95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0757 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0757  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  884    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0113754  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0567  hypothetical protein  60.93 
 
 		 438 aa  499  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.602713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0277  hypothetical protein  33.33 
 
 		 483 aa  209  6e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4266  hypothetical protein  36.31 
 
 		 529 aa  195  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0291  hypothetical protein  31.91 
 
 		 538 aa  192  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0006  hypothetical protein  34.09 
 
 		 497 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2087  hypothetical protein  38.01 
 
 		 500 aa  184  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.777544  normal  0.0799361 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0934  ATPase  30.41 
 
 		 486 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  hitchhiker  0.0000000256881 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2743  hypothetical protein  35.63 
 
 		 494 aa  178  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128363  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4751  hypothetical protein  30.15 
 
 		 537 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177586  normal  0.857198 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2368  hypothetical protein  31.79 
 
 		 486 aa  171  3e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.475897  normal  0.189398 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3071  hypothetical protein  33.24 
 
 		 502 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0755  ATPase  32.3 
 
 		 520 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0572  hypothetical protein  33.85 
 
 		 504 aa  138  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4618  hypothetical protein  30.05 
 
 		 509 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0329503  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2478  hypothetical protein  23.57 
 
 		 566 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000510929  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0743  hypothetical protein  28.9 
 
 		 575 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00289763  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0306  hypothetical protein  30.59 
 
 		 608 aa  77  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0018054  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0595  hypothetical protein  31.02 
 
 		 629 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8689  hypothetical protein  35.65 
 
 		 663 aa  53.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  40.45 
 
 		 606 aa  51.2  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04037  DNA mismatch repair protein  42.22 
 
 		 615 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0484513  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4728  DNA mismatch repair protein  42.22 
 
 		 615 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0929403  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5686  DNA mismatch repair protein  42.22 
 
 		 615 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000161678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4412  DNA mismatch repair protein  42.22 
 
 		 615 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0194282  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3823  DNA mismatch repair protein MutL  42.22 
 
 		 615 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000414583  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4701  DNA mismatch repair protein  42.22 
 
 		 615 aa  50.1  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915673  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4641  DNA mismatch repair protein  42.22 
 
 		 615 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.231193  normal  0.0766044 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  51.02 
 
 		 643 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4777  DNA mismatch repair protein  41.11 
 
 		 618 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00171491  normal  0.0289843 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3843  DNA mismatch repair protein  41.11 
 
 		 615 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000795964  hitchhiker  0.000000387336 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  40.45 
 
 		 616 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4720  DNA mismatch repair protein  41.11 
 
 		 618 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4627  DNA mismatch repair protein  41.11 
 
 		 618 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4756  DNA mismatch repair protein  41.11 
 
 		 618 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  40.45 
 
 		 632 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3801  DNA mismatch repair protein  40 
 
 		 635 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  35.56 
 
 		 559 aa  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4637  DNA mismatch repair protein  41.11 
 
 		 618 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000512951  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0701  DNA mismatch repair protein  40 
 
 		 635 aa  48.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.138509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0490  DNA mismatch repair protein  42.22 
 
 		 649 aa  48.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00424491  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3655  DNA mismatch repair protein  40 
 
 		 635 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0128216  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01680  mismatch repair-related protein, putative  27.53 
 
 		 759 aa  48.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2869  DNA mismatch repair protein MutL  35.71 
 
 		 605 aa  47.8  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110636 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0293  DNA mismatch repair protein MutL  38.37 
 
 		 532 aa  47.8  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1289  DNA mismatch repair protein MutL  39.56 
 
 		 765 aa  47.4  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1087  DNA mismatch repair protein MutL  39.77 
 
 		 582 aa  47.4  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0917186  normal  0.0241297 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6625  DNA mismatch repair protein MutL  37.65 
 
 		 641 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406254  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1083  DNA mismatch repair protein  38.04 
 
 		 615 aa  47.4  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1011  DNA mismatch repair protein MutL  34.12 
 
 		 637 aa  47  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.266056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1413  hypothetical protein  29.73 
 
 		 780 aa  47  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal  0.0265607 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4780  DNA mismatch repair protein MutL  39.33 
 
 		 671 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.131576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0353  DNA mismatch repair protein  27.01 
 
 		 613 aa  46.6  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.114284  hitchhiker  0.00160708 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1478  DNA mismatch repair protein MutL  38.55 
 
 		 557 aa  46.6  0.0009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.064699  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00096  DNA mismatch repair protein  38.89 
 
 		 681 aa  46.2  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002257  DNA mismatch repair protein MutL  36.17 
 
 		 670 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.558957  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1729  DNA mismatch repair protein MutL  29.37 
 
 		 763 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  38.67 
 
 		 644 aa  46.2  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4172  DNA mismatch repair protein  37.78 
 
 		 614 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  46.94 
 
 		 601 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2756  DNA mismatch repair protein  40 
 
 		 653 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0795  DNA mismatch repair protein  37.78 
 
 		 624 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.741444  hitchhiker  0.00456525 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  39.33 
 
 		 612 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  38.2 
 
 		 687 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0595  DNA mismatch repair protein  38.89 
 
 		 648 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000232497 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0336  DNA mismatch repair protein  48.98 
 
 		 583 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00211885  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  38.2 
 
 		 661 aa  45.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3282  DNA mismatch repair protein  38.89 
 
 		 641 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.645074  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0429  DNA mismatch repair protein  41.11 
 
 		 624 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000237281  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2779  DNA mismatch repair protein  40 
 
 		 652 aa  45.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  35.87 
 
 		 630 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0007  DNA mismatch repair protein MutL  32.99 
 
 		 709 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.953905  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0596  DNA mismatch repair protein  38.89 
 
 		 644 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0279132  decreased coverage  0.0000000183924 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3434  DNA mismatch repair protein  38.89 
 
 		 644 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0482547  normal  0.130022 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  52.5 
 
 		 692 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  48.98 
 
 		 594 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  34.94 
 
 		 644 aa  44.7  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  36 
 
 		 610 aa  45.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  41.94 
 
 		 648 aa  44.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3921  DNA mismatch repair protein  40 
 
 		 661 aa  44.3  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0286731  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17648  predicted protein  33.33 
 
 		 904 aa  44.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.571817  normal  0.0825581 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06316  ATP-binding protein (Eurofung)  28.49 
 
 		 1228 aa  43.9  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3217  DNA mismatch repair protein MutL  34.41 
 
 		 762 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0687703 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3723  DNA mismatch repair protein  40 
 
 		 669 aa  43.9  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0150049  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  43.9 
 
 		 623 aa  43.9  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  36.05 
 
 		 626 aa  43.9  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00647  DNA mismatch repair protein  38.89 
 
 		 608 aa  43.5  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.893353  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7371  DNA mismatch repair protein MutL  36.47 
 
 		 621 aa  43.5  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  35.16 
 
 		 628 aa  43.5  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0564  DNA mismatch repair protein  36.67 
 
 		 631 aa  43.5  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.273606 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  36.96 
 
 		 641 aa  43.5  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  35.35 
 
 		 629 aa  43.1  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0601  DNA mismatch repair protein  37.78 
 
 		 631 aa  43.1  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3542  DNA mismatch repair protein  37.78 
 
 		 628 aa  43.1  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  34.88 
 
 		 615 aa  43.1  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>