290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0413 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_13490  heat shock protein 90  53.88 
 
 
632 aa  708    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0417  heat shock protein 90  99.84 
 
 
623 aa  1249    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0746567  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0413  heat shock protein 90  100 
 
 
623 aa  1251    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01030  heat shock protein 90  52.5 
 
 
641 aa  675    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.790328  normal  0.138167 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0856  heat shock protein 90  66.61 
 
 
627 aa  868    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.585619 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0192  heat shock protein 90  52.95 
 
 
646 aa  687    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0401  heat shock protein 90  51.71 
 
 
617 aa  600  1e-170  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1086  heat shock protein 90  46.21 
 
 
623 aa  523  1e-147  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2338  ATP-binding region ATPase domain protein  43.17 
 
 
638 aa  514  1e-144  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.268084  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2414  heat shock protein 90  42.59 
 
 
644 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1803  heat shock protein 90  43.37 
 
 
644 aa  489  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0102063 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2143  heat shock protein 90  41.9 
 
 
644 aa  491  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000328119  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2390  heat shock protein 90  41.84 
 
 
650 aa  485  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1728  heat shock protein 90  42.52 
 
 
645 aa  481  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000167687  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2214  heat shock protein 90  40.16 
 
 
642 aa  473  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000258546  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1375  heat shock protein 90  40.19 
 
 
645 aa  472  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000122327  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2498  heat shock protein 90  40.9 
 
 
650 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000559019  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0873  heat shock protein 90  40.95 
 
 
628 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000721641  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1017  heat shock protein 90  40.95 
 
 
628 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000769643  normal  0.045663 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5377  Heat shock protein Hsp90-like protein  38.84 
 
 
657 aa  459  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1078  heat shock protein 90  39.78 
 
 
633 aa  452  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0117405  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2007  heat shock protein 90  40.81 
 
 
652 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1609  heat shock protein 90  39.87 
 
 
630 aa  445  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4650  heat shock protein 90  36.42 
 
 
651 aa  444  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865896  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12322  heat shock protein 90  36.75 
 
 
647 aa  442  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1817  heat shock protein 90  36.58 
 
 
651 aa  443  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290243  normal  0.0459301 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1372  heat shock protein 90  40.09 
 
 
647 aa  441  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145654  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5294  heat shock protein 90  35.87 
 
 
636 aa  442  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117014  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1592  heat shock protein 90  39.31 
 
 
633 aa  439  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2370  heat shock protein 90  39.03 
 
 
642 aa  436  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0508031  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3195  heat shock protein 90  38.99 
 
 
624 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228822  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3055  heat shock protein 90  38.99 
 
 
622 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3701  Heat shock protein Hsp90-like protein  37.87 
 
 
640 aa  437  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93558  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2893  heat shock protein 90  38.99 
 
 
624 aa  436  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.661781  normal  0.181179 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3329  heat shock protein 90  39 
 
 
634 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20340  heat shock protein 90  36.39 
 
 
644 aa  437  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1216  heat shock protein 90  39.25 
 
 
632 aa  433  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2232  heat shock protein 90  39.16 
 
 
639 aa  434  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000100055  hitchhiker  0.000273756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3387  heat shock protein 90  34.87 
 
 
643 aa  432  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1526  heat shock protein 90  39.38 
 
 
638 aa  435  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00178213  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3232  heat shock protein 90  38.43 
 
 
629 aa  430  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0881904  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0848  heat shock protein 90  39.91 
 
 
634 aa  431  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.846275  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2657  heat shock protein 90  35.56 
 
 
636 aa  431  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0502417  hitchhiker  0.00031577 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2849  heat shock protein 90  38.69 
 
 
638 aa  431  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000520054  decreased coverage  0.00000000518986 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0243  heat shock protein 90  36.93 
 
 
650 aa  429  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1428  heat shock protein 90  39.21 
 
 
637 aa  429  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000680402  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2263  heat shock protein 90  39.31 
 
 
632 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2113  heat shock protein 90  39.31 
 
