23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0306 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007410  Ava_B0306  hypothetical protein  100 
 
 		 608 aa  1260    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0018054  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0595  hypothetical protein  41.45 
 
 		 629 aa  454  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8689  hypothetical protein  33.13 
 
 		 663 aa  273  8.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0006  hypothetical protein  30.52 
 
 		 497 aa  94  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3071  hypothetical protein  28.35 
 
 		 502 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2368  hypothetical protein  28.5 
 
 		 486 aa  80.5  0.00000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.475897  normal  0.189398 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0277  hypothetical protein  31.68 
 
 		 483 aa  77  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0757  hypothetical protein  30.59 
 
 		 436 aa  77  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0113754  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0934  ATPase  26.11 
 
 		 486 aa  71.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  hitchhiker  0.0000000256881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4266  hypothetical protein  32.95 
 
 		 529 aa  71.2  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0755  ATPase  29.91 
 
 		 520 aa  71.2  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4751  hypothetical protein  27.54 
 
 		 537 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177586  normal  0.857198 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4618  hypothetical protein  26.85 
 
 		 509 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0329503  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0291  hypothetical protein  26.59 
 
 		 538 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2743  hypothetical protein  28.98 
 
 		 494 aa  62.4  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128363  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0567  hypothetical protein  26.61 
 
 		 438 aa  59.7  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.602713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0743  hypothetical protein  27.84 
 
 		 575 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00289763  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2478  hypothetical protein  25.64 
 
 		 566 aa  47.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000510929  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2145  DNA mismatch repair protein MutL  35.44 
 
 		 612 aa  47.8  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000372508  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0821  DNA mismatch repair protein MutL  24.38 
 
 		 630 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000117941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  23.27 
 
 		 617 aa  45.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  25.47 
 
 		 629 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0572  hypothetical protein  27.74 
 
 		 504 aa  44.7  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>