68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2368 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2368  hypothetical protein  100 
 
 
486 aa  1010    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.475897  normal  0.189398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4266  hypothetical protein  38.46 
 
 
529 aa  318  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0006  hypothetical protein  36.68 
 
 
497 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2743  hypothetical protein  35.92 
 
 
494 aa  273  5.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128363  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0934  ATPase  36.55 
 
 
486 aa  258  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  hitchhiker  0.0000000256881 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0277  hypothetical protein  34.24 
 
 
483 aa  257  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3071  hypothetical protein  33.7 
 
 
502 aa  239  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2087  hypothetical protein  32.53 
 
 
500 aa  219  7.999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.777544  normal  0.0799361 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0755  ATPase  30.41 
 
 
520 aa  211  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4751  hypothetical protein  32.92 
 
 
537 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177586  normal  0.857198 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0291  hypothetical protein  33.61 
 
 
538 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0757  hypothetical protein  31.9 
 
 
436 aa  171  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0113754  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0567  hypothetical protein  32.01 
 
 
438 aa  170  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.602713  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4618  hypothetical protein  28.04 
 
 
509 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0329503  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0572  hypothetical protein  31.68 
 
 
504 aa  113  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0743  hypothetical protein  25.76 
 
 
575 aa  101  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00289763  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2478  hypothetical protein  24.34 
 
 
566 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000510929  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0306  hypothetical protein  28.5 
 
 
608 aa  80.5  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0018054  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0595  hypothetical protein  29.71 
 
 
629 aa  77  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8689  hypothetical protein  36.52 
 
 
663 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0323  DNA mismatch repair protein MutL  32.67 
 
 
652 aa  53.9  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2474  heat shock protein 90  31.19 
 
 
636 aa  51.6  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0369006  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2657  heat shock protein 90  31.19 
 
 
636 aa  50.1  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0502417  hitchhiker  0.00031577 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3895  DNA mismatch repair protein  35.71 
 
 
638 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.329435  normal  0.756046 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0556  DNA mismatch repair protein  35.71 
 
 
638 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000137773  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3769  DNA mismatch repair protein  35.71 
 
 
630 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00256823  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3712  DNA mismatch repair protein  35.71 
 
 
637 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  32.04 
 
 
615 aa  48.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3434  DNA mismatch repair protein  33.67 
 
 
644 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0482547  normal  0.130022 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3387  heat shock protein 90  25.69 
 
 
643 aa  47.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0795  DNA mismatch repair protein  34.69 
 
 
624 aa  47.4  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.741444  hitchhiker  0.00456525 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0596  DNA mismatch repair protein  33.67 
 
 
644 aa  47.4  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0279132  decreased coverage  0.0000000183924 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0595  DNA mismatch repair protein  33.67 
 
 
648 aa  47.4  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000232497 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2497  heat shock protein 90  32 
 
 
632 aa  47  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.558694  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1521  DNA mismatch repair protein MutL  30.19 
 
 
540 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54331  mutl-like protein 1  34.07 
 
 
695 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719113  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1083  DNA mismatch repair protein  32.65 
 
 
615 aa  46.6  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4650  heat shock protein 90  32.29 
 
 
651 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865896  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0226  DNA mismatch repair protein MutL  29.17 
 
 
608 aa  45.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0607304  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  28.26 
 
 
559 aa  45.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0601  DNA mismatch repair protein  32.65 
 
 
631 aa  45.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  28.43 
 
 
598 aa  45.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5377  Heat shock protein Hsp90-like protein  31.62 
 
 
657 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3921  DNA mismatch repair protein  29.59 
 
 
661 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0286731  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  36.73 
 
 
613 aa  45.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3282  DNA mismatch repair protein  32.65 
 
 
641 aa  45.8  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.645074  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3542  DNA mismatch repair protein  32.65 
 
 
628 aa  45.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2214  heat shock protein 90  33.33 
 
 
642 aa  45.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000258546  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4172  DNA mismatch repair protein  33.33 
 
 
614 aa  45.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0268  histidine kinase  28.97 
 
 
738 aa  44.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2392  heat shock protein 90  30.1 
 
 
646 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393625  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3207  DNA mismatch repair protein  32.65 
 
 
665 aa  45.1  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000351816  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3723  DNA mismatch repair protein  29.59 
 
 
669 aa  45.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0150049  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0564  DNA mismatch repair protein  31.25 
 
 
631 aa  44.7  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.273606 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  34.83 
 
 
647 aa  44.3  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0860  heat shock protein Hsp90  34.04 
 
 
628 aa  44.3  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2779  DNA mismatch repair protein  30.61 
 
 
652 aa  44.3  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1817  heat shock protein 90  31.25 
 
 
651 aa  43.9  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290243  normal  0.0459301 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1127  heat shock protein 90  32.98 
 
 
636 aa  44.3  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618251  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  34.83 
 
 
636 aa  43.9  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1694  heat shock protein 90  34.02 
 
 
642 aa  43.9  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000812409  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00647  DNA mismatch repair protein  30.61 
 
 
608 aa  43.9  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.893353  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3976  DNA mismatch repair protein MutL  28.57 
 
 
639 aa  43.9  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  33.33 
 
 
635 aa  43.5  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1609  heat shock protein 90  30.19 
 
 
630 aa  43.5  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0429  DNA mismatch repair protein  31.68 
 
 
624 aa  43.1  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000237281  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3701  Heat shock protein Hsp90-like protein  28.8 
 
 
640 aa  43.1  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93558  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  29.21 
 
 
628 aa  43.1  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>