296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3387 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5294  heat shock protein 90  66.1 
 
 
636 aa  875    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117014  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2743  heat shock protein Hsp90  60.28 
 
 
677 aa  777    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2657  heat shock protein 90  73.2 
 
 
636 aa  973    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0502417  hitchhiker  0.00031577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2392  heat shock protein 90  63.44 
 
 
646 aa  835    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393625  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2474  heat shock protein 90  72.73 
 
 
636 aa  952    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0369006  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12322  heat shock protein 90  65.54 
 
 
647 aa  870    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0243  heat shock protein 90  74.46 
 
 
650 aa  989    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5377  Heat shock protein Hsp90-like protein  51.58 
 
 
657 aa  659    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4650  heat shock protein 90  65.94 
 
 
651 aa  877    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865896  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3387  heat shock protein 90  100 
 
 
643 aa  1315    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20340  heat shock protein 90  65.47 
 
 
644 aa  851    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1817  heat shock protein 90  64.3 
 
 
651 aa  860    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290243  normal  0.0459301 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3701  Heat shock protein Hsp90-like protein  56.55 
 
 
640 aa  716    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93558  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4676  heat shock protein 90  61.82 
 
 
657 aa  788    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2143  heat shock protein 90  49.14 
 
 
644 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000328119  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2214  heat shock protein 90  46.56 
 
 
642 aa  605  1.0000000000000001e-171  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000258546  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1375  heat shock protein 90  47.89 
 
 
645 aa  599  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000122327  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2390  heat shock protein 90  48.59 
 
 
650 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2414  heat shock protein 90  46.25 
 
 
644 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1728  heat shock protein 90  47.51 
 
 
645 aa  579  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000167687  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2498  heat shock protein 90  48.12 
 
 
650 aa  581  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000559019  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1109  heat shock protein 90  47.96 
 
 
639 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0873  heat shock protein 90  47.98 
 
 
628 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000721641  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1017  heat shock protein 90  47.98 
 
 
628 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000769643  normal  0.045663 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1803  heat shock protein 90  46.56 
 
 
644 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0102063 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1694  heat shock protein 90  46.41 
 
 
642 aa  568  1e-160  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000812409  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1718  heat shock protein 90  47.51 
 
 
634 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2099  heat shock protein 90  45.4 
 
 
635 aa  560  1e-158  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130933  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1127  heat shock protein 90  45.78 
 
 
636 aa  556  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618251  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1078  heat shock protein 90  48.3 
 
 
633 aa  558  1e-157  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0117405  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3329  heat shock protein 90  46.57 
 
 
634 aa  557  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1216  heat shock protein 90  46.57 
 
 
632 aa  551  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1947  heat shock protein 90  46.26 
 
 
632 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.76829  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1323  heat shock protein 90  44.76 
 
 
623 aa  547  1e-154  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1320  heat shock protein 90  44.6 
 
 
623 aa  548  1e-154  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0859  heat shock protein 90  46.26 
 
 
632 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1167  heat shock protein 90  46.11 
 
 
632 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1318  heat shock protein 90  46.26 
 
 
632 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.443077  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2113  heat shock protein 90  45.94 
 
 
630 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1158  heat shock protein 90  46.26 
 
 
632 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.789148  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0955  heat shock protein 90  46.42 
 
 
632 aa  548  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464007  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0289  heat shock protein 90  46.26 
 
 
632 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1005  heat shock protein 90  46.26 
 
 
632 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.406773  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0932  heat shock protein 90  46.24 
 
 
632 aa  544  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294237  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0848  heat shock protein 90  45.98 
 
 
634 aa  543  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.846275  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0953  heat shock protein 90  45.97 
 
 
624 aa  543  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298384  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5686  heat shock protein 90  46.57 
 
 
632 aa  545  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2263  heat shock protein 90  46.26 
 
 
632 aa  544  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1735  heat shock protein 90  46.57 
 
 
632 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2347  heat shock protein 90  46.57 
 
 
632 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.75134  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1054  heat shock protein 90  45.34 
 
