13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3919 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3919  hypothetical protein  100 
 
 
447 aa  920    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.713535  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0525  hypothetical protein  48.97 
 
 
448 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000539959  normal  0.748785 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2161  hypothetical protein  35 
 
 
457 aa  232  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.138139  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7050  hypothetical protein  33.33 
 
 
453 aa  206  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4983  hypothetical protein  30.8 
 
 
475 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4034  hypothetical protein  30.32 
 
 
466 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.332359  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2512  hypothetical protein  34.48 
 
 
317 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0527  hypothetical protein  26.55 
 
 
573 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000194585  normal  0.666822 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2513  hypothetical protein  31.43 
 
 
137 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4618  hypothetical protein  27.33 
 
 
509 aa  50.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0329503  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0143  hypothetical protein  29.33 
 
 
344 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278866  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4266  hypothetical protein  27.41 
 
 
529 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2743  hypothetical protein  27.03 
 
 
494 aa  43.5  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>