21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0755 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0755  ATPase  100 
 
 		 520 aa  1047    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0277  hypothetical protein  34.55 
 
 		 483 aa  258  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0006  hypothetical protein  34.95 
 
 		 497 aa  253  6e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2087  hypothetical protein  37.72 
 
 		 500 aa  248  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.777544  normal  0.0799361 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0934  ATPase  31.82 
 
 		 486 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  hitchhiker  0.0000000256881 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3071  hypothetical protein  33.67 
 
 		 502 aa  230  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4266  hypothetical protein  33.87 
 
 		 529 aa  228  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2743  hypothetical protein  36.49 
 
 		 494 aa  224  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128363  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2368  hypothetical protein  30.41 
 
 		 486 aa  211  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.475897  normal  0.189398 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4751  hypothetical protein  34.81 
 
 		 537 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177586  normal  0.857198 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0567  hypothetical protein  36.9 
 
 		 438 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.602713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0291  hypothetical protein  33.62 
 
 		 538 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0757  hypothetical protein  32.3 
 
 		 436 aa  157  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0113754  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4618  hypothetical protein  34.03 
 
 		 509 aa  121  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0329503  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0572  hypothetical protein  32.94 
 
 		 504 aa  104  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0743  hypothetical protein  23.84 
 
 		 575 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00289763  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0306  hypothetical protein  29.91 
 
 		 608 aa  71.2  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0018054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2478  hypothetical protein  23.18 
 
 		 566 aa  65.1  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000510929  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0595  hypothetical protein  30.18 
 
 		 629 aa  56.6  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8689  hypothetical protein  36.19 
 
 		 663 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0298  hypothetical protein  29.79 
 
 		 543 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>