21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4751 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4751  hypothetical protein  100 
 
 		 537 aa  1102    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177586  normal  0.857198 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0291  hypothetical protein  51.53 
 
 		 538 aa  550  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2368  hypothetical protein  32.92 
 
 		 486 aa  190  7e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.475897  normal  0.189398 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0567  hypothetical protein  33.25 
 
 		 438 aa  186  7e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.602713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0755  ATPase  34.81 
 
 		 520 aa  176  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0757  hypothetical protein  30.15 
 
 		 436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0113754  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4266  hypothetical protein  32.25 
 
 		 529 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4618  hypothetical protein  28.73 
 
 		 509 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0329503  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2743  hypothetical protein  32.37 
 
 		 494 aa  154  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128363  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0934  ATPase  29.43 
 
 		 486 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  hitchhiker  0.0000000256881 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0277  hypothetical protein  31.59 
 
 		 483 aa  143  6e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0006  hypothetical protein  32.17 
 
 		 497 aa  143  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3071  hypothetical protein  31.25 
 
 		 502 aa  126  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0572  hypothetical protein  28.65 
 
 		 504 aa  109  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2087  hypothetical protein  34.92 
 
 		 500 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.777544  normal  0.0799361 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0743  hypothetical protein  26.91 
 
 		 575 aa  106  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00289763  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2478  hypothetical protein  24.61 
 
 		 566 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000510929  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0306  hypothetical protein  27.54 
 
 		 608 aa  69.7  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0018054  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0595  hypothetical protein  28.81 
 
 		 629 aa  67  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8689  hypothetical protein  25.4 
 
 		 663 aa  51.2  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17648  predicted protein  20.5 
 
 		 904 aa  50.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.571817  normal  0.0825581 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>