18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8689 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8689  hypothetical protein  100 
 
 		 663 aa  1369    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0306  hypothetical protein  33.13 
 
 		 608 aa  273  9e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0018054  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0595  hypothetical protein  33.28 
 
 		 629 aa  271  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0567  hypothetical protein  26.74 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.602713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3071  hypothetical protein  36.36 
 
 		 502 aa  60.1  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2368  hypothetical protein  36.52 
 
 		 486 aa  59.7  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.475897  normal  0.189398 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0572  hypothetical protein  26.05 
 
 		 504 aa  59.3  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0277  hypothetical protein  35.65 
 
 		 483 aa  58.9  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0006  hypothetical protein  33.82 
 
 		 497 aa  55.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2743  hypothetical protein  40.16 
 
 		 494 aa  55.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128363  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4266  hypothetical protein  29.21 
 
 		 529 aa  54.7  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0291  hypothetical protein  22.62 
 
 		 538 aa  53.9  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0757  hypothetical protein  35.65 
 
 		 436 aa  53.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0113754  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4618  hypothetical protein  31.86 
 
 		 509 aa  51.6  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0329503  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4751  hypothetical protein  25.4 
 
 		 537 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177586  normal  0.857198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0743  hypothetical protein  23.57 
 
 		 575 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00289763  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0755  ATPase  36.19 
 
 		 520 aa  49.7  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0934  ATPase  27.37 
 
 		 486 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  hitchhiker  0.0000000256881 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>