41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2743 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2743  hypothetical protein  100 
 
 		 494 aa  991    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128363  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0006  hypothetical protein  41.79 
 
 		 497 aa  346  6e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3071  hypothetical protein  41.39 
 
 		 502 aa  317  4e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0277  hypothetical protein  40.97 
 
 		 483 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2368  hypothetical protein  35.92 
 
 		 486 aa  277  3e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.475897  normal  0.189398 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2087  hypothetical protein  39.92 
 
 		 500 aa  270  4e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.777544  normal  0.0799361 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4266  hypothetical protein  36.53 
 
 		 529 aa  261  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0934  ATPase  32.49 
 
 		 486 aa  246  6e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  hitchhiker  0.0000000256881 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0755  ATPase  36.49 
 
 		 520 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0757  hypothetical protein  35.63 
 
 		 436 aa  186  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0113754  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0567  hypothetical protein  36.77 
 
 		 438 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.602713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0291  hypothetical protein  31.29 
 
 		 538 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4751  hypothetical protein  32.66 
 
 		 537 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177586  normal  0.857198 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4618  hypothetical protein  30.17 
 
 		 509 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0329503  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0572  hypothetical protein  31.05 
 
 		 504 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2478  hypothetical protein  23.92 
 
 		 566 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000510929  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0743  hypothetical protein  22.19 
 
 		 575 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00289763  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0595  hypothetical protein  28.63 
 
 		 629 aa  64.3  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0306  hypothetical protein  28.98 
 
 		 608 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0018054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8689  hypothetical protein  40.16 
 
 		 663 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0856  heat shock protein 90  27.88 
 
 		 627 aa  52.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.585619 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1083  DNA mismatch repair protein  30 
 
 		 615 aa  49.3  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  34.29 
 
 		 661 aa  45.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00647  DNA mismatch repair protein  32.61 
 
 		 608 aa  45.4  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.893353  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  34.29 
 
 		 687 aa  45.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2946  DNA mismatch repair protein  34.74 
 
 		 629 aa  45.1  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4780  DNA mismatch repair protein MutL  34.29 
 
 		 671 aa  45.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.131576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  35.05 
 
 		 606 aa  44.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4172  DNA mismatch repair protein  32.35 
 
 		 614 aa  44.7  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  37.11 
 
 		 612 aa  44.3  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0601  DNA mismatch repair protein  33.65 
 
 		 631 aa  43.9  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0413  heat shock protein 90  25 
 
 		 623 aa  43.9  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0417  heat shock protein 90  25 
 
 		 623 aa  43.9  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0746567  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1289  DNA mismatch repair protein MutL  32.63 
 
 		 765 aa  44.3  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0564  DNA mismatch repair protein  33.65 
 
 		 631 aa  43.9  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.273606 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  35.29 
 
 		 620 aa  43.9  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0923  DNA mismatch repair protein MutL  32.63 
 
 		 516 aa  43.5  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3919  hypothetical protein  27.03 
 
 		 447 aa  43.5  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.713535  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3434  DNA mismatch repair protein  30.71 
 
 		 644 aa  43.5  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0482547  normal  0.130022 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0596  DNA mismatch repair protein  30.71 
 
 		 644 aa  43.5  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0279132  decreased coverage  0.0000000183924 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  32 
 
 		 602 aa  43.1  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>