22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0743 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0743  hypothetical protein  100 
 
 		 575 aa  1179    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00289763  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2478  hypothetical protein  42.15 
 
 		 566 aa  429  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000510929  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4618  hypothetical protein  24.72 
 
 		 509 aa  108  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0329503  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4751  hypothetical protein  26.91 
 
 		 537 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177586  normal  0.857198 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2368  hypothetical protein  25.76 
 
 		 486 aa  101  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.475897  normal  0.189398 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0291  hypothetical protein  24.78 
 
 		 538 aa  96.3  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0567  hypothetical protein  27.98 
 
 		 438 aa  87.4  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.602713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0755  ATPase  23.84 
 
 		 520 aa  85.1  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4266  hypothetical protein  26.03 
 
 		 529 aa  82.8  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0757  hypothetical protein  28.9 
 
 		 436 aa  79.7  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0113754  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2743  hypothetical protein  22.19 
 
 		 494 aa  73.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128363  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0572  hypothetical protein  25.54 
 
 		 504 aa  70.1  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3071  hypothetical protein  32.8 
 
 		 502 aa  68.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0006  hypothetical protein  23.53 
 
 		 497 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0934  ATPase  21.34 
 
 		 486 aa  67  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  hitchhiker  0.0000000256881 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0595  hypothetical protein  26.7 
 
 		 629 aa  66.6  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2087  hypothetical protein  27.98 
 
 		 500 aa  56.2  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.777544  normal  0.0799361 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0277  hypothetical protein  29.73 
 
 		 483 aa  55.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1321  hypothetical protein  24.24 
 
 		 528 aa  53.9  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00204071  unclonable  0.0000165745 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0306  hypothetical protein  27.84 
 
 		 608 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0018054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8689  hypothetical protein  23.57 
 
 		 663 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1413  hypothetical protein  26.42 
 
 		 780 aa  45.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal  0.0265607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>