 
630 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2491  heat shock protein 90  39.56 
 
 
634 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1127  heat shock protein 90  38.99 
 
 
636 aa  426  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618251  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5686  heat shock protein 90  39.16 
 
 
632 aa  428  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3502  heat shock protein 90  38.86 
 
 
634 aa  429  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.791518  normal  0.824555 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2474  heat shock protein 90  35.56 
 
 
636 aa  428  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0369006  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2497  heat shock protein 90  38.57 
 
 
632 aa  428  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.558694  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0932  heat shock protein 90  39.5 
 
 
632 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294237  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1796  heat shock protein 90  39.06 
 
 
638 aa  426  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000064656  unclonable  0.0000000164624 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1735  heat shock protein 90  39.16 
 
 
632 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1079  heat shock protein 90  37.95 
 
 
629 aa  428  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0217188  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2347  heat shock protein 90  39.16 
 
 
632 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.75134  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1320  heat shock protein 90  39.11 
 
 
623 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2017  heat shock protein 90  38.45 
 
 
637 aa  425  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1407  Heat shock protein Hsp90-like protein  41.2 
 
 
623 aa  422  1e-117  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0416  heat shock protein 90  38.99 
 
 
633 aa  424  1e-117  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000647765  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0072  heat shock protein 90  35.73 
 
 
626 aa  424  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2099  heat shock protein 90  38.62 
 
 
635 aa  425  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130933  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0920  heat shock protein 90  38.43 
 
 
643 aa  425  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2383  heat shock protein 90  39 
 
 
632 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43850  heat shock protein 90  38.92 
 
 
634 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0851  heat shock protein 90  38.43 
 
 
643 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415809  normal  0.667015 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1771  heat shock protein 90  38.99 
 
 
633 aa  425  1e-117  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000171528  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2368  heat shock protein 90  39 
 
 
632 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231362  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1689  heat shock protein 90  38.13 
 
 
634 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.05546  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5467  heat shock protein 90  36.73 
 
 
610 aa  420  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.306325  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0990  heat shock protein 90  37.81 
 
 
640 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0890084  normal  0.343937 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2208  heat shock protein HtpG  37.97 
 
 
635 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1323  heat shock protein 90  38.79 
 
 
623 aa  421  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2755  heat shock protein Hsp90  37.58 
 
 
629 aa  421  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613989  hitchhiker  0.00227659 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0814  heat shock protein 90  38.99 
 
 
632 aa  421  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01104  heat shock protein 90  39.81 
 
 
640 aa  420  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.436583  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0958  heat shock protein 90  40 
 
 
617 aa  421  1e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3158  heat shock protein HtpG  37.58 
 
 
629 aa  421  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.705865  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4179  heat shock protein 90  37.97 
 
 
634 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.745481  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0289  heat shock protein 90  37.36 
 
 
632 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1947  heat shock protein 90  37.36 
 
 
632 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.76829  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0859  heat shock protein 90  37.36 
 
 
632 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3750  heat shock protein 90  38.07 
 
 
634 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0860  heat shock protein Hsp90  36.79 
 
 
628 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1158  heat shock protein 90  37.21 
 
 
632 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.789148  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1318  heat shock protein 90  37.36 
 
 
632 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.443077  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1625  heat shock protein 90  37.82 
 
 
634 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2743  heat shock protein Hsp90  35.43 
 
 
677 aa  418  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1167  heat shock protein 90  37.21 
 
 
632 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19170  heat shock protein 90  37.91 
 
 
635 aa  416  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000174366  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0955  heat shock protein 90  37.52 
 
 
632 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464007  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0614  heat shock protein 90  38.36 
 
 
626 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00438217  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3678  heat shock protein 90  39.24 
 
 
634 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1022  heat shock protein 90  37.32 
 
 
629 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1694  heat shock protein 90  39.04 
 
 
642 aa  419  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000812409  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1005  heat shock protein 90  37.36 
 
 
632 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.406773  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0511  heat shock protein 90  38.62 
 
 
624 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00679401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>