27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4618 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4618  hypothetical protein  100 
 
 		 509 aa  1050    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0329503  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4751  hypothetical protein  28.73 
 
 		 537 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177586  normal  0.857198 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0291  hypothetical protein  28.12 
 
 		 538 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4266  hypothetical protein  30.51 
 
 		 529 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2368  hypothetical protein  28.04 
 
 		 486 aa  124  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.475897  normal  0.189398 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0755  ATPase  34.03 
 
 		 520 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0757  hypothetical protein  30.59 
 
 		 436 aa  120  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0113754  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2743  hypothetical protein  30.17 
 
 		 494 aa  120  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128363  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0277  hypothetical protein  32.42 
 
 		 483 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0567  hypothetical protein  31.44 
 
 		 438 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.602713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0006  hypothetical protein  30.23 
 
 		 497 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3071  hypothetical protein  32.29 
 
 		 502 aa  110  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0743  hypothetical protein  24.72 
 
 		 575 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00289763  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2087  hypothetical protein  32.87 
 
 		 500 aa  108  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.777544  normal  0.0799361 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0934  ATPase  27.96 
 
 		 486 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  hitchhiker  0.0000000256881 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2478  hypothetical protein  22.16 
 
 		 566 aa  86.7  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000510929  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0306  hypothetical protein  26.85 
 
 		 608 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0018054  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0572  hypothetical protein  30.45 
 
 		 504 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0595  hypothetical protein  27.5 
 
 		 629 aa  61.6  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1413  hypothetical protein  24.63 
 
 		 780 aa  54.7  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal  0.0265607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8689  hypothetical protein  31.86 
 
 		 663 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3919  hypothetical protein  27.33 
 
 		 447 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.713535  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2281  hypothetical protein  23.62 
 
 		 780 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4697  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35.71 
 
 		 527 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.269439  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0680  sensor histidine kinase  31.11 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0298  hypothetical protein  33.33 
 
 		 543 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1043  hypothetical protein  23.91 
 
 		 344 aa  43.5  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0877551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>