23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0934 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0934  ATPase  100 
 
 		 486 aa  1003    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  hitchhiker  0.0000000256881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4266  hypothetical protein  36.23 
 
 		 529 aa  273  6e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0006  hypothetical protein  34.8 
 
 		 497 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0277  hypothetical protein  34.29 
 
 		 483 aa  259  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2368  hypothetical protein  36.55 
 
 		 486 aa  258  2e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.475897  normal  0.189398 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2743  hypothetical protein  32.49 
 
 		 494 aa  238  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128363  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0755  ATPase  31.82 
 
 		 520 aa  236  9e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3071  hypothetical protein  33.12 
 
 		 502 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2087  hypothetical protein  31.83 
 
 		 500 aa  206  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.777544  normal  0.0799361 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0567  hypothetical protein  32.4 
 
 		 438 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.602713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0757  hypothetical protein  30.41 
 
 		 436 aa  180  4.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0113754  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0291  hypothetical protein  29.46 
 
 		 538 aa  150  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4751  hypothetical protein  29.43 
 
 		 537 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177586  normal  0.857198 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0572  hypothetical protein  30.29 
 
 		 504 aa  131  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4618  hypothetical protein  27.96 
 
 		 509 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0329503  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2478  hypothetical protein  22.89 
 
 		 566 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000510929  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0306  hypothetical protein  26.11 
 
 		 608 aa  71.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0018054  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0743  hypothetical protein  21.34 
 
 		 575 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00289763  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0595  hypothetical protein  26.72 
 
 		 629 aa  65.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  32.61 
 
 		 628 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8689  hypothetical protein  27.37 
 
 		 663 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4172  DNA mismatch repair protein  30 
 
 		 614 aa  44.7  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3783  histidine kinase  32.77 
 
 		 946 aa  44.3  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>