 
630 aa  543  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374422  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2368  heat shock protein 90  46.57 
 
 
632 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231362  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0592  heat shock protein 90  45.66 
 
 
624 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0548  heat shock protein 90  45.81 
 
 
624 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0532  heat shock protein 90  45.81 
 
 
624 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3502  heat shock protein 90  45.13 
 
 
634 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.791518  normal  0.824555 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0532  heat shock protein 90  45.66 
 
 
624 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0450  heat shock protein 90  44.98 
 
 
626 aa  539  9.999999999999999e-153  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2383  heat shock protein 90  45.79 
 
 
632 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43850  heat shock protein 90  45.44 
 
 
634 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0538  heat shock protein 90  45.81 
 
 
624 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.132733  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00424  heat shock protein 90  45.66 
 
 
624 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.318011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3137  heat shock protein Hsp90  45.66 
 
 
624 aa  536  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145833  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4179  heat shock protein 90  45.13 
 
 
634 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.745481  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3143  heat shock protein 90  45.66 
 
 
624 aa  536  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00327164  normal  0.0320085 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3036  heat shock protein 90  45.74 
 
 
629 aa  535  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0405  heat shock protein 90  45.66 
 
 
624 aa  536  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.103102  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2017  heat shock protein 90  44.81 
 
 
637 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0516  heat shock protein 90  45.66 
 
 
624 aa  536  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117874  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0416  heat shock protein 90  45.09 
 
 
633 aa  536  1e-151  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000647765  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0564  heat shock protein 90  45.66 
 
 
624 aa  536  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0215188  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3232  heat shock protein 90  46.21 
 
 
629 aa  536  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0881904  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1689  heat shock protein 90  45.6 
 
 
634 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.05546  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0511  heat shock protein 90  45.66 
 
 
624 aa  536  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00679401  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1592  heat shock protein 90  45.17 
 
 
633 aa  538  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2491  heat shock protein 90  45.75 
 
 
634 aa  538  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0435  ATP-binding region ATPase domain protein  46.77 
 
 
640 aa  536  1e-151  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1079  heat shock protein 90  45.89 
 
 
629 aa  536  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0217188  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0860  heat shock protein Hsp90  46.21 
 
 
628 aa  536  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00429  hypothetical protein  45.66 
 
 
624 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.304335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0550  heat shock protein 90  45.66 
 
 
624 aa  536  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0208648  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1372  heat shock protein 90  45.98 
 
 
647 aa  536  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145654  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2208  heat shock protein HtpG  44.34 
 
 
635 aa  532  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2342  heat shock protein 90  44.55 
 
 
633 aa  535  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3195  heat shock protein 90  44.94 
 
 
624 aa  532  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228822  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1625  heat shock protein 90  43.99 
 
 
634 aa  534  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1771  heat shock protein 90  44.93 
 
 
633 aa  535  1e-150  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000171528  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2497  heat shock protein 90  44.29 
 
 
632 aa  534  1e-150  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.558694  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2893  heat shock protein 90  44.94 
 
 
624 aa  532  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.661781  normal  0.181179 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1086  heat shock protein 90  41.71 
 
 
623 aa  530  1e-149  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1609  heat shock protein 90  43.8 
 
 
630 aa  529  1e-149  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3750  heat shock protein 90  44.97 
 
 
634 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0814  heat shock protein 90  43.96 
 
 
632 aa  531  1e-149  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3678  heat shock protein 90  44.97 
 
 
634 aa  531  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3158  heat shock protein HtpG  45.44 
 
 
629 aa  531  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.705865  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2506  heat shock protein 90  44.46 
 
 
633 aa  531  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595688  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1022  heat shock protein 90  45.97 
 
 
629 aa  531  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3055  heat shock protein 90  44.94 
 
 
622 aa  531  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0920  heat shock protein 90  44.26 
 
 
643 aa  528  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2755  heat shock protein Hsp90  45.44 
 
 
629 aa  531  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613989  hitchhiker  0.00227659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>