 
 		 644 aa  44.7  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00096  DNA mismatch repair protein  34.38 
 
 		 681 aa  44.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0323  DNA mismatch repair protein MutL  35.16 
 
 		 652 aa  44.3  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0306  hypothetical protein  27.74 
 
 		 608 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0018054  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1087  DNA mismatch repair protein MutL  37.93 
 
 		 582 aa  43.9  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0917186  normal  0.0241297 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3071  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 		 360 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2929  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 		 360 aa  44.3  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2946  DNA mismatch repair protein  34.29 
 
 		 629 aa  43.9  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3313  DNA mismatch repair protein  29.59 
 
 		 619 aa  44.3  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2779  DNA mismatch repair protein  33.67 
 
 		 652 aa  43.9  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2939  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 		 360 aa  43.9  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.924574  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1434  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 		 360 aa  43.9  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1083  DNA mismatch repair protein  31.4 
 
 		 615 aa  43.5  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4089  Osmosensitive K channel His kinase sensor  40 
 
 		 845 aa  43.5  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3895  DNA mismatch repair protein  29.67 
 
 		 638 aa  43.5  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.329435  normal  0.756046 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  28.71 
 
 		 615 aa  43.5  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2630  DNA mismatch repair protein MutL  35.35 
 
 		 565 aa  43.5  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  30.77 
 
 		 608 aa  43.1  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3919  hypothetical protein  31.82 
 
 		 447 aa  43.5  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.713535  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2807  DNA topoisomerase VI subunit B  26.21 
 
 		 621 aa  43.5  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000949011  hitchhiker  0.00390833 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0601  DNA mismatch repair protein  35.48 
 
 		 631 aa  43.5  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>