More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0226 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0226  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 
608 aa  1216    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0607304  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  32.01 
 
 
630 aa  347  5e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  31 
 
 
632 aa  336  7.999999999999999e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  29.39 
 
 
629 aa  329  1.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  29.76 
 
 
625 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  30.61 
 
 
645 aa  327  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  29.76 
 
 
611 aa  325  1e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  30.06 
 
 
628 aa  326  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  30.45 
 
 
648 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  32.38 
 
 
630 aa  325  2e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  29.32 
 
 
623 aa  325  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  29.34 
 
 
633 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  29.49 
 
 
622 aa  323  6e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  29.19 
 
 
621 aa  323  7e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  29.38 
 
 
632 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  30.13 
 
 
613 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  30.18 
 
 
635 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  29.61 
 
 
594 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  29.58 
 
 
643 aa  321  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  29.13 
 
 
619 aa  321  3e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  29.18 
 
 
632 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  30.55 
 
 
641 aa  320  3.9999999999999996e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  31.86 
 
 
589 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  29.23 
 
 
633 aa  320  6e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  32.3 
 
 
665 aa  319  1e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  31.89 
 
 
669 aa  318  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  31.5 
 
 
626 aa  318  1e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  28.48 
 
 
636 aa  318  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  28.73 
 
 
647 aa  318  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  28.22 
 
 
655 aa  318  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  28.41 
 
 
635 aa  318  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  30.03 
 
 
626 aa  317  4e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  30.97 
 
 
644 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  28.29 
 
 
602 aa  315  1.9999999999999998e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  29.1 
 
 
652 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  28.3 
 
 
643 aa  313  3.9999999999999997e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  28.87 
 
 
603 aa  313  4.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  29.97 
 
 
622 aa  311  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  29.43 
 
 
661 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  29.03 
 
 
661 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  30.97 
 
 
644 aa  310  4e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  30.08 
 
 
624 aa  310  4e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  31.22 
 
 
600 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  32.46 
 
 
645 aa  308  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  31.4 
 
 
624 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1626  DNA mismatch repair protein  29.36 
 
 
603 aa  307  3e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  29.98 
 
 
626 aa  307  5.0000000000000004e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  29.21 
 
 
582 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  29.34 
 
 
599 aa  306  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0267  DNA mismatch repair protein MutL  31.59 
 
 
622 aa  306  6e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000997696 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  28.85 
 
 
597 aa  306  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  28.85 
 
 
606 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  29.67 
 
 
611 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  32.24 
 
 
586 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  29.6 
 
 
616 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  30.67 
 
 
620 aa  305  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  31.43 
 
 
603 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  30.08 
 
 
620 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  29.53 
 
 
595 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  28.46 
 
 
597 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0215  DNA mismatch repair protein MutL  32.58 
 
 
608 aa  302  9e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.137951 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  27.27 
 
 
691 aa  302  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  30.12 
 
 
659 aa  301  3e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  29.55 
 
 
644 aa  301  3e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  28.98 
 
 
622 aa  301  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  31.1 
 
 
640 aa  300  5e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  32.45 
 
 
639 aa  300  7e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  31.61 
 
 
631 aa  298  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1172  DNA mismatch repair protein  31.76 
 
 
674 aa  298  2e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  27.15 
 
 
607 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  27.23 
 
 
620 aa  297  4e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  27.09 
 
 
607 aa  296  7e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  28.77 
 
 
612 aa  296  9e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  29.43 
 
 
603 aa  295  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  27.57 
 
 
644 aa  296  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  29.24 
 
 
680 aa  295  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  28.8 
 
 
606 aa  294  4e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7371  DNA mismatch repair protein MutL  28.64 
 
 
621 aa  293  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0893  DNA mismatch repair protein MutL  27.31 
 
 
657 aa  294  4e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  28.81 
 
 
603 aa  294  4e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  30.36 
 
 
600 aa  294  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  30.88 
 
 
605 aa  293  6e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  30.19 
 
 
617 aa  293  6e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  27.12 
 
 
608 aa  293  6e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  27.89 
 
 
660 aa  293  7e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  28.41 
 
 
626 aa  293  7e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  28.41 
 
 
602 aa  292  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  31.19 
 
 
648 aa  292  1e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1125  DNA mismatch repair protein MutL  27.13 
 
 
651 aa  291  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  30.06 
 
 
630 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0978  DNA mismatch repair protein MutL  26.85 
 
 
657 aa  292  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  30.48 
 
 
629 aa  291  2e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  29.59 
 
 
608 aa  291  2e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  29.27 
 
 
621 aa  291  3e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  28.78 
 
 
604 aa  291  3e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  27.79 
 
 
628 aa  291  3e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  30.39 
 
 
611 aa  290  4e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  28.9 
 
 
647 aa  290  4e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  29.5 
 
 
615 aa  290  6e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3308  DNA mismatch repair protein MutL  27.27 
 
 
664 aa  290  6e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>