More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0923 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0923  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 516 aa  1036    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0901  DNA mismatch repair protein MutL  94.77 
 
 		 516 aa  989    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1711  DNA mismatch repair protein MutL  35.78 
 
 		 588 aa  327  3e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.619498  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0769  DNA mismatch repair protein MutL  35.79 
 
 		 551 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  33.99 
 
 		 559 aa  292  1e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0599  DNA mismatch repair protein MutL  44.82 
 
 		 621 aa  265  2e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0798741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  30.31 
 
 		 607 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  29.77 
 
 		 608 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  29.72 
 
 		 597 aa  250  5e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  41.23 
 
 		 628 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  32.92 
 
 		 572 aa  248  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  30.23 
 
 		 597 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  38.71 
 
 		 647 aa  246  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  30.18 
 
 		 622 aa  246  6e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  40.95 
 
 		 605 aa  246  6e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  38.62 
 
 		 650 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  36.93 
 
 		 628 aa  243  6e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  32.46 
 
 		 565 aa  242  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  29.36 
 
 		 613 aa  242  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  39.09 
 
 		 602 aa  241  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  29.48 
 
 		 595 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0293  DNA mismatch repair protein MutL  33.33 
 
 		 532 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  30.4 
 
 		 611 aa  240  5e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  29.62 
 
 		 602 aa  240  5e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  39.64 
 
 		 606 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  30.15 
 
 		 589 aa  237  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1087  DNA mismatch repair protein MutL  30.64 
 
 		 582 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0917186  normal  0.0241297 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  28.67 
 
 		 595 aa  235  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  28.67 
 
 		 595 aa  235  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  39.7 
 
 		 608 aa  234  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  39.08 
 
 		 640 aa  233  5e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  30 
 
 		 623 aa  232  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  31.9 
 
 		 560 aa  231  3e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  30.49 
 
 		 575 aa  230  5e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  39.2 
 
 		 624 aa  230  6e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1478  DNA mismatch repair protein MutL  32.27 
 
 		 557 aa  230  6e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.064699  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  30.54 
 
 		 574 aa  229  1e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  40.57 
 
 		 603 aa  229  1e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0376  DNA mismatch repair protein MutL  40 
 
 		 709 aa  229  1e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.13305  normal  0.32452 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  37.65 
 
 		 607 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  37.04 
 
 		 610 aa  227  3e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  38.39 
 
 		 626 aa  227  4e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  28.36 
 
 		 599 aa  227  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1919  DNA mismatch repair protein MutL  39.47 
 
 		 670 aa  227  5.0000000000000005e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.770906  hitchhiker  0.00107591 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  29.4 
 
 		 589 aa  226  7e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  29.83 
 
 		 608 aa  225  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1838  DNA mismatch repair protein MutL  36.76 
 
 		 692 aa  225  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0019765  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  31.22 
 
 		 566 aa  225  2e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1083  DNA mismatch repair protein  39.87 
 
 		 615 aa  224  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0023  DNA mismatch repair protein MutL  38.42 
 
 		 621 aa  224  4e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000493473  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3217  DNA mismatch repair protein MutL  38.79 
 
 		 762 aa  223  4.9999999999999996e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0687703 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  37.28 
 
 		 647 aa  223  6e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  38.96 
 
 		 616 aa  223  6e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  37.96 
 
 		 635 aa  223  7e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  35.42 
 
 		 629 aa  223  8e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  38.85 
 
 		 628 aa  223  9e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  31.1 
 
 		 566 aa  222  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  30.92 
 
 		 566 aa  222  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  38.04 
 
 		 628 aa  222  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  36.99 
 
 		 636 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  36.29 
 
 		 603 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  28.43 
 
 		 632 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  28.29 
 
 		 612 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  28.45 
 
 		 616 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  29.55 
 
 		 585 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3240  DNA mismatch repair protein MutL  39.23 
 
 		 628 aa  220  6e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  36.07 
 
 		 603 aa  219  8.999999999999998e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0211  DNA mismatch repair protein MutL  36.62 
 
 		 644 aa  219  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  35.34 
 
 		 601 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  36.14 
 
 		 644 aa  218  2e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  35.95 
 
 		 632 aa  218  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_002950  PG0412  DNA mismatch repair protein MutL  36.92 
 
 		 618 aa  218  2.9999999999999998e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2754  DNA mismatch repair protein  38.04 
 
 		 634 aa  218  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  36.1 
 
 		 661 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  37.54 
 
 		 644 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1041  DNA mismatch repair protein MutL  38.94 
 
 		 606 aa  217  4e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  38.72 
 
 		 625 aa  217  5e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  36.02 
 
 		 661 aa  217  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  29.73 
 
 		 610 aa  217  5e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  36.02 
 
 		 661 aa  217  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  34.66 
 
 		 623 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5569  DNA mismatch repair protein MutL  36.01 
 
 		 685 aa  216  7e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.590077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  38.46 
 
 		 692 aa  216  9e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  38.82 
 
 		 629 aa  216  9.999999999999999e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  36.31 
 
 		 617 aa  214  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  35.38 
 
 		 626 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  36.68 
 
 		 691 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  39.49 
 
 		 620 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  37.04 
 
 		 667 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0734  DNA mismatch repair protein  37.04 
 
 		 667 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  37.04 
 
 		 667 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  28.36 
 
 		 606 aa  213  4.9999999999999996e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  37.04 
 
 		 624 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1729  DNA mismatch repair protein MutL  38.81 
 
 		 763 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  37.23 
 
 		 652 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  37.04 
 
 		 705 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  37.35 
 
 		 662 aa  212  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0949  DNA mismatch repair protein MutL  35.76 
 
 		 611 aa  211  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  37.76 
 
 		 620 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  29.35 
 
 		 584 aa  212  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>